Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01306
• Subject: NM_182707.3
• Aligned Length: 1288
• Identities: 1186
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.|.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||..|||||.|||||||||||.|..|||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCCACCCACGACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCAACCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCA---AATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||   ||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296

Query  294  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  367
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACAATATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCAGGAAGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  368  TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTC-GGAGACTCCCAA  440
            ||||||.|.||||.||||.||.|.||||||||||||||.|||||||..|||||||||| || ||||||||||||
Sbjct  371  TCATAATGGGAGGTGATGAGAATAGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATA-TCTGGAGACTCCCAA  443

Query  441  GCCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGA  514
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  444  GCCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGA  517

Query  515  CTCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAA  588
            |||||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.||||..||
Sbjct  518  CTCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAA  591

Query  589  ACCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCC  662
            ||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  ACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCC  665

Query  663  AGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCA  736
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  666  AGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCA  739

Query  737  ACAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTAC  810
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||..||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct  740  ACAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTAC  813

Query  811  ATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCAT  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  814  ATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCAT  887

Query  885  TCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCA  958
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  888  TCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCA  961

Query  959  GTAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGT  1032
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  GTTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGT  1035

Query 1033  TCAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGG  1106
            |||||||||..||||.||||||||||.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  TCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGG  1109

Query 1107  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT  1180
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT  1183

Query 1181  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGG--------TCCCT  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||        ||||.
Sbjct 1184  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGGTAAGCGGATCCCA  1257

Query 1247  G---CCATGGAAACCAGACAGAGTCTCAT-  1272
            |   ||.|||.|     |.||.|    || 
Sbjct 1258  GTATCCTTGGCA-----ATAGGG----ATT  1278