Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01715
• Subject: NM_001135957.3
• Aligned Length: 977
• Identities: 836
• Gaps: 141

Alignment

Query   1  MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFKININCIDPLGRTAL  74
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Sbjct   1  MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFKININCIDPLGRTAL  74

Query  75  LIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKKPSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIIL  148
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Sbjct  75  LIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKKPSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIIL  148

Query 149  AAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQ  222
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Sbjct 149  AAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQ  222

Query 223  LSWELQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYR  296
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Sbjct 223  LSWELQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYR  296

Query 297  QKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHT  370
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Sbjct 297  QKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHT  370

Query 371  ASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSL  444
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Sbjct 371  ASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSL  444

Query 445  YLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILK  518
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Sbjct 445  YLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILK  518

Query 519  FLFIYCLVLLAFANGLNQLYFYYEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEF  592
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Sbjct 519  FLFIYCLVLLAFANGLNQLYFYYEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEF  592

Query 593  TEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSL  666
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Sbjct 593  TEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSL  666

Query 667  WYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELK  740
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 667  WYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKT-------------  727

Query 741  QDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIASER  814
                                                                                     
Sbjct 728  --------------------------------------------------------------------------  727

Query 815  HNISNGSALVVQEPPREKQRKVNFVTDIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLES  888
                                                                 ||||||||||||||||||||
Sbjct 728  ------------------------------------------------------EEVARQQAAGPLERNIQLES  747

Query 889  RGLASRGDLSIPGLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSSIDYDLN  962
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Sbjct 748  RGLASRGDLSIPGLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSSIDYDLN  821

Query 963  LPDTVTHEDYVTTRL  977
           |||||||||||||||
Sbjct 822  LPDTVTHEDYVTTRL  836