Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01631
• Subject: XM_005271156.1
• Aligned Length: 2928
• Identities: 2763
• Gaps: 165

Alignment

Query    1  ATGGAAAAGCAAAAGCCCTTTGCATTGTTCGTACCACCGAGATCAAGCAGCAGTCAGGTGTCTGCGGTGAAACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAAAGCAAAAGCCCTTTGCATTGTTCGTACCACCGAGATCAAGCAGCAGTCAGGTGTCTGCGGTGAAACC  74

Query   75  TCAGACCCTGGGAGGCGATTCCACTTTCTTCAAGAGTTTCAACAAATGTACTGAAGATGATTTTGAGTTTCCAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCAGACCCTGGGAGGCGATTCCACTTTCTTCAAGAGTTTCAACAAATGTACTGAAGATGATTTTGAGTTTCCAT  148

Query  149  TTGCAAAGACTAATCTCTCCAAAAATGGGGAAAACATTGATTCAGATCCTGCTTTACAAAAAGTTAATTTCTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGCAAAGACTAATCTCTCCAAAAATGGGGAAAACATTGATTCAGATCCTGCTTTACAAAAAGTTAATTTCTTG  222

Query  223  CCCGTGCTTGAGCAGGTTGGTAATTCTGACTGTCACTATCAGGAAGGACTAAAAGACTCTGATTTGGAGAATTC  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  223  CCCGTGCTTGAGCAGGTTGGTAATTCTGACTGTCACTATCAGGAAGGACTAAAAGACTCTGATTTGGAG-----  291

Query  297  AGAGGGATTGAGCAGAGTGTATTCAAAACTGTATAAGGAGGCTGAAAAGATAAAAAAATGGAAAGTAAGTACAG  370
                                                                                      
Sbjct  292  --------------------------------------------------------------------------  291

Query  371  AAGCTGAACTGAGACAGAAAGAAAGTAAGTTGCAAGAAAACAGAAAGATAATTGAAGCACAGCGAAAAGCCATT  444
                                                                                      
Sbjct  292  --------------------------------------------------------------------------  291

Query  445  CAGGAACTGCAATTTGGAAATGAAAAAGTAAGTTTGAAATTAGAAGAAGGAATACAAGAAAATAAAGATTTAAT  518
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  ------------TTTGGAAATGAAAAAGTAAGTTTGAAATTAGAAGAAGGAATACAAGAAAATAAAGATTTAAT  353

Query  519  AAAAGAGAATAATGCCACAAGGCATTTATGTAATCTACTCAAAGAAACCTGTGCTAGATCTGCAGAAAAGACAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  354  AAAAGAGAATAATGCCACAAGGCATTTATGTAATCTACTCAAAGAAACCTGTGCTAGATCTGCAGAAAAGACAA  427

Query  593  AGAAATATGAATATGAACGGGAAGAAACCAGGCAAGTTTATATGGATCTAAATAATAACATTGAGAAAATGATA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  428  AGAAATATGAATATGAACGGGAAGAAACCAGGCAAGTTTATATGGATCTAAATAATAACATTGAGAAAATGATA  501

Query  667  ACAGCTTTTGAGGAACTTCGTGTGCAAGCTGAGAATTCCAGACTGGAAATGCATTTTAAGTTAAAGGAAGATTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  502  ACAGCTTTTGAGGAACTTCGTGTGCAAGCTGAGAATTCCAGACTGGAAATGCATTTTAAGTTAAAGGAAGATTA  575

Query  741  TGAAAAAATCCAACACCTTGAACAAGAATACAAGAAGGAAATAAATGACAAGGAAAAGCAGGTATCACTACTAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  576  TGAAAAAATCCAACACCTTGAACAAGAATACAAGAAGGAAATAAATGACAAGGAAAAGCAGGTATCACTACTAT  649

Query  815  TGATCCAAATCACTGAGAAAGAAAATAAAATGAAAGATTTAACATTTCTGCTAGAGGAATCCAGAGATAAAGTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  650  TGATCCAAATCACTGAGAAAGAAAATAAAATGAAAGATTTAACATTTCTGCTAGAGGAATCCAGAGATAAAGTT  723

Query  889  AATCAATTAGAGGAAAAGACAAAATTACAGAGTGAAAACTTAAAACAATCAATTGAGAAACAGCATCATTTGAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  724  AATCAATTAGAGGAAAAGACAAAATTACAGAGTGAAAACTTAAAACAATCAATTGAGAAACAGCATCATTTGAC  797

Query  963  TAAAGAACTAGAAGATATTAAAGTGTCATTACAAAGAAGTGTGAGTACTCAAAAGGCTTTAGAGGAAGATTTAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  798  TAAAGAACTAGAAGATATTAAAGTGTCATTACAAAGAAGTGTGAGTACTCAAAAGGCTTTAGAGGAAGATTTAC  871

Query 1037  AGATAGCAACAAAAACAATTTGTCAGCTAACTGAAGAAAAAGAAACTCAAATGGAAGAATCTAATAAAGCTAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  872  AGATAGCAACAAAAACAATTTGTCAGCTAACTGAAGAAAAAGAAACTCAAATGGAAGAATCTAATAAAGCTAGA  945

Query 1111  GCTGCTCATTCGTTTGTGGTTACTGAATTTGAAACTACTGTCTGCAGCTTGGAAGAATTATTGAGAACAGAACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  946  GCTGCTCATTCGTTTGTGGTTACTGAATTTGAAACTACTGTCTGCAGCTTGGAAGAATTATTGAGAACAGAACA  1019

Query 1185  GCAAAGATTGGAAAAAAATGAAGATCAATTGAAAATACTTACCATGGAGCTTCAAAAGAAATCAAGTGAGCTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020  GCAAAGATTGGAAAAAAATGAAGATCAATTGAAAATACTTACCATGGAGCTTCAAAAGAAATCAAGTGAGCTGG  1093

Query 1259  AAGAGATGACTAAGCTTACAAATAACAAAGAAGTAGAACTTGAAGAATTGAAAAAAGTCTTGGGAGAAAAGGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094  AAGAGATGACTAAGCTTACAAATAACAAAGAAGTAGAACTTGAAGAATTGAAAAAAGTCTTGGGAGAAAAGGAA  1167

Query 1333  ACACTTTTATATGAAAATAAACAATTTGAGAAGATTGCTGAAGAATTAAAAGGAACAGAACAAGAACTAATTGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168  ACACTTTTATATGAAAATAAACAATTTGAGAAGATTGCTGAAGAATTAAAAGGAACAGAACAAGAACTAATTGG  1241

Query 1407  TCTTCTCCAAGCCAGAGAGAAAGAAGTACATGATTTGGAAATACAGTTAACTGCCATTACCACAAGTGAACAGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242  TCTTCTCCAAGCCAGAGAGAAAGAAGTACATGATTTGGAAATACAGTTAACTGCCATTACCACAAGTGAACAGT  1315

Query 1481  ATTATTCAAAAGAGGTTAAAGATCTAAAAACTGAGCTTGAAAACGAGAAGCTTAAGAATACTGAATTAACTTCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316  ATTATTCAAAAGAGGTTAAAGATCTAAAAACTGAGCTTGAAAACGAGAAGCTTAAGAATACTGAATTAACTTCA  1389

Query 1555  CACTGCAACAAGCTTTCACTAGAAAACAAAGAGCTCACACAGGAAACAAGTGATATGACCCTAGAACTCAAGAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390  CACTGCAACAAGCTTTCACTAGAAAACAAAGAGCTCACACAGGAAACAAGTGATATGACCCTAGAACTCAAGAA  1463

Query 1629  TCAGCAAGAAGATATTAATAATAACAAAAAGCAAGAAGAAAGGATGTTGAAACAAATAGAAAATCTTCAAGAAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1464  TCAGCAAGAAGATATTAATAATAACAAAAAGCAAGAAGAAAGGATGTTGAAACAAATAGAAAATCTTCAAGAAA  1537

Query 1703  CAGAAACCCAATTAAGAAATGAACTAGAATATGTGAGAGAAGAGCTAAAACAGAAAAGAGATGAAGTTAAATGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1538  CAGAAACCCAATTAAGAAATGAACTAGAATATGTGAGAGAAGAGCTAAAACAGAAAAGAGATGAAGTTAAATGT  1611

Query 1777  AAATTGGACAAGAGTGAAGAAAATTGTAACAATTTAAGGAAACAAGTTGAAAATAAAAACAAGTATATTGAAGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612  AAATTGGACAAGAGTGAAGAAAATTGTAACAATTTAAGGAAACAAGTTGAAAATAAAAACAAGTATATTGAAGA  1685

Query 1851  ACTTCAGCAGGAGAATAAGGCCTTGAAAAAAAAAGGTACAGCAGAAAGCAAGCAACTGAATGTTTATGAGATAA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1686  ACTTCAGCAGGAGAATAAGGCCTTGAAAAAAAAAGGTACAGCAGAAAGCAAGCAACTGAATGTTTATGAGATAA  1759

Query 1925  AGGTCAATAAATTAGAGTTAGAACTAGAAAGTGCCAAACAGAAATTTGGAGAAATCACAGACACCTATCAGAAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1760  AGGTCAATAAATTAGAGTTAGAACTAGAAAGTGCCAAACAGAAATTTGGAGAAATCACAGACACCTATCAGAAA  1833

Query 1999  GAAATTGAGGACAAAAAGATATCAGAAGAAAATCTTTTGGAAGAGGTTGAGAAAGCAAAAGTAATAGCTGATGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834  GAAATTGAGGACAAAAAGATATCAGAAGAAAATCTTTTGGAAGAGGTTGAGAAAGCAAAAGTAATAGCTGATGA  1907

Query 2073  AGCAGTAAAATTACAGAAAGAAATTGATAAGCGATGTCAACATAAAATAGCTGAAATGGTAGCACTTATGGAAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908  AGCAGTAAAATTACAGAAAGAAATTGATAAGCGATGTCAACATAAAATAGCTGAAATGGTAGCACTTATGGAAA  1981

Query 2147  AACATAAGCACCAATATGATAAGATCATTGAAGAAAGAGACTCAGAATTAGGACTTTATAAGAGCAAAGAACAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1982  AACATAAGCACCAATATGATAAGATCATTGAAGAAAGAGACTCAGAATTAGGACTTTATAAGAGCAAAGAACAA  2055

Query 2221  GAACAGTCATCACTGAGAGCATCTTTGGAGATTGAACTATCCAATCTCAAAGCTGAACTTTTGTCTGTTAAGAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2056  GAACAGTCATCACTGAGAGCATCTTTGGAGATTGAACTATCCAATCTCAAAGCTGAACTTTTGTCTGTTAAGAA  2129

Query 2295  GCAACTTGAAATAGAAAGAGAAGAGAAGGAAAAACTCAAAAGAGAGGCAAAAGAAAACACAGCTACTCTTAAAG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130  GCAACTTGAAATAGAAAGAGAAGAGAAGGAAAAACTCAAAAGAGAGGCAAAAGAAAACACAGCTACTCTTAAAG  2203

Query 2369  AAAAAAAAGACAAGAAAACACAAACATTTTTATTGGAAACACCTGAAATTTATTGGAAATTGGATTCTAAAGCA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2204  AAAAAAAAGACAAGAAAACACAAACATTTTTATTGGAAACACCTGAAATTTATTGGAAATTGGATTCTAAAGCA  2277

Query 2443  GTTCCTTCACAAACTGTATCTCGAAATTTCACATCAGTTGATCATGGCATATCCAAAGATAAAAGAGACTATCT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2278  GTTCCTTCACAAACTGTATCTCGAAATTTCACATCAGTTGATCATGGCATATCCAAAGATAAAAGAGACTATCT  2351

Query 2517  GTGGACATCTGCCAAAAATACTTTATCTACACCATTGCCAAAGGCATATACAGTGAAGACACCAACAAAACCAA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2352  GTGGACATCTGCCAAAAATACTTTATCTACACCATTGCCAAAGGCATATACAGTGAAGACACCAACAAAACCAA  2425

Query 2591  AACTACAGCAAAGAGAAAACTTGAATATACCCATTGAAGAAAGTAAAAAAAAGAGAAAAATGGCCTTTGAATTT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2426  AACTACAGCAAAGAGAAAACTTGAATATACCCATTGAAGAAAGTAAAAAAAAGAGAAAAATGGCCTTTGAATTT  2499

Query 2665  GATATTAATTCAGATAGTTCAGAAACTACTGATCTTTTGAGCATGGTTTCAGAAGAAGAGACATTGAAAACACT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2500  GATATTAATTCAGATAGTTCAGAAACTACTGATCTTTTGAGCATGGTTTCAGAAGAAGAGACATTGAAAACACT  2573

Query 2739  GTATAGGAACAATAATCCACCAGCTTCTCATCTTTGTGTCAAAACACCAAAAAAGGCCCCTTCATCTCTAACAA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2574  GTATAGGAACAATAATCCACCAGCTTCTCATCTTTGTGTCAAAACACCAAAAAAGGCCCCTTCATCTCTAACAA  2647

Query 2813  CCCCTGGATCTACACTGAAGTTTGGAGCTATAAGAAAAATGCGGGAGGACCGTTGGGCTGTAATTGCTAAAATG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2648  CCCCTGGATCTACACTGAAGTTTGGAGCTATAAGAAAAATGCGGGAGGACCGTTGGGCTGTAATTGCTAAAATG  2721

Query 2887  GATAGAAAAAAAAAACTAAAAGAAGCTGAAAAGTTATTTGTT  2928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2722  GATAGAAAAAAAAAACTAAAAGAAGCTGAAAAGTTATTTGTT  2763