Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01275
• Subject: NM_008921.2
• Aligned Length: 1260
• Identities: 1100
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGAGACGTTTGACCCCACCGAGCTGCCCGAGCTGCTTAAACTTTATTACCGGAGGCTCTTTCCCTACTCTCA  74
            ||||||.|.|||||.||..|.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||.|.||
Sbjct    1  ATGGAGCCATTTGATCCTGCGGAGCTGCCGGAGCTACTCAAGCTTTATTACCGAAGGCTCTTTCCCTACGCCCA  74

Query   75  GTACTATCGCTGGCTCAACTACGGTGGAGTGATAAAGAATTACTTTCAACACCGTGAATTTTCATTCACATTGA  148
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct   75  GTACTATCGCTGGCTCAACTATGGCGGAGTGACAAAGAATTACTTTCAACACCGTGAATTTTCATTCACACTGA  148

Query  149  AAGATGATATTTACATTCGCTACCAATCCTTCAACAACCAGAGTGATCTGGAAAAGGAGATGCAGAAAATGAAT  222
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGATGATATTTACATTCGCTACCAGTCCTTCAACAACCAGAGTGAACTGGAGAAGGAGATGCAGAAAATGAAT  222

Query  223  CCATACAAGATTGATATAGGCGCAGTATATTCTCACAGACCCAATCAACACAATACAGTGAAGCTGGGAGCTTT  296
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCATATAAGATTGATATAGGCGCAGTATATTCTCACAGACCCAATCAACACAATACAGTGAAGCTGGGAGCTTT  296

Query  297  CCAGGCTCAGGAAAAAGAACTGGTATTTGACATTGACATGACAGACTATGACGATGTGAGGAGATGTTGTAGTT  370
            ||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||||
Sbjct  297  CCAGGCCCAGGAGAAAGAACTGGTCTTTGACATCGACATGACAGACTACGATGACGTAAGGAGATGCTGCAGTT  370

Query  371  CTGCAGACATATGTCCTAAGTGCTGGACCCTCATGACAATGGCCATACGCATCATTGACAGAGCATTGAAGGAG  444
            ||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.|.||||||||||||
Sbjct  371  CTGCAGACATATGTTCCAAATGCTGGACTCTCATGACAATGGCCATGCGCATCATAGACCGGGCATTGAAGGAG  444

Query  445  GACTTTGGATTTAAGCATCGTCTCTGGGTATATTCTGGAAGGAGAGGTGTTCATTGTTGGGTCTGTGATGAATC  518
            |||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTTGGATTTAAGCACCGCCTCTGGGTCTATTCAGGAAGGAGAGGTGTGCACTGTTGGGTCTGTGATGAATC  518

Query  519  AGTTAGAAAACTGTCTTCTGCAGTACGTTCTGGGATAGTTGAGTATTTGAGCCTTGTAAAGGGTGGTCAAGACG  592
            .|||.||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CGTTCGAAAGCTGTCCTCTGCTGTGCGCTCCGGGATCGTGGAGTACTTGAGTCTTGTAAAGGGTGGTCAAGATG  592

Query  593  TTAAAAAGAAAGTTCACCTAAGTGAAAAAATTCACCCTTTTATCAGAAAATCTATAAACATAATAAAAAAATAC  666
            |||||||||||||||||||||.|||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  TTAAAAAGAAAGTTCACCTAAATGAGAAAGTTCACCCTTTTGTCAGAAAATCTATAAACATAATTAAAAAGTAC  666

Query  667  TTTGAAGAATATGCCTTGGTTAATCAAGATATTCTCGAAAATAAAGAAAGCTGGGATAAGATTTTAGCCCTTGT  740
            |||||.|||||||||||.||....|||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGAGGAATATGCCTTAGTCGGCCAAGATATTCTTGAAAATAAAGAAAACTGGGATAAGATTTTAGCCCTTGT  740

Query  741  TCCTGAAACAATTCATGATGAACTTCAACAAAGCTTCCAAAAGTCTCACAATTCACTTCAGCGTTGGGAGCACT  814
            ||||||.||||||||||||||.||.|||..|.|.|||||.||||..||||.|||||.||||||.|||||.|||.
Sbjct  741  TCCTGAGACAATTCATGATGAGCTGCAAAGAGGGTTCCAGAAGTTCCACAGTTCACCTCAGCGCTGGGAACACC  814

Query  815  TGAAGAAAGTAGCCAGCAGATATCAGAATAACATCAAAAATGACAAATATGGACCCTGGCTGGAGTGGGAGATT  888
            |||.||||||.||||.|..||.|||||||   ||.||.||.||.||.|..||.||||||||||||||||||.|.
Sbjct  815  TGAGGAAAGTGGCCAACTCATCTCAGAAT---ATGAAGAACGATAAGTGCGGCCCCTGGCTGGAGTGGGAGGTC  885

Query  889  ATGCTCCAGTACTGTTTTCCACGGCTGGATATCAATGTCAGCAAAGGAATCAATCATCTACTGAAGAGCCCTTT  962
            |||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.||||||||.|||.|||||||..||||||||||||||||
Sbjct  886  ATGCTCCAGTACTGTTTCCCACGCCTGGATGTCAACGTCAGCAAGGGAGTCAATCACTTACTGAAGAGCCCTTT  959

Query  963  TAGTGTTCATCCTAAAACAGGTCGCATATCTGTGCCTATTGATTTGCAGAAAGTGGACCAGTTTGATCCATTTA  1036
            .|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct  960  CAGTGTTCATCCCAAGACAGGTCGGATTTCTGTGCCTATCGATTTTCATAAAGTGGATCAATTTGATCCGTTTA  1033

Query 1037  CTGTTCCGACCATAAGCTTCATCTGCCGTGAATTGGATGCCATTTCCACTAATGAAGAGGAAAAAGAGGAGAAT  1110
            ||||.||.||.|||||...|||||||||.|||||||||....||||||||.||||..|||||||.|||||||||
Sbjct 1034  CTGTCCCAACTATAAGTGCCATCTGCCGGGAATTGGATATGGTTTCCACTCATGAGAAGGAAAAGGAGGAGAAT  1107

Query 1111  GAAGCTGAATCTGATGTCAAACATAGAACCAGAGATTATAAGAAGACCAGTCTAGCACCTTATGTGAAAGTTTT  1184
            ||||||||  |.|    ||||||.|||..|||||.|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1108  GAAGCTGA--CAG----CAAACACAGAGTCAGAGGTTACAAGAAGACCAGTCTAGCACCGTATGTGAAAGTATT  1175

Query 1185  TGAACATTTTCTTGAAAATCTGGATAAATCCCGAAAAGGAGAACTTCTTAAGAAGAGTGATTTACAAAAAGATT  1258
            ||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1176  TGAACAGTTTCTTGAAAACCTGGATAAATCCCGGAAAGGGGAACTTCTCAAGAAGAGCGATTTACAAAAAGATT  1249

Query 1259  TC  1260
            ||
Sbjct 1250  TC  1251