Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_01469
Subject:
XM_006497405.3
Aligned Length:
831
Identities:
694
Gaps:
51

Alignment

Query   1  ATGTCCAAGTCTCTGAAGAAGTTGGTGGAGGAGAGCCGGGAGAAGAACCAGCCCGAGGTGGACATGAGTGACCG  74
           |||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct   1  ATGTCCAAGTCACTGAAGAAGCTGGTGGAGGAGAGCAGGGAGAAGAACCAGCCGGAAGTGGACATGAGTGACAG  74

Query  75  GGGCATCTCCAACATGCTGGATGTCAACGGCCTCTTTACCTTATCCCATATCACACAACTGGTCCTCAGCCATA  148
           |||.|||||||..|||.||||||||||||||.|.|.|                                     
Sbjct  75  GGGTATCTCCAGTATGTTGGATGTCAACGGCTTGTCT-------------------------------------  111

Query 149  ACAAGCTAACAATGGTGCCACCGAACATCGCAGAACTGAAGAATTTGGAGGTGCTCAACTTTTTTAATAACCAA  222
                         ||||||||.||..|.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.||.
Sbjct 112  --------------GTGCCACCAAATGTAGCGGAACTGAAGAACTTGGAGGTACTAAACTTCTTCAACAATCAG  171

Query 223  ATCGAGGAGCTGCCCACACAGATCAGTAGCCTTCAGAAACTCAAACACCTGAACCTTGGCATGAACAGGCTGAA  296
           ||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 172  ATCGAGGAACTGCCTACCCAGATCAGCAGCCTCCAGAAACTCAAACACCTGAACCTTGGCATGAATAGGTTGAA  245

Query 297  CACTTTGCCACGAGGCTTCGGCTCCCTGCCAGCTCTTGAGGTTCTGGACTTGACGTACAACAACTTGAGCGAAA  370
           |||..||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||.|||..|||.
Sbjct 246  CACGCTGCCTCGAGGATTCGGCTCCCTCCCGGCTCTGGAGGTCCTGGACTTAACTTACAACAACCTGAATGAAC  319

Query 371  ATTCTCTTCCTGGAAACTTCTTCTACCTGACCACCCTGCGTGCACTCTATCTAAGTGACAACGATTTTGAAATC  444
           ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 320  ATTCTCTTCCGGGAAACTTCTTCTACCTCACCACCCTGCGTGCACTCTATCTAAGCGACAACGATTTTGAAATC  393

Query 445  CTGCCGCCAGATATTGGGAAGCTCACAAAGTTGCAGATACTCAGCCTTAGGGATAACGACCTGATCTCGCTGCC  518
           |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 394  CTGCCTCCAGATATTGGGAAGCTCACAAAGTTGCAGATACTCAGCCTCAGGGATAATGACCTGATCTCACTGCC  467

Query 519  TAAGGAAATCGGGGAGCTTACCCAGCTTAAAGAGCTCCACATTCAGGGGAACCGCCTCACCGTTCTGCCCCCAG  592
           ||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 468  TAAGGAAATCGGGGAGCTGACCCAGCTGAAGGAGCTCCACATTCAGGGGAACCGCCTGACCGTTCTGCCTCCAG  541

Query 593  AACTAGGAAACTTGGATTTAACTGGCCAGAAGCAGGTATTCAAAGCAGAGAACAATCCCTGGGTGACCCCCATT  666
           |.||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 542  AGCTTGGCAACTTGGATCTAACTGGTCAGAAGCAGGTCTTCAAAGCAGAGAACAACCCCTGGGTTACCCCGATT  615

Query 667  GCAGACCAGTTCCAGCTTGGCGTGTCCCATGTTTTTGAGTATATCCGTTCTGAGACATACAAATACCTCTACGG  740
           ||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 616  GCTGACCAGTTCCAGCTTGGCGTCTCCCACGTTTTCGAATATATTCGTTCAGAAACTTACAAGTACCTCTACGG  689

Query 741  CAGACACATGCAGGCCAACCCAGAACCACCGAAGAAGAATAATGACAAATCGAAAAAGATCAGCCGGAAACCCC  814
           ||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 690  CAGACACATGCAAGCGAACCCAGAACCTCCAAAGAAGAATAACGACAAATCAAAAAAGATCAGCCGGAAACCCC  763

Query 815  TGGCAGCCAAGAACAGA  831
           |.|||||||||||||.|
Sbjct 764  TAGCAGCCAAGAACAAA  780