Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01806
• Subject: XR_001743624.2
• Aligned Length: 2812
• Identities: 1708
• Gaps: 1102

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TGGGCGCTCAGCCTCGCTGGCCATGCGTCACCCCGGCCTTGGTGGGGGCGGGGCTCCGAAGAGCTCGGTTCAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCCGGCCGCCTGGGCTCCAGGAGCCCCGGAACCAGGATAAGTTGGATGGCTGCCGCGGCGAAGCGGGGGGCGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGTGGACCGTGCCCGGTATTTTCTATACGGGTTCCGGGGCCCGGTAGAGGCGCGCCAAGAGGAAAGGAAAGTGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GGCGGCCCTGGAACCTGGATATCGCGCGAGATTTGTGACCCAGAAGGAAATCTCTGACCTCAGCTGTGGCTCTT  296

Query    1  ----------------------------------------------------ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACA  22
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGCTGGCCAGAAGCCAACTTCATGTCTGAGTGCACGAGCAGCAGTTTGCCATGGAGAGCTTGGGGCTGCACA  370

Query   23  CGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAG  96
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAG  444

Query   97  GTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGA  170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGA  518

Query  171  GGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGGCTATGACC  244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGGCTATGACC  592

Query  245  CCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCG  318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCG  666

Query  319  GAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAG  392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAG  740

Query  393  TGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAA  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAA  814

Query  467  AAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCAT  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCAT  888

Query  541  CACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGC  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGC  962

Query  615  CTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGG  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGG  1036

Query  689  AGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCG  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCG  1110

Query  763  TTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCA  836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCA  1184

Query  837  CACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGA  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGA  1258

Query  911  ATCACGTGCGCATCCACA--------------CAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGA  970
            ||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCACGTGCGCATCCACACAGCCCAGTGTCCCCAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGA  1332

Query  971  AACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGC  1044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGC  1406

Query 1045  ACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCGAGCTGGAGGC  1118
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1407  ACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCACGGCGAGCTGGAGGC  1480

Query 1119  CACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGC  1192
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGC  1554

Query 1193  CACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCG  1266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCG  1628

Query 1267  ATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTC  1340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTC  1702

Query 1341  CCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCC  1414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCC  1776

Query 1415  CCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACG  1488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACG  1850

Query 1489  CAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACA  1562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAGCCCGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTCTTCGTCATCAACA  1924

Query 1563  GGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTTAGAGGAGG  1636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAGACCTTAGAGGAGG  1998

Query 1637  CCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGAGTGGCTGC  1710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTCGGAGAGTGGCTGC  2072

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2073  TGAGTCCAAGAGGGCTGGGTCCCACACCATGCTGGAGGAAGTGCCATCTGCATGGCCACTCTTGCCCCCAAGGG  2146

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2147  CCCAGGCTGTGGCTGACACATAGAAGGTGGCCACATAGGTCTCTGGGGTGAGAAGACAGCAAGAAAACTGCCTA  2220

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2221  ACTGAAGGGAATGGGGGCCCTGCTCAAGAAGGGGGCCAGGCAGCTGGAATCAGGGGAGTGCATCATCCTCGGGA  2294

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2295  GCTGACAACAGCCAGGCTACACCAGGGCACCCGCCTCTCAAAATCAGCTGGGCGCCCACTCTCCTCCTAAAGAA  2368

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2369  CACCCTTCTGGCCCTCAGTCTGTTCCCCTTCTCAGGTAGAGATTGGGGCTGCTATGGGGACTGGCCCTGTAGGG  2442

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2443  TTGAGCCACAGACAGCTCTTCAGCCCAGTAGCAGTGGAGCAGGCCCTGTCCTGCCCTCCCAGCAATAACCACCT  2516

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2517  CCCTGGAGGCCAGCTGAGATGCCTGGCTACTTGGCACCAGGGACTTCCTGACACCACAGTCAATTAATTCCTCA  2590

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2591  GGGGCCTGTGGCTGAAGAAAAGGTGCCCAGCCCCCACCACTCCTCAGCTGCCCCCCAACCTCTCTATGGCAGAG  2664

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2665  AGGCAGGGAGTGGCCCTGTACATAGACTGCTGGGGATTGGGTTTGATTTGTTTTGTTTTTTTTAATTCCATTTT  2738

Query 1711  --------------------------------------------------------------------------  1710
                                                                                      
Sbjct 2739  GATAATTTTTTTCCTGCTCTGGGTGGTGGTGGCACATGGATGAATGAGTATTTAATAAAAGTTCCAAATTTCCA  2812