Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01823
• Subject: XM_024451694.1
• Aligned Length: 1647
• Identities: 1259
• Gaps: 225

Alignment

Query    1  ATGACCA-------CA----------------TTCA----------AGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGC  41
            ||||..|       ||                ||||          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATAAAGAGAAGCAAAGTACTTGTATTCTGTTCAAAGATTATGGAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGC  74

Query   42  TGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTG  115
            ||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|
Sbjct   75  TGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGG  148

Query  116  AGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATCAACCATTCCACC------CTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAA  183
            |||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|||||||      |||.|||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAA  222

Query  184  AAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGAGAAGGAAATTCAGGCGGCAAGA------------------C  239
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||                  |
Sbjct  223  AAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTC  296

Query  240  TATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCC  313
            |.||.|.|||||||||.||||||||||.||..|.||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||.
Sbjct  297  TGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCCTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCA  370

Query  314  AGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACTTCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGA  387
            .||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  GGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGA  444

Query  388  CTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCACAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCAT  461
            |||.|.|.||||||||||||||||||||||||.|||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  445  CTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCCCAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCATCAGTGATGTTCCCAT  518

Query  462  CTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGAGAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTT  535
            ||||||||.||||||||||||..||||||.||||||||||.|||||||..|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  519  CTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTT  592

Query  536  ACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTCACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAG  609
            |||||||||||||||.|.||||.||||||||.|||.||.||||||||||||.||.||||||..||.||||.|||
Sbjct  593  ACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCCACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAG  666

Query  610  GAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGTGAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCA  683
            |||||.|||||.||||||..|||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCA  740

Query  684  ATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACTTCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATA  757
            ||||||||||||.|||||..|||||.|...||||.|.|||||..|.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  ATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTTAATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACA  814

Query  758  TTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAG  831
            ||||||||..||||||||.||||||||||||.||||.|||||||.||.|||||.|||.|||.||||||||||||
Sbjct  815  TTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAG  888

Query  832  AAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGCCTTAGGTCAAG------------------------  881
            ||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||...||||||||||                        
Sbjct  889  AAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCTTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCA  962

Query  882  ------------------------------------------------------------TCTTAATAGGCATT  895
                                                                        .|||||||||||||
Sbjct  963  CACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATT  1036

Query  896  GCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGAGGAGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTG  969
            |||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||.||||||||||||||||.|.||.|||.||||||||.
Sbjct 1037  GCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATGTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTT  1110

Query  970  CATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAACCGTACAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTC  1043
            .|||||||||||.|..|.|||||||||.|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAAAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTC  1184

Query 1044  CTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAGTGGAGAAAAA-------------------------------  1086
            |||||..|||||||.||||||||||.|||||||||||||||||                               
Sbjct 1185  CTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGTGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGAAAGGGAT  1258

Query 1087  -----------------------------------------------------CCATACAGATGTGAGGAGTGT  1107
                                                                 |||||.|.|||||||||||||
Sbjct 1259  TTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGT  1332

Query 1108  GGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAACTTGCACCAGAGGGTCCATACTGGAGAGAGACCTTATAATTG  1181
            |||||||||||..|||.|||||....||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTG  1406

Query 1182  TAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTCAAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAAC  1255
            |||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1407  TAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAAC  1480

Query 1256  CCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTGTACACCGGTCTTTCTGTAAAGACCAACAAGGAGACCACAAT  1329
            |.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||.|.|.|.||||||||||.|...|||||.|.|.|
Sbjct 1481  CATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTGTACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGT  1554

Query 1330  GGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATC  1403
            ||.||||||.||||||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1555  GGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATC  1628

Query 1404  ATTATTTTTAAATGATATG  1422
            |||||||.|||||||.|..
Sbjct 1629  ATTATTTCTAAATGACACA  1647