Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01667
• Subject: NM_001374396.1
• Aligned Length: 816
• Identities: 756
• Gaps: 60

Alignment

Query   1  ATGAAAGGCAAGAAAGGTATTGTTGCAGCATCTGGCAGTGAGACTGAGGATGAGGACAGCATGGACATTCCCTT  74
                                                                       ||||||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------------------------------------ATGGACATTCCCTT  14

Query  75  GGACCTTTCTTCATCCGCTGGCTCAGGCAAGAGAAGGAGAAGGGGCAACCTACCCAAGGAGTCTGTGCAGATTC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  15  GGACCTTTCTTCATCCGCTGGCTCAGGCAAGAGAAGGAGAAGGGGCAACCTACCCAAGGAGTCTGTGCAGATTC  88

Query 149  TTCGGGATTGGCTGTATGAGCACCGTTACAATGCCTATCCTTCAGAGCAAGAAAAAGCGTTGCTGTCCCAGCAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  89  TTCGGGATTGGCTGTATGAGCACCGTTACAATGCCTATCCTTCAGAGCAAGAAAAAGCGTTGCTGTCCCAGCAA  162

Query 223  ACACACCTGTCTACGCTACAGGTCTGTAACTGGTTCATCAACGCCCGCCGCAGGCTCCTCCCTGACATGCTGAG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163  ACACACCTGTCTACGCTACAGGTCTGTAACTGGTTCATCAACGCCCGCCGCAGGCTCCTCCCTGACATGCTGAG  236

Query 297  AAAGGATGGCAAAGATCCAAATCAGTTCACAATTTCCCGCCGTGGGGCCAAGATTTCTGAAACGAGCTCTGTGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237  AAAGGATGGCAAAGATCCAAATCAGTTCACAATTTCCCGCCGTGGGGCCAAGATTTCTGAAACGAGCTCTGTGG  310

Query 371  AGTCCGTGATGGGCATCAAAAACTTCATGCCAGCTCTAGAGGAGACCCCATTTCATTCCTGTACAGCTGGGCCA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311  AGTCCGTGATGGGCATCAAAAACTTCATGCCAGCTCTAGAGGAGACCCCATTTCATTCCTGTACAGCTGGGCCA  384

Query 445  AACCCAACCCTAGGGAGGCCACTGTCTCCTAAGCCGTCATCCCCGGGATCAGTTTTGGCTCGTCCATCAGTGAT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385  AACCCAACCCTAGGGAGGCCACTGTCTCCTAAGCCGTCATCCCCGGGATCAGTTTTGGCTCGTCCATCAGTGAT  458

Query 519  CTGCCATACCACTGTGACTGCATTGAAAGATGTCCCTTTCTCTCTCTGCCAGTCGGTCGGTGTGGGACAAAACA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459  CTGCCATACCACTGTGACTGCATTGAAAGATGTCCCTTTCTCTCTCTGCCAGTCGGTCGGTGTGGGACAAAACA  532

Query 593  CAGATATACAGCAGATAGCGGCCAAAAACTTCACAGACACCTCTCTCATGTACCCAGAGGACACTTGTAAATCT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533  CAGATATACAGCAGATAGCGGCCAAAAACTTCACAGACACCTCTCTCATGTACCCAGAGGACACTTGTAAATCT  606

Query 667  GGACCAAGTACGAATACACAGAGTGGTCTTTTCAACACTCCTCCCCCTACTCCACCGGACCTCAACCAGGACTT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 607  GGACCAAGTACGAATACACAGAGTGGTCTTTTCAACACTCCTCCCCCTACTCCACCGGACCTCAACCAGGACTT  680

Query 741  CAGTGGATTTCAGCTTCTAGTGGATGTTGCACTCAAACGGGCTGCAGAGATGGAGCTTCAGGCAAAACTTACAG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 681  CAGTGGATTTCAGCTTCTAGTGGATGTTGCACTCAAACGGGCTGCAGAGATGGAGCTTCAGGCAAAACTTACAG  754

Query 815  CT  816
           ||
Sbjct 755  CT  756