Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01306
- Subject:
- XM_017026997.2
- Aligned Length:
- 1294
- Identities:
- 1179
- Gaps:
- 38
Alignment
Query 1 ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
Query 75 AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG 148
||||||||||||.|.||||||.|||||||||||.|..|||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG 148
Query 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||..||
Sbjct 149 ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC 222
Query 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCA---AATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA 293
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||| ||||||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 223 CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA 296
Query 294 AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA 367
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA 370
Query 368 TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATACTCGGAGACTCCCAAG 441
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||||||||.||..|||||||||||||
Sbjct 371 TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCCAAG 444
Query 442 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC 515
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 445 CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGATCTTAACCTGTGATCCTGCGAC 518
Query 516 TCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA 589
|||.|..||||||||||.|||||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCAGCCGCAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA 592
Query 590 CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 663
|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAACAGGACCCTCTTTATATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA 666
Query 664 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCAA 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||.||||||||.|||||
Sbjct 667 GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA 740
Query 738 CAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTACA 811
|||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 741 CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTAAGAACTACACCTACA 814
Query 812 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT 885
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT 888
Query 886 CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 959
|||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG 962
Query 960 TAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 1033
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT 1036
Query 1034 CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGGG 1107
||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG 1110
Query 1108 AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC 1181
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC 1184
Query 1182 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCA--TGG 1253
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||| | |||
Sbjct 1185 TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGGT-------AAGTGG 1251
Query 1254 AAACCAGACAGAGTCTCAT----------------- 1272
|..|||| |||
Sbjct 1252 ATCCCAG---------CATCCTTGGCAATAGGGATT 1278