Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01257
- Subject:
- XM_011509670.2
- Aligned Length:
- 1751
- Identities:
- 1238
- Gaps:
- 484
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAGCCGCCTCCCCGTGGACTGGCCTTAAGTGTCCCTATCTATTCTCCCTACGACCAAAGCTCCTGCGGCCT 74
Query 1 ----------------------------------------ATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCCCTCTAGGGTTGTCACCCTAGCTGGACCTGGTTTCCGCATGGGCCGGACCGTGGTCGTGCTGGGCGGAGGCA 148
Query 35 TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAGCGGCTTGGCCGCCAGTTACCACCTGAGCCGGGCCCCCTGCCCCCCTAAGGTGGTCCTAGTGGAGAGCAGT 222
Query 109 GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGCGTCTGGGAGGCTGGATTCGCTCCGTTCGAGGCCCTAATGGTGCTATCTTTGAGCTTGGACCTCGGGGAAT 296
Query 183 TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCT---------------GGTTTCTGAGCTTGGCTTGG 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAGGCCAGCGGGAGCCCTAGGGGCCCGGACCTTGCTCCTGGCATGTGGAGAGCAGGTTTCTGAGCTTGGCTTGG 370
Query 242 ATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTG 315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTCAGAAGTGCTGCCTGTCCGGGGAGACCACCCAGCTGCCCAGAACAGGTTCCTCTACGTGGGCGGTGCCCTG 444
Query 316 CATGCCCTACCCACTGGCCTCAGGGGGCTACTCCGCCCTTCACCCCCCTTCTCCAAACCTCTGTTTTGGGCTGG 389
|||||||||||||||||||||| |..|||.|| |||||
Sbjct 445 CATGCCCTACCCACTGGCCTCA--GTCCTAGTC------TCACC------------------------------ 480
Query 390 GCTGAGGGAGCTGACCAAGCCCCGGGGCAAAGAGCCTGATGAGACTGTGCACAGTTTTGCCCAGCGCCGCCTTG 463
Sbjct 481 -------------------------------------------------------------------------- 480
Query 464 GACCTGAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGC 537
|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 --CTTAAGGTGGCGTCTCTAGCCATGGACAGTCTCTGCCGTGGAGTGTTTGCAGGCAACAGCCGTGAGCTCAGC 552
Query 538 ATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGG 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 ATCAGGTCCTGCTTTCCCAGTCTCTTCCAAGCTGAGCAAACCCATCGTTCCATATTACTGGGCCTGCTGCTGGG 626
Query 612 GGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCAC 685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 GGCAGGGCGGACCCCACAGCCAGACTCAGCACTCATTCGCCAGGCCTTGGCTGAGCGCTGGAGCCAGTGGTCAC 700
Query 686 TTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGA 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 TTCGTGGAGGTCTAGAGATGTTGCCTCAGGCCCTTGAAACCCACCTGACTAGTAGGGGGGTCAGTGTTCTCAGA 774
Query 760 GGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGA 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 GGCCAGCCGGTCTGTGGGCTCAGCCTCCAGGCAGAAGGGCGCTGGAAGGTATCTCTAAGGGACAGCAGTCTGGA 848
Query 834 GGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGG 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 GGCTGACCACGTTATTAGTGCCATTCCAGCTTCAGTGCTCAGTGAGCTGCTCCCTGCTGAGGCTGCCCCTCTGG 922
Query 908 CTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCT 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 923 CTCGTGCCCTGAGTGCCATCACTGCAGTGTCTGTAGCTGTGGTGAATCTGCAGTACCAAGGAGCCCATCTGCCT 996
Query 982 GTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGC 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 GTCCAGGGATTTGGACATTTGGTGCCATCTTCAGAAGATCCAGGAGTCCTGGGAATCGTGTATGACTCAGTTGC 1070
Query 1056 TTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACAC 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 TTTCCCTGAGCAGGACGGGAGCCCCCCTGGCCTCAGAGTGACTGTGATGCTGGGAGGTTCCTGGTTACAGACAC 1144
Query 1130 TGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTA 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145 TGGAGGCTAGTGGCTGTGTCTTATCTCAGGAGCTGTTTCAACAGCGGGCCCAGGAAGCAGCTGCTACACAATTA 1218
Query 1204 GGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGAACTGCATTCC-----CCAGT-------- 1264
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 1219 GGACTGAAGGAGATGCCGAGCCACTGCTTGGTCCATCTACACAAGA--------CCAAGAACCAGTTGAAGTGG 1284
Query 1265 --ATACACT------AGGTC-----ACTGGCAAAAACTA--GAGT---CAG------CTAGGCAA--------- 1305
|.|.|.| |||.| |.|||| ||| |||| ||| .||||.||
Sbjct 1285 CGACAGAGTCATGACAGGACCGTGGAGTGGC-----CTAAGGAGTACCCAGGGCGAAGTAGGAAACAGGCTCCT 1353
Query 1306 -------TTCCTG-------------ACTGCTCA----CAGGTTGCCCCTGAC--TCTGGCTGGAGCCTCCTAT 1353
|||.|| |||.|||| |||| |.||.|||| .||||..|..||||||
Sbjct 1354 TCTATTCTTCATGTGCCTGGGTGCCAACTCCTCAGGTGCAGG--GACCGTGACCACCTGGGGGCTGCCTCC--- 1422
Query 1354 GAGGGAGTTGCTGTTAATGACTGTATAGAGAGTGGGCG-----CCAG-GCAGCA------GTCAGTGT-----C 1410
|.||.|.|| |||| ||| || ||| |.| |
Sbjct 1423 -----------------------------GTGTCGACGCATTCCCAGCGCA-CATACCTGGTC--TTTTGCTGC 1464
Query 1411 CTG--GGCACAG--AACCTAACAGC------------------------------------------------- 1431
||| |.|||.| |.||.||||||
Sbjct 1465 CTGTCGTCACCGCCACCCCAACAGCCGGGCAGGCATCGCTGCCGCCATCTTGGAAGCGGGCGCTGCGGGGGCGG 1538
Query 1432 ------------------------------------------------- 1431
Sbjct 1539 GGTCTCGCGTCATGGGGCGGGGCCTCGGGGCGGAGCCACCCGGGCTGAC 1587