Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01823
• Subject: NM_003445.3
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1263
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74

Query   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148

Query  149  AACCATTCCACC------CTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA  216
            ||||.|||||||      |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  149  AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA  222

Query  217  GAAGGAAATTCAGGCGGCAAGA------------------CTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCC  272
            |||||.||||||||.|||||||                  ||.||.|.|||||||||.||||||||||.||..|
Sbjct  223  GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC  296

Query  273  TTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACT  346
            .||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||..||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  297  CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT  370

Query  347  TCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCA  420
            ||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC  444

Query  421  CAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGA  494
            |||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||..||||||.|||
Sbjct  445  CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA  518

Query  495  GAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTC  568
            |||||||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||.||||||||.|
Sbjct  519  GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC  592

Query  569  ACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGT  642
            ||.||.||||||||||||.||.||||||..||.||||.||||||||.|||||.||||||..|||||||||||.|
Sbjct  593  ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT  666

Query  643  GAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACT  716
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||.|...|||
Sbjct  667  CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT  740

Query  717  TCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACG  790
            |.|.|||||..|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||..||||||||.||||||||||||.|
Sbjct  741  TAATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG  814

Query  791  ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC  864
            |||.|||||||.||.|||||.|||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  815  ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC  888

Query  865  TTCTGCCTTAGGTCAAG---------------------------------------------------------  881
            ||||...||||||||||                                                         
Sbjct  889  TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATG  962

Query  882  ---------------------------TCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAAT  928
                                       .||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  963  TGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGAT  1036

Query  929  CTGAGGAGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAA  1002
            .||||.||||||||||||||||.|.||.|||.||||||||..|||||||||||.|..|.|||||||||.|||||
Sbjct 1037  GTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAA  1110

Query 1003  CCGTACAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAG  1076
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 1111  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAG  1184

Query 1077  TGGAGAAAAA----------------------------------------------------------------  1086
            ||||||||||                                                                
Sbjct 1185  TGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGAAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGA  1258

Query 1087  --------------------CCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAAC  1140
                                |||||.|.||||||||||||||||||||||||..|||.|||||....||||.||
Sbjct 1259  GATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGAC  1332

Query 1141  TTGCACCAGAGGGTCCATACTGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTC  1214
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 1333  TTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTC  1406

Query 1215  AAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTG  1288
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1407  AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTG  1480

Query 1289  TACACCGGTCTTTCTGTAAAGACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGG  1362
            |||||.||.|.|.|.||||||||||.|...|||||.|.|.|||.||||||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  TACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGG  1554

Query 1363  AAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG  1422
            |..||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.|..
Sbjct 1555  AGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATTTCTAAATGACACA  1614