Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01375
- Subject:
- XM_006532596.2
- Aligned Length:
- 1386
- Identities:
- 943
- Gaps:
- 357
Alignment
Query 1 ATGGCCAGCAACAGCAGCTCCTGCCCGACACCTGGGGGCGGGCACCTCAATGGGTACCCGGTGCCTCCCTACGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTTCTTCTTCCCCCCTATGCTGGGTGGACTCTCCCCGCCAGGCGCTCTGACCACTCTCCAGCACCAGCTTCCAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTAGTGGATATAGCACACCATCCCCAGCCACCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGT 370
||||||||.||||
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------ATGGTGTATACGT 13
Query 371 GTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGC 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 14 GTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGGCTGCAGAAATGT 87
Query 445 TTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGA 518
||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||||..|||||||||||
Sbjct 88 TTCGACGTGGGCATGTCCAAGGAGTCGGTGCGAAACGATCGAAACAAAAAGAAGAAAGAGGCACCCAAGCCCGA 161
Query 519 GTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAA 592
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 162 GTGCTCAGAGAGCTACACGCTGACGCCTGAGGTGGGCGAGCTCATTGAGAAGGTTCGCAAAGCGCACCAGGAGA 235
Query 593 CCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATT 666
|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 236 CCTTCCCGGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAGTACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGAGTCTCCCTGGACATT 309
Query 667 GACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCC 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 310 GACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTTCC 383
Query 741 CGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 384 CGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGATATCCTGATTCTGC 457
Query 815 GGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAG 888
|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 458 GAATCTGCACGCGGTACACGCCTGAGCAAGACACAATGACCTTCTCAGATGGACTGACCCTGAACCGGACTCAG 531
Query 889 ATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGAT 962
|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 ATGCACAACGCTGGCTTTGGCCCCCTCACCGACTTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGAT 605
Query 963 GGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGG 1036
|||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 606 GGACGATGCTGAGACTGGACTGCTCAGTGCCATCTGCCTCATCTGTGGAGACCGACAGGACCTGGAGCAGCCAG 679
Query 1037 ACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGC 1110
||..|||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 680 ACAAGGTGGACATGCTGCAAGAGCCGCTGCTGGAAGCACTGAAAGTCTACGTCCGGAAACGGAGGCCCAGCCGA 753
Query 1111 CCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGT 1184
|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 754 CCCCACATGTTCCCCAAGATGCTGATGAAGATCACAGACCTTCGGAGCATCAGCGCCAAGGGAGCTGAACGGGT 827
Query 1185 GATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCC 1258
||||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct 828 GATCACATTGAAGATGGAGATCCCAGGCTCCATGCCACCGCTGATCCAGGAAATGCTGGAGAACTCTGAGGGCT 901
Query 1259 TGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGT 1332
||||||||||.|||||||||.|||||||.||....||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 902 TGGACACTCTAAGCGGACAGTCGGGGGGCGGAACACGAGATGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCTCCGGGTAGCTGT 975
Query 1333 AGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG 1386
||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 976 AGCCCCAGCCTCAGTCCCAGCTCCCACAGAAGCAGCCCAGCCACCCAATCCCCA 1029