Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01375
• Subject: NM_001176528.1
• Aligned Length: 1436
• Identities: 1202
• Gaps: 109

Alignment

Query    1  ATGGCCAGCAACAGCAGCTCCTGCCCGACACCTGGG---GGCGGGCACCTCAATGGGTACCCGGTGCCTCCC--  69
                                .||..|||.| .||.|   |.||||..|||       |||||    ||.|||  
Sbjct    1  --------------------ATGTACGAGA-GTGTGGAAGTCGGGGGCCT-------TACCC----CCGCCCCT  42

Query   70  TACGCCTTCTTCTTCCCCCCTATGCTG-GGTGGACTCT-----------CCCCGCC----------------AG  115
            .||.||||          ||||    | ||||||||.|           ||..|||                ||
Sbjct   43  AACCCCTT----------CCTA----GTGGTGGACTTTTATAACCAGAACCGGGCCTGTTTGCTCCAGGAGAAG  102

Query  116  GCGCT--CTGAC------CACT-CTCCAGCACCAGCT------TCCAGTTAGTGGATATAG--CACACCATCCC  172
            |.|||  |||.|      |.|| ||||| |.||| ||      |||..||  |||| ||.|  ||.||||    
Sbjct  103  GGGCTCCCTGCCCCGGGTCCCTACTCCA-CCCCA-CTCCGGACTCCGCTT--TGGA-ATGGCTCAAACCA----  167

Query  173  CAGCCACCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGCCCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCC  246
                |.||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  168  ----CTCCATCGAGACCCAGAGCAGCAGTTCCGAAGAGATAGTACCCAGCCCTCCCTCACCACCGCCCCTGCCC  237

Query  247  CGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGG  320
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  238  CGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTTTGTCAAGACAAATCATCCGGCTACCACTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGG  311

Query  321  CTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGGGACAAGAACTGCATCA  394
            |||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  312  CTGTAAGGGCTTCTTCCGACGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGTATACGTGTCACCGGGACAAGAACTGCATCA  385

Query  395  TCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGCTTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAG  468
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  386  TCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGGCTGCAGAAATGTTTCGACGTGGGCATGTCCAAGGAG  459

Query  469  TCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGAGTGCTCTGAGAGCTACACGCTGAC  542
            ||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  460  TCGGTGCGAAACGATCGAAACAAAAAGAAGAAAGAGGCACCCAAGCCCGAGTGCTCAGAGAGCTACACGCTGAC  533

Query  543  GCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAACCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGG  616
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  534  GCCTGAGGTGGGCGAGCTCATTGAGAAGGTTCGCAAAGCGCACCAGGAGACCTTCCCGGCCCTCTGCCAGCTGG  607

Query  617  GCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAA  690
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  608  GCAAGTACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGAGTCTCCCTGGACATTGACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAA  681

Query  691  CTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGC  764
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  682  CTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTTCCCGGCTTCACCACCCTCACCATCGC  755

Query  765  CGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGCGGATCTGCACGCGGTACACGCCCG  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  756  CGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGATATCCTGATTCTGCGAATCTGCACGCGGTACACGCCTG  829

Query  839  AGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCC  912
            ||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  830  AGCAAGACACAATGACCTTCTCAGATGGACTGACCCTGAACCGGACTCAGATGCACAACGCTGGCTTTGGCCCC  903

Query  913  CTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATGATGCGGAGACGGGGCTGCT  986
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  904  CTCACCGACTTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGACGATGCTGAGACTGGACTGCT  977

Query  987  CAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGGACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGC  1060
            |||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||..|||||||||||||||.||||
Sbjct  978  CAGTGCCATCTGCCTCATCTGTGGAGACCGACAGGACCTGGAGCAGCCAGACAAGGTGGACATGCTGCAAGAGC  1051

Query 1061  CGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGCCCCCACATGTTCCCCAAGATGCTA  1134
            ||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1052  CGCTGCTGGAAGCACTGAAAGTCTACGTCCGGAAACGGAGGCCCAGCCGACCCCACATGTTCCCCAAGATGCTG  1125

Query 1135  ATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGTGATCACGCTGAAGATGGAGATCCC  1208
            ||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 1126  ATGAAGATCACAGACCTTCGGAGCATCAGCGCCAAGGGAGCTGAACGGGTGATCACATTGAAGATGGAGATCCC  1199

Query 1209  GGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCCTGGACACTCTGAGCGGACAGCCGG  1282
            .|||||||||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 1200  AGGCTCCATGCCACCGCTGATCCAGGAAATGCTGGAGAACTCTGAGGGCTTGGACACTCTAAGCGGACAGTCGG  1273

Query 1283  GGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCC  1356
            ||||.||....||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1274  GGGGCGGAACACGAGATGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCTCCGGGTAGCTGTAGCCCCAGCCTCAGTCCCAGCTCC  1347

Query 1357  AACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG  1386
            .|||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1348  CACAGAAGCAGCCCAGCCACCCAATCCCCA  1377