Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01806
- Subject:
- XR_001743621.2
- Aligned Length:
- 2848
- Identities:
- 1708
- Gaps:
- 1138
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TGGGCGCTCAGCCTCGCTGGCCATGCGTCACCCCGGCCTTGGTGGGGGCGGGGCTCCGAAGAGCTCGGTTCAGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCCGGCCGCCTGGGCTCCAGGAGCCCCGGAACCAGGATAAGTTGGATGGCTGCCGCGGCGAAGCGGGGGGCGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGTGGACCGTGCCCGGTATTTTCTATACGGGTTCCGGGGCCCGGTAGAGGCGCGCCAAGAGGAAAGGAAAGTGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGCGGCCCTGGAACCTGGATATCGCGCGAGATTTGTGACCCAGAAGGAAATCTCTGACCTCAGCTGTGGCTCTT 296
Query 1 ----------------------------------------------------ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACA 22
||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTGCTGGCCAGAAGCCAACTTCATGTCTGAGTGCACGAGCAGCAGTTTGCCATGGAGAGCTTGGGGCTGCACA 370
Query 23 CGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAG 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAG 444
Query 97 GTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGA 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGA 518
Query 171 GGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAG-------------- 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGGGCTAACCGCGT 592
Query 231 ---------AGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTC 295
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTTCCCTGCAGAAGGCTATGACCCCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTC 666
Query 296 ACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCA 369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACCACCCTGTGGCTGTGCCATCGGAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCA 740
Query 370 GCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCA------------- 430
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGAGGATGATGAGGGCTTCAGTGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGACTTTTCCCCC 814
Query 431 AGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGC 504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAAAAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGC 888
Query 505 TACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCG 578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCATCACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCG 962
Query 579 TCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTA 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGCCTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTA 1036
Query 653 CCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTG 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGGAGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTG 1110
Query 727 CAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCAC 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCGTTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCAC 1184
Query 801 CACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACT 874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCACACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACT 1258
Query 875 GTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACA--------------CAGGGG 934
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1259 GTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGAATCACGTGCGCATCCACACAGCCCAGTGTCCCCAGGGG 1332
Query 935 AGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCAC 1008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGAAACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCAC 1406
Query 1009 GTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGC 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGCACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGC 1480
Query 1083 CATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGC 1156
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CATGCACAAGCGCAGTGCCCACGGCGAGCTGGAGGCCACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGC 1554
Query 1157 AACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTG 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGCCACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTG 1628
Query 1231 AAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCT 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCGATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCT 1702
Query 1305 GATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTA 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTCCCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTA 1776
Query 1379 TGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACAT 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCCCCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACAT 1850
Query 1453 ACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGC 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACGCAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGC 1924
Query 1527 TGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTG 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTG 1998
Query 1601 CAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCT 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCT 2072
Query 1675 GTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGAGTGGCTGC-------------------------------------- 1710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGAGTGGCTGCTGAGTCCAAGAGGGCTGGGTCCCACACCATGCTGGAGG 2146
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2147 AAGTGCCATCTGCATGGCCACTCTTGCCCCCAAGGGCCCAGGCTGTGGCTGACACATAGAAGGTGGCCACATAG 2220
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2221 GTCTCTGGGGTGAGAAGACAGCAAGAAAACTGCCTAACTGAAGGGAATGGGGGCCCTGCTCAAGAAGGGGGCCA 2294
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2295 GGCAGCTGGAATCAGGGGAGTGCATCATCCTCGGGAGCTGACAACAGCCAGGCTACACCAGGGCACCCGCCTCT 2368
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2369 CAAAATCAGCTGGGCGCCCACTCTCCTCCTAAAGAACACCCTTCTGGCCCTCAGTCTGTTCCCCTTCTCAGGTA 2442
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2443 GAGATTGGGGCTGCTATGGGGACTGGCCCTGTAGGGTTGAGCCACAGACAGCTCTTCAGCCCAGTAGCAGTGGA 2516
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2517 GCAGGCCCTGTCCTGCCCTCCCAGCAATAACCACCTCCCTGGAGGCCAGCTGAGATGCCTGGCTACTTGGCACC 2590
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2591 AGGGACTTCCTGACACCACAGTCAATTAATTCCTCAGGGGCCTGTGGCTGAAGAAAAGGTGCCCAGCCCCCACC 2664
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2665 ACTCCTCAGCTGCCCCCCAACCTCTCTATGGCAGAGAGGCAGGGAGTGGCCCTGTACATAGACTGCTGGGGATT 2738
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2739 GGGTTTGATTTGTTTTGTTTTTTTTAATTCCATTTTGATAATTTTTTTCCTGCTCTGGGTGGTGGTGGCACATG 2812
Query 1711 ------------------------------------ 1710
Sbjct 2813 GATGAATGAGTATTTAATAAAAGTTCCAAATTTCCA 2848