Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01774
• Subject: XM_024449708.1
• Aligned Length: 1413
• Identities: 1290
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  ATGCCCAACAGTGAGCCCGCATCTCTGCTGGAGCTGTTCAACAGCATCGCCACACAAGGGGAGCTCGTAAGGTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTCAAAGCGGGAAATGCGTCAAAGGATGAAATTGATTCTGCAGTAAAGATGTTGGTGTCATTAAAAATGAGCT  148
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGTTGGTGTCATTAAAAATGAGCT  25

Query  149  ACAAAGCTGCCGCGGGGGAGGATTACAAGGCTGACTGTCCTCCAGGGAACCCAGCACCTACCAGTAATCATGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  ACAAAGCTGCCGCGGGGGAGGATTACAAGGCTGACTGTCCTCCAGGGAACCCAGCACCTACCAGTAATCATGGC  99

Query  223  CCAGATGCCACAGAAGCTGAAGAGGATTTTGTGGACCCATGGACAGTACAGACAAGCAGTGCAAAAGGCATAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  CCAGATGCCACAGAAGCTGAAGAGGATTTTGTGGACCCATGGACAGTACAGACAAGCAGTGCAAAAGGCATAGA  173

Query  297  CTACGATAAGCTCATTGTTCGGTTTGGAAGTAGTAAAATTGACAAAGAGCTAATAAACCGAATAGAGAGAGCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  CTACGATAAGCTCATTGTTCGGTTTGGAAGTAGTAAAATTGACAAAGAGCTAATAAACCGAATAGAGAGAGCCA  247

Query  371  CCGGCCAAAGACCACACCACTTCCTGCGCAGAGGCATCTTCTTCTCACACAGAGATATGAATCAGGTTCTTGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  CCGGCCAAAGACCACACCACTTCCTGCGCAGAGGCATCTTCTTCTCACACAGAGATATGAATCAGGTTCTTGAT  321

Query  445  GCCTATGAAAATAAGAAGCCATTTTATCTGTACACGGGCCGGGGCCCCTCTTCTGAAGCAATGCATGTAGGTCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  GCCTATGAAAATAAGAAGCCATTTTATCTGTACACGGGCCGGGGCCCCTCTTCTGAAGCAATGCATGTAGGTCA  395

Query  519  CCTCATTCCATTTATTTTCACAAAGTGGCTCCAGGATGTATTTAACGTGCCCTTGGTCATCCAGATGACGGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  CCTCATTCCATTTATTTTCACAAAGTGGCTCCAGGATGTATTTAACGTGCCCTTGGTCATCCAGATGACGGATG  469

Query  593  ACGAGAAGTATCTGTGGAAGGACCTGACCCTGGACCAGGCCTATAGCTATGCTGTGGAGAATGCCAAGGACATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  ACGAGAAGTATCTGTGGAAGGACCTGACCCTGGACCAGGCCTATAGCTATGCTGTGGAGAATGCCAAGGACATC  543

Query  667  ATCGCCTGTGGCTTTGACATCAACAAGACTTTCATATTCTCTGACCTGGACTACATGGGGATGAGCTCAGGTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  ATCGCCTGTGGCTTTGACATCAACAAGACTTTCATATTCTCTGACCTGGACTACATGGGGATGAGCTCAGGTTT  617

Query  741  CTACAAAAATGTGGTGAAGATTCAAAAGCATGTTACCTTCAACCAAGTGAAAGGCATTTTCGGCTTCACTGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  CTACAAAAATGTGGTGAAGATTCAAAAGCATGTTACCTTCAACCAAGTGAAAGGCATTTTCGGCTTCACTGACA  691

Query  815  GCGACTGCATTGGGAAGATCAGTTTTCCTGCCATCCAGGCTGCTCCCTCCTTCAGCAACTCATTCCCACAGATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  GCGACTGCATTGGGAAGATCAGTTTTCCTGCCATCCAGGCTGCTCCCTCCTTCAGCAACTCATTCCCACAGATC  765

Query  889  TTCCGAGACAGGACGGATATCCAGTGCCTTATCCCATGTGCCATTGACCAGGATCCTTACTTTAGAATGACAAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  TTCCGAGACAGGACGGATATCCAGTGCCTTATCCCATGTGCCATTGACCAGGATCCTTACTTTAGAATGACAAG  839

Query  963  GGACGTCGCCCCCAGGATCGGCTATCCTAAACCAGCCCTGCTGCACTCCACCTTCTTCCCAGCCCTGCAGGGCG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  GGACGTCGCCCCCAGGATCGGCTATCCTAAACCAGCCCTGCTGCACTCCACCTTCTTCCCAGCCCTGCAGGGCG  913

Query 1037  CCCAGACCAAAATGAGTGCCAGCGACCCCAACTCCTCCATCTTCCTCACCGACACGGCCAAGCAGATCAAAACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  CCCAGACCAAAATGAGTGCCAGCGACCCCAACTCCTCCATCTTCCTCACCGACACGGCCAAGCAGATCAAAACC  987

Query 1111  AAGGTCAATAAGCATGCGTTTTCTGGAGGGAGAGACACCATCGAGGAGCACAGGCAGTTTGGGGGCAACTGTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  AAGGTCAATAAGCATGCGTTTTCTGGAGGGAGAGACACCATCGAGGAGCACAGGCAGTTTGGGGGCAACTGTGA  1061

Query 1185  TGTGGACGTGTCTTTCATGTACCTGACCTTCTTCCTCGAGGACGACGACAAGCTCGAGCAGATCAGGAAGGATT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  TGTGGACGTGTCTTTCATGTACCTGACCTTCTTCCTCGAGGACGACGACAAGCTCGAGCAGATCAGGAAGGATT  1135

Query 1259  ACACCAGCGGAGCCATGCTCACCGGTGAGCTCAAGAAGGCACTCATAGAGGTTCTGCAGCCCTTGATCGCAGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  ACACCAGCGGAGCCATGCTCACCGGTGAGCTCAAGAAGGCACTCATAGAGGTTCTGCAGCCCTTGATCGCAGAG  1209

Query 1333  CACCAGGCCCGGCGCAAGGAGGTCACGGATGAGATAGTGAAAGAGTTCATGACTCCCCGGAAGCTGTCCTTCGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  CACCAGGCCCGGCGCAAGGAGGTCACGGATGAGATAGTGAAAGAGTTCATGACTCCCCGGAAGCTGTCCTTCGA  1283

Query 1407  CTTTCAG  1413
            |||||||
Sbjct 1284  CTTTCAG  1290