Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01305
• Subject: NM_002785.3
• Aligned Length: 1295
• Identities: 896
• Gaps: 328

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||..|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACAGAGCACATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            |||||||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCATGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTGTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGACCGGCATACAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444
            ||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct  371  TCATAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.|.||||||||
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGACTGTGATCTTAACCTGTAATCCTGAGAC  518

Query  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||.|||||||.||||
Sbjct  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCATAGGATGCAGCTGTCTGAAA  592

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATATGGAACTCA  666

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  667  GGGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
                                      ||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.||||..||
Sbjct  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTTCCCTTCAGTCACCTCTTACTATT  757

Query 1037  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGA  1109
            |||||||...||||.|||||||||| ||| ||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  758  CAGGAGAGAACCTCGACTTGTCCTGCTTC-GCAAACTCTAACCCACCAGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGG  830

Query 1110  AAAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCT  1183
            .||||||||||||.|||||||||||||||||||||..||.||||||.|||||||||..||||||||||.|||||
Sbjct  831  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCTCAGATTACTCCAAAGCATAATGGGCTCTATGCTTGCT  904

Query 1184  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGACTGGACAGTTCCC  1257
            |||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||||.||..||||..|| ||         ||
Sbjct  905  CTGCTCGTAACTCAGCCACTGGCGAGGAAAGCTCCACATCCTTGACAATCAGAGTCATTG-CT---------CC  968

Query 1258  -------------------------------------  1257
                                                 
Sbjct  969  TCCAGGATTAGGAACTTTTGCTTTCAATAATCCAACG  1005