Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01616
- Subject:
- XM_006526844.3
- Aligned Length:
- 934
- Identities:
- 737
- Gaps:
- 92
Alignment
Query 1 ATGAAGGACCGTCTGGAGCAGCTGAAGGCCAAGCAGCTGACACAGGATGATGATACTGATGCGGTTGAGATTGC 74
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|.||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGGACCGGCTGGAGCAGCTGAAGGCCAAGCAGCTGACGCAGGATGATGACACGGACGAGGTTGAGATTGC 74
Query 75 TATCGACAACACGGCTTTTATGGACGAGTTCTTTTCTGAGATTGAGGAAACTCGGCTTAACATTGACAAGATCT 148
.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 75 CATTGACAACACAGCCTTCATGGACGAGTTCTTCTCTGAGATCGAGGAAACACGGCTCAACATTGACAAGATCT 148
Query 149 CAGAACATGTAGAGGAGGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATTCCAGAGCCAAAAACCAAG 222
|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 149 CGGAGCATGTAGAGGAAGCTAAGAAACTCTACAGTATCATTCTCTCTGCACCGATCCCAGAGCCAAAAACCAAA 222
Query 223 GATGACCTAGAGCAGCTCACGACTGAGATTAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAACTGAAGAGCATGGA 296
||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223 GATGACCTTGAACAGCTCACAACTGAGATCAAGAAAAGGGCCAACAACGTCCGGAACAAGCTGAAGAGCATGGA 296
Query 297 GAAGCATATTGAAGAAGATGAGGTCAGGTCATCGGCAGACCTTCGGATTCGGAAATCCCAGCACTCTGTCCTTT 370
||||||.|||||.|||||||||||..|||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 297 GAAGCACATTGAGGAAGATGAGGTTCGGTCATCTGCAGACCTTCGGATACGAAAGTCCCAGCACTCCGTCCTCT 370
Query 371 CTCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACCAAATACAATGAAGCTCAAGTGGACTTCCGAGAACGCAGCAAAGGGCGA 444
|.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 371 CCCGGAAGTTTGTGGAGGTGATGACAAAGTACAATGAGGCTCAGGTGGACTTCCGTGAACGCAGCAAAGGGCGC 444
Query 445 ATCCAGCGGCAGCTCGAAATTACTGGCAAAAAGACAACCGATGAGGAGCTGGAGGAGATGTTGGAGAGTGGCAA 518
|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATCCAACGGCAGCTTGAAATTACTGGCAAGAAGACAACAGATGAGGAGCTGGAAGAGATGTTGGAGAGTGGCAA 518
Query 519 CCCGGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCACAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGTGAGATTGAGGGACGAC 592
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 519 CCCAGCCATCTTCACTTCTGGGATCATTGACTCCCAGATTTCCAAGCAAGCCCTCAGCGAGATTGAGGGTCGGC 592
Query 593 ACAAGGACATTGTGAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTTCACGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG 666
||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAAGGACATCGTAAGGCTGGAGAGCAGCATCAAGGAGCTCCATGACATGTTTATGGACATCGCCATGCTGGTG 666
Query 667 GAGAATCAGGGTGAGATGTTAGATAACATAGAGTTGAATGTCATG---CACACAGTGGACCACGTGGAGAAGGC 737
||.||||||||.|..|||.|.||...|||.|| |||...|||| ||..||||||.|...|||||
Sbjct 667 GAAAATCAGGGAGCCATGATTGACCGCATTGA---GAACAACATGGACCAGTCAGTGGGCTTTGTGGA------ 731
Query 738 ACGAGAT------GAAACGAAAAAAGCTGTGAAATACCAGAGTCAGGCCCGGAAGAAATTGA-----TAATTAT 800
|||.|.| ||.||.|||||.||.||.||.||.||||||.|.|||||||.| .||| |.|.|.|
Sbjct 732 ACGGGCTGTGGCAGATACCAAAAAGGCGGTCAAGTATCAGAGTGAAGCCCGGAGG---GTGAGCGCCTCAATCT 802
Query 801 CATTGTGCTAGTAG----TTGTGTTGCTGGGCATTTTAGCA-TTGATTATTGGACT-TTCCGTTGGGC---TGA 865
| ||||.||.| ||.|.|..|| |..||||..|| |||..||.| || ||| |||.|| ||
Sbjct 803 C----TGCTTGTTGTACCTTCTCTACCT--GTCTTTTGTCACTTGTCTACT---CTGTTC--TTGAGCCCATG- 864
Query 866 AT-------------------------------------------- 867
|
Sbjct 865 -TCCTTCGTCTCTGTCCTAGCCTTAGCCTCTTCCAAACCCCTACCT 909