Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01279
• Subject: XM_005269019.4
• Aligned Length: 1214
• Identities: 883
• Gaps: 331

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACCCTCGCCGTCAGCCGGATCCGTGCGGTCCGCGAGGACCCGGGGGAGGGCGGTTACCGAGGCCCGCCACC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCCGGAAGGGTGGGTTCCTTGCCTTCCGCCCCAGTCTGGCGACTGCCATGACGTGGGCGGAAGTGGCGTCGCCG  148

Query    1  -------------------------------------------------------------------------A  1
                                                                                     |
Sbjct  149  CACCGGATGTGGGGCGGGGCCTGCCCCAAGAGAGTTTCCTAAAGCGAGGAAACCAAGCCGGGCGCCTCTTGCAA  222

Query    2  TGGAGACGGTCATTTCTTCAGATAGCTCCCCAGCTGTGGAAAATGAGCATCCTCAAGAGACCCCAGAATCCAAC  75
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  223  TGGAGACGGTCATTTCTTCAGATAGCTCCCCAGCTGTGGAAAATGAGCATCCTCA-------------------  277

Query   76  AATAGCGTGTATACTTCCTTCATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTGATTCCCACAAGCTCCAAATTGGTTGT  149
                                                                                      
Sbjct  278  --------------------------------------------------------------------------  277

Query  150  ATTTGATACGTCCCTGCAGGTGAAGAAAGCTTTTTTTGCTTTGGTGACTAACGGTGTACGAGCTGCCCCTTTAT  223
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  278  -----------------AGGTGAAGAAAGCTTTTTTTGCTTTGGTGACTAACGGTGTACGAGCTGCCCCTTTAT  334

Query  224  GGGATAGTAAGAAGCAAAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACTGATTTCATCAATATCCTGCACCGCTACTAT  297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  GGGATAGTAAGAAGCAAAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACTGATTTCATCAATATCCTGCACCGCTACTAT  408

Query  298  AAATCAGCCTTGGTACAGATCTATGAGCTAGAAGAACACAAGATAGAAACTTGGAGAGAGGTGTATCTCCAGGA  371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  409  AAATCAGCCTTGGTACAGATCTATGAGCTAGAAGAACACAAGATAGAAACTTGGAGAGAGGTGTATCTCCAGGA  482

Query  372  CTCCTTTAAACCGCTTGTCTGCATTTCTCCTAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGGAACA  445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  483  CTCCTTTAAACCGCTTGTCTGCATTTCTCCTAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGGAACA  556

Query  446  AGATCCACAGGCTGCCAGTTATTGACCCAGAATCAGGCAATACTTTGTACATCCTCACCCACAAGCGCATTCTG  519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  557  AGATCCACAGGCTGCCAGTTATTGACCCAGAATCAGGCAATACTTTGTACATCCTCACCCACAAGCGCATTCTG  630

Query  520  AAGTTCCTCAAATTGTTTATCACTGAGTTCCCCAAGCCAGAGTTCATGTCCAAGTCTCTGGAAGAGCTACAGAT  593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  AAGTTCCTCAAATTGTTTATCACTGAGTTCCCCAAGCCAGAGTTCATGTCCAAGTCTCTGGAAGAGCTACAGAT  704

Query  594  TGGCACCTATGCCAATATTGCTATGGTTCGCACTACCACCCCCGTCTATGTGGCTCTGGGGATTTTTGTACAGC  667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  TGGCACCTATGCCAATATTGCTATGGTTCGCACTACCACCCCCGTCTATGTGGCTCTGGGGATTTTTGTACAGC  778

Query  668  ATCGAGTCTCAGCCCTGCCAGTGGTGGATGAGAAGGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTTATC  741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779  ATCGAGTCTCAGCCCTGCCAGTGGTGGATGAGAAGGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTTATC  852

Query  742  AATCTGGCAGCAGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTATCTGTGACTAAAGCCTTGCAACATCGATCACATTA  815
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  853  AATCTGGCAGCAGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTATCTGTGACTAAAGCCTTGCAACATCGATCACATTA  926

Query  816  CTTTGAGGGTGTTCTCAAGTGCTACCTGCATGAGACTCTGGAGACCATCATCAACAGGCTAGTGGAAGCAGAGG  889
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  927  CTTTGAGGGTGTTCTCAAGTGCTACCTGCATGAGACTCTGGAGACCATCATCAACAGGCTAGTGGAAGCAGAGG  1000

Query  890  TTCACCGACTTGTAGTGGTGGATGAAAATGATGTGGTCAAGGGAATTGTATCACTGTCTGACATCCTGCAGGCC  963
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001  TTCACCGACTTGTAGTGGTGGATGAAAATGATGTGGTCAAGGGAATTGTATCACTGTCTGACATCCTGCAGGCC  1074

Query  964  CTGGTGCTCACAGGTGGAGAGAAGAAGCCC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075  CTGGTGCTCACAGGTGGAGAGAAGAAGCCC  1104