Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01659
- Subject:
- XM_005251291.3
- Aligned Length:
- 1407
- Identities:
- 1257
- Gaps:
- 150
Alignment
Query 1 ATGGCGGAGGATGTTTCCTCAGCGGCCCCGAGCCCGCGGGGCTGTGCGGATGGTAGGGATGCCGACCCTACTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGAGGATGTTTCCTCAGCGGCCCCGAGCCCGCGGGGCTGTGCGGATGGTAGGGATGCCGACCCTACTGA 74
Query 75 GGAGCAGATGGCAGAAACAGAGAGAAACGACGAGGAGCAGTTCGAATGCCAGGAACTGCTCGAGTGCCAGGTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGCAGATGGCAGAAACAGAGAGAAACGACGAGGAGCAGTTCGAATGCCAGGAACTGCTCGAGTGCCAGGTGC 148
Query 149 AGGTGGGGGCCCCCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGCGGGCCTGGTGGCCGAGGCCGAGGCCGTGGCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGTGGGGGCCCCCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACGCGGGCCTGGTGGCCGAGGCCGAGGCCGTGGCT 222
Query 223 GCCGGCTGGATGCTCGATTTCCTCTGCCTCTCTCTTTGCCGAGCTTTCCGCGACGGCCGCTCCGAGGACTTCCG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCGGCTGGATGCTCGATTTCCTCTGCCTCTCTCTTTGCCGAGCTTTCCGCGACGGCCGCTCCGAGGACTTCCG 296
Query 297 CAGGACCCGCAACAGCGCAGAGGCTATTATTCATGGACTATCCAGTCTAACAGCTTGCCAGTTGAGAACGATAT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGGACCCGCAACAGCGCAGAGGCTATTATTCATGGACTATCCAGTCTAACAGCTTGCCAGTTGAGAACGATAT 370
Query 371 ACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGGAAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAACGAATT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACATATGTCAGTTTTTGACAAGAATTGCAGCAGGAAAAACCCTTGATGCACAGTTTGAAAATGATGAACGAATT 444
Query 445 ACACCCTTGGAATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGACAAACTTCATGAAGAAATACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACACCCTTGGAATCAGCCCTGATGATTTGGGGTTCAATTGAAAAGGAACATGACAAACTTCATGAAGAAATACA 518
Query 519 GAATTTAATTAAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTATGGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGAAGTCTTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAATTTAATTAAAATTCAGGCTATAGCTGTTTGTATGGAAAATGGCAACTTTAAAGAAGCAGAAGAAGTCTTTG 592
Query 593 AAAGAATATTTGGTGATCCAAATTCTCATATGCCTTTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCTCAGAAAGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAGAATATTTGGTGATCCAAATTCTCATATGCCTTTCAAAAGCAAATTGCTTATGATAATCTCTCAGAAAGAT 666
Query 667 ACATTTCATTCCTTTTTTCAACACTTCAGCTACAACCACATGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATTATGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACATTTCATTCCTTTTTTCAACACTTCAGCTACAACCACATGATGGAGAAAATTAAGAGTTATGTGAATTATGT 740
Query 741 GCTAAGTGAAAAATCATCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCGGCAAAAGTAGTAGAAAGCAAAAGGACAAGAACAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCTAAGTGAAAAATCATCAACCTTTCTAATGAAGGCAGCGGCAAAAGTAGTAGAAAGCAAAAGGACAAGAACAA 814
Query 815 TAACTTCTCAAGATAAACCTAGTGGTAATGATGTTGAAATGGAAACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAAA--- 885
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TAACTTCTCAAGATAAACCTAGTGGTAATGATGTTGAAATGGAAACTGAAGCTAATTTGGATACAAGAAAAAGT 888
Query 886 ---------------------------------------------------------AGGTCTCACAAGAATCT 902
|||||||||||||||||
Sbjct 889 GTTAGTGACAAACAGTCTGCGGTAACTGAATCCTCAGAGGGTACAGTATCCTTATTGAGGTCTCACAAGAATCT 962
Query 903 TTTCTTATCTAAGTTGCAACATGGAACCCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGAAAGAAGAGTAGGAACTCCTC 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTTCTTATCTAAGTTGCAACATGGAACCCAGCAACAAGACCTTAATAAGAAAGAAAGAAGAGTAGGAACTCCTC 1036
Query 977 AAA----------------------------------------------------------------------- 979
|||
Sbjct 1037 AAATTACATATATTTGTCTTACCAAACTGACTATGAATAAGAAAGAAGGAGTGAGGAAAGGATTATGCTTCTTA 1110
Query 980 -------------------GTACAAAAAAGAAAAAAGAAAGCAGAAGAGCCACTGAAAGCAGAATACCTGTTTC 1034
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTACTCCTAAAACATTATCGTACAAAAAAGAAAAAAGAAAGCAGAAGAGCCACTGAAAGCAGAATACCTGTTTC 1184
Query 1035 AAAGAGTCAGCCGGTAACTCCTGAAAAACATCGAGCTAGAAAAAGACAGGCATGGCTTTGGGAAGAAGACAAGA 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAAGAGTCAGCCGGTAACTCCTGAAAAACATCGAGCTAGAAAAAGACAGGCATGGCTTTGGGAAGAAGACAAGA 1258
Query 1109 ATTTGAGATCTGGCGTGAGGAAATATGGAGAGGGAAACTGGTCTAAAATACTGTTGCATTATAAATTCAACAAC 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTTGAGATCTGGCGTGAGGAAATATGGAGAGGGAAACTGGTCTAAAATACTGTTGCATTATAAATTCAACAAC 1332
Query 1183 CGGACAAGTGTCATGTTAAAAGACAGATGGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTCCTCAGACAGCGAAGA 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CGGACAAGTGTCATGTTAAAAGACAGATGGAGGACCATGAAGAAACTAAAACTGATTTCCTCAGACAGCGAAGA 1406
Query 1257 C 1257
|
Sbjct 1407 C 1407