Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01257
• Subject: XM_011509668.2
• Aligned Length: 1637
• Identities: 1357
• Gaps: 256

Alignment

Query    1  ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCATCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCATCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCC  74

Query   75  CTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGTGAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGTGAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTA  148

Query  149  ATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAATTAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCT-  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  149  ATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAATTAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTG  222

Query  222  --------------GGTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGC  281
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCATGTGGAGAGCAGGTTTCTGAGCTTGGCTTGGATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGC  296

Query  282  CCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTT  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTGCATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTT  370

Query  356  CACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGAT  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGGGCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGAT  444

Query  430  GAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCG  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTGGACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCG  518

Query  504  TGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAA  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGCATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAA  592

Query  578  CCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGC  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGGGGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGC  666

Query  652  CAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAAC  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCACTTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAAC  740

Query  726  CCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGC  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGAGGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGC  814

Query  800  GCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTC  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGAGGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTC  888

Query  874  AGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGT  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGGCTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGT  962

Query  948  GGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATC  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCTGTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATC  1036

Query 1022  CAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTG  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGCTTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTG  1110

Query 1096  ACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCA  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACACTGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCA  1184

Query 1170  ACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTAC  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTAGGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTAC  1258

Query 1244  ACAAGAACTGCATTCC-----CCAGT----------ATACACT------AGGTC-----ACTGGCAAAAACTA-  1290
            ||||||        ||     |||||          |.|.|.|      |||.|     |.||||     ||| 
Sbjct 1259  ACAAGA--------CCAAGAACCAGTTGAAGTGGCGACAGAGTCATGACAGGACCGTGGAGTGGC-----CTAA  1319

Query 1291  -GAGT---CAG------CTAGGCAA----------------TTCCTG-------------ACTGCTCA----CA  1321
             ||||   |||      .||||.||                |||.||             |||.||||    ||
Sbjct 1320  GGAGTACCCAGGGCGAAGTAGGAAACAGGCTCCTTCTATTCTTCATGTGCCTGGGTGCCAACTCCTCAGGTGCA  1393

Query 1322  GGTTGCCCCTGAC--TCTGGCTGGAGCCTCCTATGAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCG--  1391
            ||  |.||.||||  .||||..|..||||||                                |.||.|.||  
Sbjct 1394  GG--GACCGTGACCACCTGGGGGCTGCCTCC--------------------------------GTGTCGACGCA  1433

Query 1392  ---CCAG-GCAGCA------GTCAGTGT-----CCTG--GGCACAG--AACCTAACAGC---------------  1431
               |||| ||| ||      |||  |.|     ||||  |.|||.|  |.||.||||||               
Sbjct 1434  TTCCCAGCGCA-CATACCTGGTC--TTTTGCTGCCTGTCGTCACCGCCACCCCAACAGCCGGGCAGGCATCGCT  1504

Query 1432  --------------------------------------------------------------------------  1431
                                                                                      
Sbjct 1505  GCCGCCATCTTGGAAGCGGGCGCTGCGGGGGCGGGGTCTCGCGTCATGGGGCGGGGCCTCGGGGCGGAGCCACC  1578

Query 1432  ---------  1431
                     
Sbjct 1579  CGGGCTGAC  1587