Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01823
- Subject:
- NM_001260487.1
- Aligned Length:
- 1614
- Identities:
- 1263
- Gaps:
- 192
Alignment
Query 1 ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
Query 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC 148
||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC 148
Query 149 AACCATTCCACC------CTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA 216
||||.||||||| |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 149 AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA 222
Query 217 GAAGGAAATTCAGGCGGCAAGA------------------CTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCC 272
|||||.||||||||.||||||| ||.||.|.|||||||||.||||||||||.||..|
Sbjct 223 GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC 296
Query 273 TTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACT 346
.||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||..||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 297 CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT 370
Query 347 TCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCA 420
||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC 444
Query 421 CAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGA 494
|||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||..||||||.|||
Sbjct 445 CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA 518
Query 495 GAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTC 568
|||||||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||.||||||||.|
Sbjct 519 GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC 592
Query 569 ACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGT 642
||.||.||||||||||||.||.||||||..||.||||.||||||||.|||||.||||||..|||||||||||.|
Sbjct 593 ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT 666
Query 643 GAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACT 716
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||.|...|||
Sbjct 667 CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT 740
Query 717 TCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACG 790
|.|.|||||..|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||..||||||||.||||||||||||.|
Sbjct 741 TAATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG 814
Query 791 ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC 864
|||.|||||||.||.|||||.|||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct 815 ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC 888
Query 865 TTCTGCCTTAGGTCAAG--------------------------------------------------------- 881
||||...||||||||||
Sbjct 889 TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATG 962
Query 882 ---------------------------TCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAAT 928
.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 963 TGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGAT 1036
Query 929 CTGAGGAGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAA 1002
.||||.||||||||||||||||.|.||.|||.||||||||..|||||||||||.|..|.|||||||||.|||||
Sbjct 1037 GTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAA 1110
Query 1003 CCGTACAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAG 1076
||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 1111 CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAG 1184
Query 1077 TGGAGAAAAA---------------------------------------------------------------- 1086
||||||||||
Sbjct 1185 TGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGAAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGA 1258
Query 1087 --------------------CCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAAC 1140
|||||.|.||||||||||||||||||||||||..|||.|||||....||||.||
Sbjct 1259 GATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGAC 1332
Query 1141 TTGCACCAGAGGGTCCATACTGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTC 1214
|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 1333 TTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTC 1406
Query 1215 AAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTG 1288
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1407 AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTG 1480
Query 1289 TACACCGGTCTTTCTGTAAAGACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGG 1362
|||||.||.|.|.|.||||||||||.|...|||||.|.|.|||.||||||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481 TACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGG 1554
Query 1363 AAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG 1422
|..||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.|..
Sbjct 1555 AGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATTTCTAAATGACACA 1614