Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01306
• Subject: XM_011526987.3
• Aligned Length: 1288
• Identities: 835
• Gaps: 386

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCAAATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGAAAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTC----ACACAGGAGGATGCAG-GATCCTACACCTTACA  365
                                            |||||    .||..|||.|.||||| ||....|.|||||   
Sbjct    1  --------------------------------ATGTCCTTGGCAAGGGAAGCTGCAGAGAAAACATACCTT---  39

Query  366  CATCATAAAGCGAGGCGA--TGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTC----GGAGA  433
                     |.|.|||.|  |..|||||.|  |.|||  |.|.|||.||   .|||...||.|||    |||||
Sbjct   40  ---------GGGCGGCAAAGTAAGACTGAA--ACTAA--GAAGATTCCA---GCACTGCATGCTCCAATGGAGA  97

Query  434  CTCCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGAT  507
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct   98  CTCCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGAT  171

Query  508  CCTGAGACTCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCT  581
            ||||||||||||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  172  CCTGAGACTCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTT  245

Query  582  GTCCAAAACCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATAC  655
            |||..||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  246  GTCTGAAACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATAC  319

Query  656  GGAACCCAGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATC  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct  320  GGAACCCAGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATC  393

Query  730  ACCATCAACAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTA  803
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||..||||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct  394  ACCATCAACAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTA  467

Query  804  CACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGA  877
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  468  CACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGA  541

Query  878  TACTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGC  951
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||
Sbjct  542  TCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGC  615

Query  952  ATCCGCAGTAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTA  1025
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  616  ATCCGCAGTTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTA  689

Query 1026  TTACCGTTCAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAA  1099
            ||||||||||||||||..||||.||||||||||.|.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  690  TTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAA  763

Query 1100  TTAATGGGAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTAT  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  764  TTAATGGGAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTAT  837

Query 1174  GCTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTG  1247
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||       
Sbjct  838  GCTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTG-------  904

Query 1248  CCA-TGGA----AACCAGACAGAGTCTCAT  1272
              | ||||    |.||              
Sbjct  905  --ACTGGACATTACCC--------------  918