Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01306
- Subject:
- NM_001330524.2
- Aligned Length:
- 1275
- Identities:
- 915
- Gaps:
- 300
Alignment
Query 1 ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
||||||.||||||||||||||||||||||.||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
Query 75 AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG 148
Query 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC 222
Query 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCA---AATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA 293
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.| ||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA 296
Query 294 AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA 367
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
Query 368 TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAG 441
||||||||.|||..|||||||||.||||||||||||||..||||||..||||||||
Sbjct 371 TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTA------------------ 426
Query 442 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC 515
Sbjct 427 -------------------------------------------------------------------------- 426
Query 516 TCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA 589
Sbjct 427 -------------------------------------------------------------------------- 426
Query 590 CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 663
Sbjct 427 -------------------------------------------------------------------------- 426
Query 664 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAA 737
|.||||||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 427 ---------------------------------------CACCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA 461
Query 738 CAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACA 811
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||..||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 462 CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA 535
Query 812 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT 885
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 536 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 609
Query 886 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 683
Query 960 TAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 1033
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684 TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 757
Query 1034 CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGG 1107
||||||||..||||.||||||||||.|.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||..
Sbjct 758 CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGAA 831
Query 1108 AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC 1181
||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 832 AAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCTC 905
Query 1182 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCATGGAA 1255
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct 906 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTG--------------- 964
Query 1256 ACCAGACAGAGTCTCAT 1272
||..||||| .||.|
Sbjct 965 ACTGGACAG-TTCCC-- 978