Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01721
- Subject:
- XM_011525167.3
- Aligned Length:
- 1482
- Identities:
- 1314
- Gaps:
- 168
Alignment
Query 1 ATGGCGGCTGCCGCGGAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAGGGAAGCAGAGACTTTCAAGGAACAAGGAAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCTTATAATT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATTATACAAAAGCCATAGATATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------ATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATG 54
Query 223 CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 CTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACA 128
Query 297 TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 TCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAG 202
Query 371 AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 AACTGGATCATAAAAATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATA 276
Query 445 GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 GCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCC 350
Query 519 TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 TGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTG 424
Query 593 TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 TGGCTAGTGACATTCTACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTAC 498
Query 667 GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 GAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTG 572
Query 741 CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 CATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATT 646
Query 815 ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 647 ACAAACTAGCATATGAACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTC 720
Query 889 TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TACTGTAATCGGGGTACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGT 794
Query 963 GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 GAAGCTTGATGACACTTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAG 868
Query 1037 AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 AAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCG 942
Query 1111 CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 CAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGA 1016
Query 1185 CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 CGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGG 1090
Query 1259 TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 TTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAG 1164
Query 1333 ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165 ACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTT 1238
Query 1407 CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1239 CAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTG 1312
Query 1481 GC 1482
||
Sbjct 1313 GC 1314