Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01823
• Subject: XM_017027260.2
• Aligned Length: 1426
• Identities: 1034
• Gaps: 239

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AACCATTCCACCCTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGAGAAGGA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AATTCAGGCGGCAAGACTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAAC  296
                 |.|    ||||||.||.|.|||||||||||||||||||..||..|.||||||||.|||||||||.|||.
Sbjct    1  -----ATG----AAGACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGGGTGGTCCTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAAT  65

Query  297  TGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACTTCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCT  370
            |||||||||.||||||..|.||||||||||.|.||||||.|..|||||.|||||||||||.|||||||.||.||
Sbjct   66  TGCAAGTGATTTAACCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGTTCTTTGAACAGGGTGATGCCCACT  139

Query  371  CCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCACAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCC  444
            ||||||||||||.|||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..|...|||||||||||||||.|||
Sbjct  140  CCCAGGTTGAGGAAGGACTATCTATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCCAATTGTGGGAAGTGTAAACAATCC  213

Query  445  TTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGAGAAGTCTCATACATGCAATGAGTG  518
            |||||||||.|..||||||||||||.|||||||||..|.|.|||||.|||||||||||||.|.||..|||||||
Sbjct  214  TTCAGTGATATGTCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGAGAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTG  287

Query  519  TGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTCACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGT  592
            |||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||.|||.||.||||||||||||.|||||
Sbjct  288  TGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCGCTTCATATTCATCAGAGAGTCCACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGT  361

Query  593  GTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGTGAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAA  666
            |||||.||.||||||||||||||||||||||.|.|..|||||||||||.|.||||||||||.||||||||||||
Sbjct  362  GTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTTACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAA  435

Query  667  CCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACTTCAAGTTCACTGCAAATTACACAC  740
            ||.|||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||.|...||||..||||||.|||||||||||||.
Sbjct  436  CCTTTCAAATGTGAACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTACAGTTCATTGCAAATTACACAT  509

Query  741  AGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGA  814
            .||||||||||.|||||.|||||||..|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  GGGAGAGAAACATTATAATTGTGAGGCATGTGGGAGGGCCTTCATTCATGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGA  583

Query  815  TAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGCCTTAGGTCAAGTCTTAAT  888
            .||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.||..|||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  584  GAATTCACACAGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAGATATGTAGTGTGAGCTTCCGTCTTAGGTCAAGTCTTAAT  657

Query  889  AGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAA----TCTGAGGAGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATA  958
            ||||||||..||||||||||||.|.||||||    ||||    .|||.|||.|.||||||||||||||.|..||
Sbjct  658  AGGCATTGTGTGGTCCACACAGGAAAGAAAC----CAAACAGCACTGGGGAATATGGAAAAGGCTTCATTCGTA  727

Query  959  GCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAACCGTACAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGC  1032
            |.||.||||||..|||||||||||..||.|||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  GGCTGGATTTGTGTAAGCATCAGACGATCCACACAGGAGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGC  801

Query 1033  TTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATACAGATGTGAGGAGTG  1106
            ||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||.|||||||.||||||..||||
Sbjct  802  TTCAGACGGTCCTCCTATCTTTTGATCCATCAGCGAGTCCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGACAAGTG  875

Query 1107  TGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAACTTGCACCAGAGGGTCCATACTGGAGAGAGACCTTATAATT  1180
            |||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||||.||.|.|||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  876  TGGGAAGAGCTACATTACTAAGTCAGGTCTTGACTTGCACCATAGAGCCCACACAGGAGAGAGACCTTATAACT  949

Query 1181  GTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTCAAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAA  1254
            ||.|.||.|||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||||||
Sbjct  950  GTGATGACTGTGGGAAGAGCTTTAGACAGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAA  1023

Query 1255  CCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTGTACACCGGTCTTTCTGTAAAGACCAACAAGGAGACCACAA  1328
            ||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.|.|.||||||||||||||..|.||||||.
Sbjct 1024  CCATTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAAGCTTGTATACCGGTCATACCGTAAAGACCAACAAAAAAACCACAG  1097

Query 1329  TGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTAT  1402
            |||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1098  TGGAGAAAATCCATCCAAATGTGAAGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTTGATATAATTTTAT  1171

Query 1403  CATTATTTTTAAATGATATG  1422
            ||||||||||||||||.|.|
Sbjct 1172  CATTATTTTTAAATGACACG  1191