Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01721
• Subject: NM_019795.4
• Aligned Length: 1482
• Identities: 1358
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTGCCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAA  74
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||.||||.||.||
Sbjct    1  ATGGCGGCTACCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCTGAACTGCTGGAGGACGAAGACGCCAA  74

Query   75  GAGGGAAGCAGAGACTTTCAAGGAACAAGGAAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCTTATAATT  148
            ||||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  GAGGGAAGCAGAATCCTTCAAGGAACAAGGGAATGCATATTATGCTAAGAAGGACTACAACGAAGCTTATAACT  148

Query  149  ATTATACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG  222
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||
Sbjct  149  ATTACACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTAACAATGCCAGCTATTACGGTAATCGAGCGGCCACACTGATGATG  222

Query  223  CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA  296
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTGGACGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCGCAGCAGTCTGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA  296

Query  297  TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG  370
            .||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  CCTCCGAGAAGGCAAGTGCCACCTCTCACTTGGGAATGCAATGGCGGCATGTCGTAGTTTCCAAAGAGCCCTAG  370

Query  371  AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA  444
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  AACTGGATCATAAAAATGCCCAGGCACAGCAGGAGTTCAAGAACGCCAATGCCGTCATGGAGTATGAGAAAATA  444

Query  445  GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC  518
            ||||||...||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGAAGTGGATTTTGAAAAGCGAGATTTCCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC  518

Query  519  TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG  592
            ||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||
Sbjct  519  TGCCTGCCATCGATTCAAAATTCTCAAAGCAGAATGTTTAGCAATGCTTGGTCGATACCCAGAAGCACAGTTTG  592

Query  593  TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC  666
            ||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCCAGTGACATTTTACGAATGGATTCCACCAATGCTGATGCTCTGTATGTCCGGGGTCTTTGCCTTTATTAC  666

Query  667  GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG  740
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTGCAGTTTTTTGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCTTG  740

Query  741  CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT  814
            ..|.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTCGCTTGTAGAAATGCCAAAGCCCTTAAAGCCAAGAAGGAAGATGGGAATAAAGCCTTTAAGGAAGGAAATT  814

Query  815  ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC  888
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACAAGCTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCTTGGGGATAGATCCCAACAACATAAAAACAAATGCTAAACTC  888

Query  889  TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct  889  TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGCAACTGGAAGATGCCATAGAAGACTGTACAAATGCGGT  962

Query  963  GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG  1036
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct  963  GAAGCTCGATGACACTTACATCAAAGCCTACCTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAGCAGTTTGAAG  1036

Query 1037  AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG  1110
            ||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  AAGCCGTGCGGGACTATGAAAAAGTGTATCAGACGGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTTAAGAATGCA  1110

Query 1111  CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCTGGAACTGAAGAAGAGCAAGAGGAAAGATTACTACAAGATCCTGGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA  1184

Query 1185  CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG  1258
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1185  CGAGATCAAGAAAGCTTACCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCACAGTGGGGCCAGTGCCGAAG  1258

Query 1259  TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG  1332
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTTAAGGAAGTGGGAGAGGCCTTTACCATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG  1332

Query 1333  ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT  1406
            |||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1333  ACTCGTTATGACAGTGGACAGGACTTGGATGAGGAGGGCATGAATATGGGCGATTTTGATGCAAACAACATCTT  1406

Query 1407  CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG  1480
            ||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..|||||.||||
Sbjct 1407  CAAGGCATTCTTCGGTGGTCCTGGGGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGCCCAGGGAATTTCTACTTTCAGTTTG  1480

Query 1481  GC  1482
            ||
Sbjct 1481  GC  1482