Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01667
• Subject: NM_173207.4
• Aligned Length: 860
• Identities: 811
• Gaps: 46

Alignment

Query   1  -----------------------------------ATGAAAGGCAAGA---------AAGGTATTGTTGCAGCA  30
                                              ||.||  ||..||         |||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGACTTGCTCGGGCAAAAGTTGTGCATTGGCCCGATCAA--GCCTGACTTCTAGCCAAGGTATTGTTGCAGCA  72

Query  31  TCTGGCAGTGAGACTGAGGATGAGGACAGCATGGACATTCCCTTGGACCTTTCTTCATCCGCTGGCTCAGGCAA  104
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  73  TCTGGCAGTGAGACTGAGGATGAGGACAGCATGGACATTCCCTTGGACCTTTCTTCATCCGCTGGCTCAGGCAA  146

Query 105  GAGAAGGAGAAGGGGCAACCTACCCAAGGAGTCTGTGCAGATTCTTCGGGATTGGCTGTATGAGCACCGTTACA  178
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147  GAGAAGGAGAAGGGGCAACCTACCCAAGGAGTCTGTGCAGATTCTTCGGGATTGGCTGTATGAGCACCGTTACA  220

Query 179  ATGCCTATCCTTCAGAGCAAGAAAAAGCGTTGCTGTCCCAGCAAACACACCTGTCTACGCTACAGGTCTGTAAC  252
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221  ATGCCTATCCTTCAGAGCAAGAAAAAGCGTTGCTGTCCCAGCAAACACACCTGTCTACGCTACAGGTCTGTAAC  294

Query 253  TGGTTCATCAACGCCCGCCGCAGGCTCCTCCCTGACATGCTGAGAAAGGATGGCAAAGATCCAAATCAGTTCAC  326
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295  TGGTTCATCAACGCCCGCCGCAGGCTCCTCCCTGACATGCTGAGAAAGGATGGCAAAGATCCAAATCAGTTCAC  368

Query 327  AATTTCCCGCCGTGGGGCCAAGATTTCTGAAACGAGCTCTGTGGAGTCCGTGATGGGCATCAAAAACTTCATGC  400
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369  AATTTCCCGCCGTGGGGCCAAGATTTCTGAAACGAGCTCTGTGGAGTCCGTGATGGGCATCAAAAACTTCATGC  442

Query 401  CAGCTCTAGAGGAGACCCCATTTCATTCCTGTACAGCTGGGCCAAACCCAACCCTAGGGAGGCCACTGTCTCCT  474
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443  CAGCTCTAGAGGAGACCCCATTTCATTCCTGTACAGCTGGGCCAAACCCAACCCTAGGGAGGCCACTGTCTCCT  516

Query 475  AAGCCGTCATCCCCGGGATCAGTTTTGGCTCGTCCATCAGTGATCTGCCATACCACTGTGACTGCATTGAAAGA  548
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517  AAGCCGTCATCCCCGGGATCAGTTTTGGCTCGTCCATCAGTGATCTGCCATACCACTGTGACTGCATTGAAAGA  590

Query 549  TGTCCCTTTCTCTCTCTGCCAGTCGGTCGGTGTGGGACAAAACACAGATATACAGCAGATAGCGGCCAAAAACT  622
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591  TGTCCCTTTCTCTCTCTGCCAGTCGGTCGGTGTGGGACAAAACACAGATATACAGCAGATAGCGGCCAAAAACT  664

Query 623  TCACAGACACCTCTCTCATGTACCCAGAGGACACTTGTAAATCTGGACCAAGTACGAATACACAGAGTGGTCTT  696
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665  TCACAGACACCTCTCTCATGTACCCAGAGGACACTTGTAAATCTGGACCAAGTACGAATACACAGAGTGGTCTT  738

Query 697  TTCAACACTCCTCCCCCTACTCCACCGGACCTCAACCAGGACTTCAGTGGATTTCAGCTTCTAGTGGATGTTGC  770
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739  TTCAACACTCCTCCCCCTACTCCACCGGACCTCAACCAGGACTTCAGTGGATTTCAGCTTCTAGTGGATGTTGC  812

Query 771  ACTCAAACGGGCTGCAGAGATGGAGCTTCAGGCAAAACTTACAGCT  816
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813  ACTCAAACGGGCTGCAGAGATGGAGCTTCAGGCAAAACTTACAGCT  858