Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01806
- Subject:
- XR_001743626.2
- Aligned Length:
- 2825
- Identities:
- 1708
- Gaps:
- 1115
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TGGGCGCTCAGCCTCGCTGGCCATGCGTCACCCCGGCCTTGGTGGGGGCGGGGCTCCGAAGAGCTCGGTTCAGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCCGGCCGCCTGGGCTCCAGGAGCCCCGGAACCAGGATAAGTTGGATGGCTGCCGCGGCGAAGCGGGGGGCGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGTGGACCGTGCCCGGTATTTTCTATACGGGTTCCGGGGCCCGGTAGAGGCGCGCCAAGAGGAAAGGAAAGTGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGCGGCCCTGGAACCTGGATATCGCGCGAGATTTGTGACCCAGAAGGAAATCTCTGACCTCAGCTGTGGCTCTT 296
Query 1 ----------------------------------------------------ATGGAGAGCTTGGGGCTGCACA 22
||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTGCTGGCCAGAAGCCAACTTCATGTCTGAGTGCACGAGCAGCAGTTTGCCATGGAGAGCTTGGGGCTGCACA 370
Query 23 CGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAG 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGGTGACCCTTAGTGATGGGACAACAGCCTACGTCCAGCAAGCTGTCAAAGGAGAGAAGCTTCTTGAAGGGCAG 444
Query 97 GTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGA 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGATCCAGCTCGAGGATGGGACCACCGCATACATTCACCAGGTGACGGTACAGAAAGAAGCTCTCTCCTTTGA 518
Query 171 GGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGGCTATGACC 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGATGGTCAGCCTGTGCAGCTGGAAGATGGCAGCATGGCTTACATACACCGCACACCCAGAGAAGGCTATGACC 592
Query 245 CCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCG 318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAGCACCCTGGAAGCCGTCCAACTGGAAGATGGCTCCACTGCCTACATTCACCACCCTGTGGCTGTGCCATCG 666
Query 319 GAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAG 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGAGCACCATCCTGGCCGTACAGACAGAGGTGGGCTTGGAGGACCTGGCAGCAGAGGATGATGAGGGCTTCAG 740
Query 393 TGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAA 466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCAGACGCAGTGGTGGCCCTGGAGCAGTATGCCAGCAAGGTTCTTCATGACAGCCAGATTCCCCGTAATGGAA 814
Query 467 AAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCAT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGGGCAGCAAGTTGGAGACAGAGCATTCCGCTGTGGCTACAAGGGCTGTGGGCGTCTCTACACCACCGCTCAT 888
Query 541 CACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGC 614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CACTTAAAGGTGCATGAACGAGCTCATACAGGTGACCGTCCATACAGATGTGACTTCCCCAGCTGTGGAAAGGC 962
Query 615 CTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGG 688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTTTGCCACAGGCTATGGACTGAAGAGCCACGTTCGTACCCACACTGGTGAGAAACCATACAAGTGCCCAGAGG 1036
Query 689 AGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCG 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGCTGTGCAGCAAGGCCTTCAAGACCTCAGGAGACCTGCAGAAGCATGTCCGTACCCACACTGGTGAACGCCCG 1110
Query 763 TTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCA 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTCCAGTGCCCTTTTGAGGGCTGTGGCCGCTCCTTCACCACATCTAACATCCGCAAGGTACATGTGCGCACCCA 1184
Query 837 CACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGA 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CACAGGCGAGAGGCCCTACACCTGCCCGGAGCCCCACTGTGGCCGCGGCTTCACCAGCGCCACCAACTATAAGA 1258
Query 911 ATCACGTGCGCATCCACA--------------CAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGA 970
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATCACGTGCGCATCCACACAGCCCAGTGTCCCCAGGGGAGAAGCCATACGTTTGCACGGTGCCAGGCTGCGGGA 1332
Query 971 AACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGC 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AACGCTTCACCGAGTACTCGAGCTTGTATAAGCACCACGTGGTGCACACACACTGCAAGCCCTACACCTGCAGC 1406
Query 1045 ACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCATGGCGAGCTGGAGGC 1118
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1407 ACCTGCGGCAAGACCTACCGGCAGACCTCCACCTTGGCCATGCACAAGCGCAGTGCCCACGGCGAGCTGGAGGC 1480
Query 1119 CACGGAGGAGAGTGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGC 1192
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CACGGAGGAGAGCGAGCAGGCCCTCTATGAGCAGCAGCAACTTGAGGCCGCCTCTGCAGCCGAGGAGAGTCCGC 1554
Query 1193 CACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCG 1266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CACCCAAACGACCCCGGATAGCTTACCTTTCGGAGGTGAAGGAAGAGAGAGATGACATCCCAGCCCAGGTGGCG 1628
Query 1267 ATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTC 1340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATGGTGACTGAAGAAGATGGGGCCCCCCAGGTGGCTCTGATCACTCAGGATGGTGCCCAGCAGGTCAGCCTGTC 1702
Query 1341 CCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCC 1414
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCCGGAAGACCTGCAGGCCCTGGGGAGTGCCATCAGTATGGTCACCCAGCACGGCAGCACCACCCTCACCATCC 1776
Query 1415 CCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACG 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CCAGTCCTGATGCCGACCTGGCCACATCTGGCACACATACAGTCACCATGGTCAGCGCCGATGGCACCCAGACG 1850
Query 1489 CAGCCC-------------GTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTC 1549
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAGCCCGTATGACCAGGCGGTCACAATCATTACCTCTGGGGCTGTGGTGGCTGAGGACTCAAGTGTAGCATCTC 1924
Query 1550 TTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAG 1623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTCGTCATCAACAGGTGGCACTGTTGGCCACAGCCAACGGAACGCACATTGCAGTGCAGCTGGAGGAACAGCAG 1998
Query 1624 ACCTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTC 1697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ACCTTAGAGGAGGCCATCAATGTGGCCACTGCGGCCATGCAGCAAGGGGCTGTGACCCTGGAGACAACAGTGTC 2072
Query 1698 GGAGAGTGGCTGC------------------------------------------------------------- 1710
|||||||||||||
Sbjct 2073 GGAGAGTGGCTGCTGAGTCCAAGAGGGCTGGGTCCCACACCATGCTGGAGGAAGTGCCATCTGCATGGCCACTC 2146
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2147 TTGCCCCCAAGGGCCCAGGCTGTGGCTGACACATAGAAGGTGGCCACATAGGTCTCTGGGGTGAGAAGACAGCA 2220
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2221 AGAAAACTGCCTAACTGAAGGGAATGGGGGCCCTGCTCAAGAAGGGGGCCAGGCAGCTGGAATCAGGGGAGTGC 2294
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2295 ATCATCCTCGGGAGCTGACAACAGCCAGGCTACACCAGGGCACCCGCCTCTCAAAATCAGCTGGGCGCCCACTC 2368
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2369 TCCTCCTAAAGAACACCCTTCTGGCCCTCAGTCTGTTCCCCTTCTCAGGTAGAGATTGGGGCTGCTATGGGGAC 2442
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2443 TGGCCCTGTAGGGTTGAGCCACAGACAGCTCTTCAGCCCAGTAGCAGTGGAGCAGGCCCTGTCCTGCCCTCCCA 2516
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2517 GCAATAACCACCTCCCTGGAGGCCAGCTGAGATGCCTGGCTACTTGGCACCAGGGACTTCCTGACACCACAGTC 2590
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2591 AATTAATTCCTCAGGGGCCTGTGGCTGAAGAAAAGGTGCCCAGCCCCCACCACTCCTCAGCTGCCCCCCAACCT 2664
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2665 CTCTATGGCAGAGAGGCAGGGAGTGGCCCTGTACATAGACTGCTGGGGATTGGGTTTGATTTGTTTTGTTTTTT 2738
Query 1711 -------------------------------------------------------------------------- 1710
Sbjct 2739 TTAATTCCATTTTGATAATTTTTTTCCTGCTCTGGGTGGTGGTGGCACATGGATGAATGAGTATTTAATAAAAG 2812
Query 1711 ------------- 1710
Sbjct 2813 TTCCAAATTTCCA 2825