Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01305
• Subject: NM_001130168.2
• Aligned Length: 1257
• Identities: 859
• Gaps: 366

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||...||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||          
Sbjct    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAG----------  64

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444
                                                                        ||||||||||.|||
Sbjct   65  ------------------------------------------------------------TGGAGACTCCCAAG  78

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct   79  CCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  152

Query  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.||.||||.||||
Sbjct  153  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAAA  226

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  300

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  374

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  CAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  448

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  522

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  523  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCAG  596

Query  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  670

Query 1037  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct  671  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  744

Query 1111  AAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCTC  1184
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  745  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  818

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGACTGGACAGTTCCC  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|.|||
Sbjct  819  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGACTGGACATTACCC  891