Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01287
• Subject: XM_006519032.3
• Aligned Length: 1286
• Identities: 1080
• Gaps: 139

Alignment

Query    1  ATGAGCAGAAGCAAGCGTGACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAACG  74
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGAGCAGAAGCAAACGTGACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTAAAACG  74

Query   75  ATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAA  148
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATACCAGAATTTAAAGCCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTGTGTGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAA  148

Query  149  GAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATTTCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCTA  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.||||.|||
Sbjct  149  GAAATGTTGCAATCAAGAAGCTCAGCCGGCCATTTCAGAATCAGACCCATGCTAAGCGCGCCTACCGAGAACTA  222

Query  223  GTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGA  296
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTCTTATGAAGTGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGA  296

Query  297  AGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTTTGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  297  AGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTTTGCCAAGTGATTCAGATGGAGTTAG  370

Query  371  ATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTATT  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  ATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAAATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCACTCTGCTGGAATTATT  444

Query  445  CATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTAAAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGGC  518
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  445  CATCGGGACTTAAAGCCTAGTAATATAGTAGTCAAATCAGACTGCACTTTGAAGATTCTTGATTTTGGACTGGC  518

Query  519  CAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATCC  592
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  519  GAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTGGTGACTCGCTACTACAGAGCACCAGAGGTCATTC  592

Query  593  TTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTTGACATTTGGTCAGTTGGGTGCATCATGGGAGAAATGATCAAAGGTGGT  666
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACATTTGGTCAGTTGGGTGCATCATGGGAGAAATGATCAAAGGTGGT  666

Query  667  GTTTTGTTCCCAGGTACAGATCATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATGTCCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  667  GTTTTGTTCCCAGGTACAGATCATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTCGGAACACCTTGTCCTGA  740

Query  741  ATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGTAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATAGCTTTG  814
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTCATGAAGAAACTACAACCAACAGTAAGGACTTATGTTGAAAACAGGCCTAAATACGCTGGATATAGCTTTG  814

Query  815  AGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCCCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGGGAT  888
            |||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  AGAAACTGTTCCCCGATGTGCTTTTCCCAGCTGACTCAGAGCATAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGAGAT  888

Query  889  TTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGATGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCCGTACAT  962
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  889  TTGTTATCCAAAATGCTAGTAATAGATGCATCCAAAAGGATCTCCGTAGATGAAGCTCTCCAGCACCCATACAT  962

Query  963  CAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGCAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATGAAAGGG  1036
            |||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  CAACGTCTGGTATGATCCTTCAGAAGCAGAAGCCCCACCACCAAAGATCCCGGACAAGCAGTTAGATGAGAGGG  1036

Query 1037  AACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAATTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAGAATGGA  1110
            |.|||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||.||||||||..||||.|||||||||
Sbjct 1037  AGCACACAATAGAGGAGTGGAAAGAACTGATATACAAGGAGGTAATGGATTTGGAGGAACGAACTAAGAATGGA  1110

Query 1111  GTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTT-----AGGTGCAGCAGTGATCAATGGCTCTCAGCATCCATCATCATCG  1179
            ||.|||.|.||||||||.||||||||     ||||||||||.                                
Sbjct 1111  GTCATAAGAGGGCAGCCGTCTCCTTTAGCACAGGTGCAGCAA--------------------------------  1152

Query 1180  TCGTCTGTCAATGATGTGTCTTCAATGTCAACAGATCCGACTTTGGCCTCTGATACAGACAGCAGTCTAGAAGC  1253
                                                                                      
Sbjct 1153  --------------------------------------------------------------------------  1152

Query 1254  AGCAGCTGGGCCTCTGGGCTGCTGTAGA  1281
                                        
Sbjct 1153  ----------------------------  1152