Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01275
• Subject: NM_000946.3
• Aligned Length: 1260
• Identities: 1260
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGACGTTTGACCCCACCGAGCTGCCCGAGCTGCTTAAACTTTATTACCGGAGGCTCTTTCCCTACTCTCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGACGTTTGACCCCACCGAGCTGCCCGAGCTGCTTAAACTTTATTACCGGAGGCTCTTTCCCTACTCTCA  74

Query   75  GTACTATCGCTGGCTCAACTACGGTGGAGTGATAAAGAATTACTTTCAACACCGTGAATTTTCATTCACATTGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTACTATCGCTGGCTCAACTACGGTGGAGTGATAAAGAATTACTTTCAACACCGTGAATTTTCATTCACATTGA  148

Query  149  AAGATGATATTTACATTCGCTACCAATCCTTCAACAACCAGAGTGATCTGGAAAAGGAGATGCAGAAAATGAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGATGATATTTACATTCGCTACCAATCCTTCAACAACCAGAGTGATCTGGAAAAGGAGATGCAGAAAATGAAT  222

Query  223  CCATACAAGATTGATATAGGCGCAGTATATTCTCACAGACCCAATCAACACAATACAGTGAAGCTGGGAGCTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCATACAAGATTGATATAGGCGCAGTATATTCTCACAGACCCAATCAACACAATACAGTGAAGCTGGGAGCTTT  296

Query  297  CCAGGCTCAGGAAAAAGAACTGGTATTTGACATTGACATGACAGACTATGACGATGTGAGGAGATGTTGTAGTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGGCTCAGGAAAAAGAACTGGTATTTGACATTGACATGACAGACTATGACGATGTGAGGAGATGTTGTAGTT  370

Query  371  CTGCAGACATATGTCCTAAGTGCTGGACCCTCATGACAATGGCCATACGCATCATTGACAGAGCATTGAAGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGCAGACATATGTCCTAAGTGCTGGACCCTCATGACAATGGCCATACGCATCATTGACAGAGCATTGAAGGAG  444

Query  445  GACTTTGGATTTAAGCATCGTCTCTGGGTATATTCTGGAAGGAGAGGTGTTCATTGTTGGGTCTGTGATGAATC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTTGGATTTAAGCATCGTCTCTGGGTATATTCTGGAAGGAGAGGTGTTCATTGTTGGGTCTGTGATGAATC  518

Query  519  AGTTAGAAAACTGTCTTCTGCAGTACGTTCTGGGATAGTTGAGTATTTGAGCCTTGTAAAGGGTGGTCAAGACG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTTAGAAAACTGTCTTCTGCAGTACGTTCTGGGATAGTTGAGTATTTGAGCCTTGTAAAGGGTGGTCAAGACG  592

Query  593  TTAAAAAGAAAGTTCACCTAAGTGAAAAAATTCACCCTTTTATCAGAAAATCTATAAACATAATAAAAAAATAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTAAAAAGAAAGTTCACCTAAGTGAAAAAATTCACCCTTTTATCAGAAAATCTATAAACATAATAAAAAAATAC  666

Query  667  TTTGAAGAATATGCCTTGGTTAATCAAGATATTCTCGAAAATAAAGAAAGCTGGGATAAGATTTTAGCCCTTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGAAGAATATGCCTTGGTTAATCAAGATATTCTCGAAAATAAAGAAAGCTGGGATAAGATTTTAGCCCTTGT  740

Query  741  TCCTGAAACAATTCATGATGAACTTCAACAAAGCTTCCAAAAGTCTCACAATTCACTTCAGCGTTGGGAGCACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTGAAACAATTCATGATGAACTTCAACAAAGCTTCCAAAAGTCTCACAATTCACTTCAGCGTTGGGAGCACT  814

Query  815  TGAAGAAAGTAGCCAGCAGATATCAGAATAACATCAAAAATGACAAATATGGACCCTGGCTGGAGTGGGAGATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAAGAAAGTAGCCAGCAGATATCAGAATAACATCAAAAATGACAAATATGGACCCTGGCTGGAGTGGGAGATT  888

Query  889  ATGCTCCAGTACTGTTTTCCACGGCTGGATATCAATGTCAGCAAAGGAATCAATCATCTACTGAAGAGCCCTTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGCTCCAGTACTGTTTTCCACGGCTGGATATCAATGTCAGCAAAGGAATCAATCATCTACTGAAGAGCCCTTT  962

Query  963  TAGTGTTCATCCTAAAACAGGTCGCATATCTGTGCCTATTGATTTGCAGAAAGTGGACCAGTTTGATCCATTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAGTGTTCATCCTAAAACAGGTCGCATATCTGTGCCTATTGATTTGCAGAAAGTGGACCAGTTTGATCCATTTA  1036

Query 1037  CTGTTCCGACCATAAGCTTCATCTGCCGTGAATTGGATGCCATTTCCACTAATGAAGAGGAAAAAGAGGAGAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGTTCCGACCATAAGCTTCATCTGCCGTGAATTGGATGCCATTTCCACTAATGAAGAGGAAAAAGAGGAGAAT  1110

Query 1111  GAAGCTGAATCTGATGTCAAACATAGAACCAGAGATTATAAGAAGACCAGTCTAGCACCTTATGTGAAAGTTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAGCTGAATCTGATGTCAAACATAGAACCAGAGATTATAAGAAGACCAGTCTAGCACCTTATGTGAAAGTTTT  1184

Query 1185  TGAACATTTTCTTGAAAATCTGGATAAATCCCGAAAAGGAGAACTTCTTAAGAAGAGTGATTTACAAAAAGATT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAACATTTTCTTGAAAATCTGGATAAATCCCGAAAAGGAGAACTTCTTAAGAAGAGTGATTTACAAAAAGATT  1258

Query 1259  TC  1260
            ||
Sbjct 1259  TC  1260