Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01370
- Subject:
- NM_001142571.2
- Aligned Length:
- 1056
- Identities:
- 950
- Gaps:
- 84
Alignment
Query 1 ATGGGCGTGCTCAGGGTCGGACTGTGCCCTGGCCTTACCGAGGAGATGATCCAGCTTCTCAGGAGCCACAGGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCGTGCTCAGGGTCGGACTGTGCCCTGGCCTTACCGAGGAGATGATCCAGCTTCTCAGGAGCCACAGGAT 74
Query 75 CAAGACAGTGGTGGACCTGGTTTCTGCAGACCTGGAAGAGGTAGCTCAGAAATGTGGCTTGTCTTACAAGGCCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|.
Sbjct 75 CAAGACAGTGGTGGACCTGGTTTCTGCAGACCTGGAAGAGGTAGCTCAGAAATGTGGCTTGTCTTACAA-GACA 147
Query 149 T---GGTTGCCCTGAGGCGGG-------------TGCTGCTGGCTCAGTTCTCGGCTTTCCC----------CG 196
| ||..||.||.|.|.||| |||.||||.|||||.|| ||| ||
Sbjct 148 TGGAGGGCGCACTCAAGTGGGAACCTGGGAGGACTGCAGCTGCCTCAGGTC--------CCCGCAGGGAGATCG 213
Query 197 T-GAATGGCG-CTG--AT-CTCT------------AC---------GAGGAACTGA-AGACCTCCACTGCCATC 243
| ||.|||.| |.| || |||| || |||||||.|| .|||.|.|.||| .||.
Sbjct 214 TGGAGTGGGGTCAGGAATGCTCTGAAGAAGGCAGGACTTGGGCATGGAGGAACAGATGGACTTTCGCTG-AATG 286
Query 244 CTGTC-----------CACTG------GCA-TTGGCA-GTCTTGATAAACTGCTTGATGCTGGTCTCTATACTG 298
||.|| ||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 287 CTTTCGATGAACGAGGCACTGCGGTCAGCACTT--CACGTCTTGATAAACTGCTTGATGCTGGTCTCTATACTG 358
Query 299 GAGAAGTGACTGAAATTGTAGGAGGCCCAGGTAGCGGCAAAACTCAGGTATGTCTCTGTATGGCAGCAAATGTG 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 GAGAAGTGACTGAAATTGTAGGAGGCCCAGGTAGCGGCAAAACTCAGGTATGTCTCTGTATGGCAGCAAATGTG 432
Query 373 GCCCATGGCCTGCAGCAAAACGTCCTATATGTAGATTCCAATGGAGGGCTGACAGCTTCCCGCCTCCTCCAGCT 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 GCCCATGGCCTGCAGCAAAACGTCCTATATGTAGATTCCAATGGAGGGCTGACAGCTTCCCGCCTCCTCCAGCT 506
Query 447 GCTTCAGGCTAAAACCCAGGATGAGGAGGAACAGGCAGAAGCTCTCCGGAGGATCCAGGTGGTGCATGCATTTG 520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 GCTTCAGGCTAAAACCCAGGATGAGGAGGAACAGGCAGAAGCTCTCCGGAGGATCCAGGTGGTGCATGCATTTG 580
Query 521 ACATCTTCCAGATGCTGGATGTGCTGCAGGAGCTCCGAGGCACTGTGGCCCAGCAGGTGACTGGTTCTTCAGGA 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 ACATCTTCCAGATGCTGGATGTGCTGCAGGAGCTCCGAGGCACTGTGGCCCAGCAGGTGACTGGTTCTTCAGGA 654
Query 595 ACTGTGAAGGTGGTGGTTGTGGACTCGGTCACTGCGGTGGTTTCCCCACTTCTGGGAGGTCAGCAGAGGGAAGG 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 ACTGTGAAGGTGGTGGTTGTGGACTCGGTCACTGCGGTGGTTTCCCCACTTCTGGGAGGTCAGCAGAGGGAAGG 728
Query 669 CTTGGCCTTGATGATGCAGCTGGCCCGAGAGCTGAAGACCCTGGCCCGGGACCTTGGCATGGCAGTGGTGGTGA 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 CTTGGCCTTGATGATGCAGCTGGCCCGAGAGCTGAAGACCCTGGCCCGGGACCTTGGCATGGCAGTGGTGGTGA 802
Query 743 CCAACCACATAACTCGAGACAGGGACAGCGGGAGGCTCAAACCTGCCCTCGGACGCTCCTGGAGCTTTGTGCCC 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 CCAACCACATAACTCGAGACAGGGACAGCGGGAGGCTCAAACCTGCCCTCGGACGCTCCTGGAGCTTTGTGCCC 876
Query 817 AGCACTCGGATTCTCCTGGACACCATCGAGGGAGCAGGAGCATCAGGCGGCCGGCGCATGGCGTGTCTGGCCAA 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 AGCACTCGGATTCTCCTGGACACCATCGAGGGAGCAGGAGCATCAGGCGGCCGGCGCATGGCGTGTCTGGCCAA 950
Query 891 ATCTTCCCGACAGCCAACAGGTTTCCAGGAGATGGTAGACATTGGGACCTGGGGGACCTCAGAGCAGAGTGCCA 964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 ATCTTCCCGACAGCCAACAGGTTTCCAGGAGATGGTAGACATTGGGACCTGGGGGACCTCAGAGCAGAGTGCCA 1024
Query 965 CATTACAGGGTGATCAGACA 984
||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 CATTACAGGGTGATCAGACA 1044