Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01375
• Subject: XM_005257552.5
• Aligned Length: 1460
• Identities: 1319
• Gaps: 100

Alignment

Query    1  ---------------ATG------GCCAG-----CA-------ACAGC-----AGCTCC----TGCCCGACACC  32
                           |||      |||.|     ||       |||||     ||||.|    ||.|  |||||
Sbjct    1  ATGATGTCACAGACAATGACACAAGCCGGTGTCTCATTCCGACACAGCGTCCGAGCTGCACAATGTC--ACACC  72

Query   33  TGGGGGC--------GGGCACCTCAATGGGTACCCGGTGCCTCCCTACGCCTTCT--------TCTTCCCCCCT  90
            .|||.||        .|||.||.|    |..||||||     ||||||||||.||        |||  ||.|.|
Sbjct   73  CGGGTGCCAAACACTTGGCCCCGC----GCGACCCGG-----CCCTACGCCTCCTGCCGCCGCTCT--CCGCGT  135

Query   91  ATGCTG----GGTGGAC----TCTCCCCGCCAGGCGCTCTGACCACTCTCCAGCACC-------AGCT-TCCAG  148
            .|.|.|    |||||.|    ||..||.|.|||| |..|||   .|...|.|||.||       .||| .|.||
Sbjct  136  CTCCGGGGGAGGTGGCCCGGTTCGGCCGGGCAGG-GGGCTG---GCGGGCGAGCCCCGCGGGCGGGCTGGCGAG  205

Query  149  TTAGTGGATATAGCACACCATCCCCAGCCACCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGC  222
            ...|| |||.|       ||....||| |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  206  CGGGT-GATGT-------CACGGGCAG-CGCCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGC  270

Query  223  CCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  271  CCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCA  344

Query  297  CTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  345  CTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGT  418

Query  371  GTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419  GTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGC  492

Query  445  TTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  493  TTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGA  566

Query  519  GTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  567  GTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAA  640

Query  593  CCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  641  CCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATT  714

Query  667  GACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  715  GACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCC  788

Query  741  CGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  789  CGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGC  862

Query  815  GGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  863  GGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAG  936

Query  889  ATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  937  ATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGAT  1010

Query  963  GGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011  GGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGG  1084

Query 1037  ACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085  ACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGC  1158

Query 1111  CCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159  CCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGT  1232

Query 1185  GATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233  GATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCC  1306

Query 1259  TGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307  TGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGT  1380

Query 1333  AGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG  1386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381  AGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG  1434