Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01402
• Subject: NM_020599.2
• Aligned Length: 953
• Identities: 825
• Gaps: 4

Alignment

Query   1  ATGTCAGAAGGGGTGGGCACGTTCCGCATGGTACCTGAAGAGGAACAGGAGCTCCGTGCCCAACTGGAGCAGCT  74
           ||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCAGACGGGGTGGGCACTTTCCGCATGGTTCCTGAAGAGGAGCAGGAGCTCCGAGCACAACTGGAGCAGCT  74

Query  75  CACAACCAAGGACCATGGACCTGTCTTTGGCCCGTGCAGCCAGCTGCCCCGCCACACCTTGCAGAAGGCCAAGG  148
           ||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  75  CACAACCAAGGATCATGGTCCTGTCTTTGGCCCATGCAGCCAGCTGCCCCGCCACACTTTGCAGAAGGCCAAGG  148

Query 149  ATGAGCTGAACGAGAGAGAGGAGACCCGGGAGGAGGCAGTGCGAGAGCTGCAGGAGATGGTGCAGGCGCAGGCG  222
           ||||||||||.||.|..|||||||||||||||||.||.|||.|.|||||.||||||.||||.|||||.|||||.
Sbjct 149  ATGAGCTGAATGAAAAGGAGGAGACCCGGGAGGAAGCGGTGAGGGAGCTACAGGAGCTGGTACAGGCACAGGCA  222

Query 223  GCCTCGGGGGAGGAGCTGGCGGTGGCCGTGGCGGAGAGGGTGCAAG--AGAAGGACAGCGGCTTCTTCCTGCGC  294
           ||.||.||.|||||..||||..||||.|||||.|||||||||||.|  |||  |||||||.||||.||||||||
Sbjct 223  GCTTCTGGCGAGGAATTGGCCCTGGCAGTGGCTGAGAGGGTGCAGGCAAGA--GACAGCGCCTTCCTCCTGCGC  294

Query 295  TTCATCCGCGCACGGAAGTTCAACGTGGGCCGTGCCTATGAGCTGCTCAGAGGCTATGTGAATTTCCGGCTGCA  368
           ||||||||.||.||.||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||||.||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 295  TTCATCCGTGCCCGCAAGTTCGATGTGGGTCGTGCTTATGAGCTGCTCAAAGGCTATGTGAACTTCCGCCTCCA  368

Query 369  GTACCCTGAGCTCTTTGACAGCCTGTCCCCAGAGGCTGTCCGCTGCACCATTGAAGCTGGCTACCCTGGTGTCC  442
           |||||||||.|||||.||.||.||.|||...||||||.||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 369  GTACCCTGAACTCTTCGATAGTCTCTCCATGGAGGCTCTCCGCTGCACTATCGAGGCCGGATACCCTGGTGTCC  442

Query 443  TCTCTAGTCGGGACAAGTATGGCCGAGTGGTCATGCTCTTCAACATTGAGAACTGGCAAAGTCAAGAAATCACC  516
           |.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||..||.|||||.|.|||
Sbjct 443  TTTCCAGTCGGGACAAGTATGGTCGAGTGGTTATGCTCTTCAACATCGAAAACTGGCACTGTGAAGAAGTGACC  516

Query 517  TTTGATGAGATCTTGCAGGCATATTGCTTCATCCTGGAGAAGCTGCTGGAGAATGAGGAAACTCAAATCAATGG  590
           ||||||||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 517  TTTGATGAGATCTTACAGGCATATTGTTTCATTTTGGAGAAACTGCTGGAAAATGAGGAAACCCAAATCAACGG  590

Query 591  CTTCTGCATCATTGAGAACTTCAAGGGCTTTACCATGCAGCAGGCTGCTAGTCTCCGGACTTCAGATCTCAGGA  664
           ||||||.||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||.||..|.|||||..|.||.|||||||.||
Sbjct 591  CTTCTGTATTGTTGAGAACTTCAAGGGCTTCACCATGCAGCAGGCAGCAGGGCTCCGCCCCTCGGATCTCAAGA  664

Query 665  AGATGGTGGACATGCTCCAGGATTCCTTCCCAGCCCGGTTCAAAGCCATCCACTTCATCCACCAGCCATGGTAC  738
           |||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665  AGATGGTGGACATGCTCCAGGATTCATTCCCAGCCAGGTTCAAAGCTATCCACTTCATCCACCAGCCATGGTAC  738

Query 739  TTCACCACGACCTACAATGTGGTCAAGCCCTTCTTGAAGAGCAAGCTGCTTGAGAGGGTCTTTGTCCACGGGGA  812
           ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||||.|||||.||
Sbjct 739  TTCACCACCACCTATAATGTGGTCAAGCCCTTCTTGAAGAACAAGCTGCTACAGAGGGTCTTTGTTCACGGAGA  812

Query 813  TGACCTTTCTGGTTTCTACCAGGAGATCGATGAGAACATCCTGCCCTCTGACTTCGGGGGCACGCTGCCCAAGT  886
           ||||||...|||.||||.|||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 813  TGACCTGGATGGCTTCTTCCAGGAGATTGATGAGAACATCCTGCCTGCTGACTTTGGGGGTACACTGCCCAAGT  886

Query 887  ATGATGGCAAGGCCGTTGCTGAGCAGCTCTTTGGCCCCCAGGCCCAAGCTGAGAACACAGCCTTC  951
           |.||.|||||.|..||||||||||||||||||||.||||.|||..|||.|||||||||||||||.
Sbjct 887  ACGACGGCAAAGTTGTTGCTGAGCAGCTCTTTGGTCCCCGGGCTGAAGTTGAGAACACAGCCTTA  951