Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01305
- Subject:
- NM_002780.5
- Aligned Length:
- 1258
- Identities:
- 1181
- Gaps:
- 2
Alignment
Query 1 ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
Query 75 AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG 148
||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG 148
Query 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||...||
Sbjct 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC 222
Query 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA 296
Query 297 AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
Query 371 TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG 444
||||||||.||...|||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCCAAG 444
Query 445 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||
Sbjct 445 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGATCTTAACCTGTGATCCTGCGAC 518
Query 519 TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA 592
|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||
Sbjct 519 TCCAGCCGCAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA 592
Query 593 CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAACAGGACCCTCTTTATATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
Query 667 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA 740
Query 741 CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA 814
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 741 CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTAAGAACTACACCTACA 814
Query 815 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 888
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 888
Query 889 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 962
|||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 962
Query 963 TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 1036
Query 1037 CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGA 1109
||||||||..||||||||||||||| ||| ||.||.||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTC-GCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGG 1109
Query 1110 AAAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCT 1183
.||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|||.||.||||||||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1110 GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCT 1183
Query 1184 CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGACTGGACAGTTCCC 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.|.|.|||
Sbjct 1184 CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGACTGGATATTACCC 1257