Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01806
- Subject:
- XM_017011250.2
- Aligned Length:
- 1790
- Identities:
- 1581
- Gaps:
- 187
Alignment
Query 1 ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACACGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGG 74
Query 75 AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAGGTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTAC 148
Query 149 AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGAGGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGC 222
Query 223 ACACCCAG-----------------------AGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAA 273
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACACCCAGAGGGCTAACCGCGTGTTCCCTGCAGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAA 296
Query 274 GATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGA 347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGA 370
Query 348 GGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGT 421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGT 444
Query 422 ATGCCAGCA-------------AGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGG 482
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGCCAGCAAGACTTTTCCCCCAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGG 518
Query 483 AGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATG 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATG 592
Query 557 AACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTAT 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTAT 666
Query 631 GGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGC 704
||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGACTGAAGAGCCACGTT-------------------------------------------------------- 684
Query 705 CTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTG 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 685 ----------------------------------CGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTG 724
Query 779 AGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCC 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 AGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCC 798
Query 853 TACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCA 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 799 TACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCA 872
Query 927 CACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 873 CACAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATA 946
Query 1001 AGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCC 1074
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 947 AGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCC 1020
Query 1075 ACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGA 1148
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1021 ACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCACGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGA 1094
Query 1149 GCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTT 1222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 GCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTT 1168
Query 1223 CGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAG 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 CGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAG 1242
Query 1297 GTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGC 1370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 GTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGC 1316
Query 1371 CATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTG 1444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 CATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTG 1390
Query 1445 GCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCT 1518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 GCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCT 1464
Query 1519 GTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAAC 1592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 GTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAAC 1538
Query 1593 GCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAAC------AGCAG---ACCTTAGAGG---AGGC----CATCAATGTG-GC 1649
||||||||||||||| ||| .||| .|||| |||| |.|| |.|| |||||.|.|| |.
Sbjct 1539 GCACATTGCAGTGCA---GGA-TAACTCCGATGGCAGTCCACCT--GTGGTCCAAGCCCTTCATCATTTTGTGT 1606
Query 1650 CACTG----------CGGCCATGCAGCAAGG-GGCTG-------TGACCCTGGAGACAACAGT----GTCGGAG 1701
|.||| .||..||| |||| ||||| |||.| ||.||.|| .||.|..
Sbjct 1607 CTCTGTTTCTTCATCTGGAAATG----AAGGAGGCTGACGTAGATGATC------ACCACGGTTCTCTTCAGCC 1670
Query 1702 AGTGGCTGC----- 1710
||| .||.|
Sbjct 1671 AGT-CCTTCCTCCG 1683