Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01306
• Subject: NM_001130168.2
• Aligned Length: 1277
• Identities: 839
• Gaps: 391

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.|.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAG----------  64

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC  222
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCAAATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGAAAC  296
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  297  AGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACATCA  370
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  371  TAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAGCCC  444
                                                                     .||||||||||||||||
Sbjct   65  ---------------------------------------------------------TGGAGACTCCCAAGCCC  81

Query  445  TCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGACTCC  518
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct   82  TCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGACTCC  155

Query  519  GGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAACCA  592
            |||.||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.||||..||||||
Sbjct  156  GGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAAACCA  229

Query  593  ACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCAGTG  666
            ||||||||||||.||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  230  ACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCAGTG  303

Query  667  AGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAACAA  740
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct  304  AGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAACAA  377

Query  741  CTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACATTT  814
            ||||||.|||||||||||.||||||||.|||..||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct  378  CTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACATTT  451

Query  815  GGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATTCTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  452  GGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATTCTA  525

Query  889  CCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAGTAA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct  526  CCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCAGTTA  599

Query  963  CCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  600  CCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAG  673

Query 1037  GAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGGAAG  1110
            |||||..||||.||||||||||.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  674  GAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGGAAG  747

Query 1111  TTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTCTGT  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  748  TTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTCTGT  821

Query 1185  TCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCA-TGGA---  1254
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||         | ||||   
Sbjct  822  TCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTG---------ACTGGACAT  886

Query 1255  -AACCAGACAGAGTCTCAT  1272
             |.||              
Sbjct  887  TACCC--------------  891