Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01845
• Subject: XM_017011299.2
• Aligned Length: 1140
• Identities: 960
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  ATGTTGGTGATACCCCCCGGACTGAGCGAGGAAGAGGAGGCTCTGCAGAAGAAATTCAACAAGCTCAAGAAAAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAAAAGGCATTGCTGGCTCTGAAGAAGCAAAGTAGCAGCAGCACAACCAGCCAAGGTGGTGTCAAACGCTCAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TATCAGAGCAGCCTGTCATGGACACAGCCACAGCAACAGAGCAGGCAAAGCAGCTGGTGAAGTCAGGAGCCATC  222
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------ATGGACACAGCCACAGCAACAGAGCAGGCAAAGCAGCTGGTGAAGTCAGGAGCCATC  57

Query  223  AGTGCCATCAAGGCTGAGACCAAGAACTCAGGCTTCAAGCGTTCTCGAACCCTTGAGGGGAAGTTAAAGGACCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   58  AGTGCCATCAAGGCTGAGACCAAGAACTCAGGCTTCAAGCGTTCTCGAACCCTTGAGGGGAAGTTAAAGGACCC  131

Query  297  CGAGAAGGGACCAGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATATCTGCTGATGATGACCTGCAAGAGTCAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  132  CGAGAAGGGACCAGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATATCTGCTGATGATGACCTGCAAGAGTCAT  205

Query  371  CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAGAGCTTTGTGTCTTCTAGTGATCGACTTCGAGAACTAGGACCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  206  CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAG---------------AGTGATCGACTTCGAGAACTAGGACCA  264

Query  445  GATGGAGAAGAGGCAGAGGGCCCAGGGGCTGGTGATGGTCCCCCTCGAAGCTTTGACTGGGGCTATGAAGAACG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  265  GATGGAGAAGAGGCAGAGGGCCCAGGGGCTGGTGATGGTCCCCCTCGAAGCTTTGACTGGGGCTATGAAGAACG  338

Query  519  CAGTGGTGCCCACTCCTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCCGGGACCGCAGCCATGAGAGGAACCGGGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339  CAGTGGTGCCCACTCCTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCCGGGACCGCAGCCATGAGAGGAACCGGGACA  412

Query  593  GAGACCGAGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGGGATCGAGACAGAGACAGAGAGCGGGACAGGGATCGGGATCGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  413  GAGACCGAGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGGGATCGAGACAGAGACAGAGAGCGGGACAGGGATCGGGATCGG  486

Query  667  GATCGAGATCGAGACCGGGAACGGGACAGGGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGAGACCGAGAGGGTCCTTTCCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  487  GATCGAGATCGAGACCGGGAACGGGACAGGGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGAGACCGAGAGGGTCCTTTCCG  560

Query  741  CAGGTCGGATTCATTCCCTGAACGGCGAGCCCCTAGGAAAGGGAATACTCTCTATGTATATGGAGAAGACATGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  561  CAGGTCGGATTCATTCCCTGAACGGCGAGCCCCTAGGAAAGGGAATACTCTCTATGTATATGGAGAAGACATGA  634

Query  815  CACCCACCCTTCTCCGTGGGGCCTTCTCTCCTTTTGGAAACATCATTGACCTCTCCATGGACCCACCCAGAAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  635  CACCCACCCTTCTCCGTGGGGCCTTCTCTCCTTTTGGAAACATCATTGACCTCTCCATGGACCCACCCAGAAAC  708

Query  889  TGTGCCTTCGTCACCTATGAAAAGATGGAGTCAGCAGATCAGGCCGTTGCTGAGCTCAACGGGACCCAGGTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  TGTGCCTTCGTCACCTATGAAAAGATGGAGTCAGCAGATCAGGCCGTTGCTGAGCTCAACGGGACCCAGGTGGA  782

Query  963  GTCTGTACAGCTCAAAGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGATGCCGCTACTGGCAAGTCTGTCTGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  GTCTGTACAGCTCAAAGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGATGCCGCTACTGGCAAGTCTGTCTGGG  856

Query 1037  GCTCCCTCGCTGTCCAGAACAGCCCTAAGGGTTGCCACCGGGACAAGAGGACCCAGATTGTCTACAGTGATGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  857  GCTCCCTCGCTGTCCAGAACAGCCCTAAGGGTTGCCACCGGGACAAGAGGACCCAGATTGTCTACAGTGATGAC  930

Query 1111  GTCTACAAGGAAAACCTTGTGGATGGCTTC  1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  931  GTCTACAAGGAAAACCTTGTGGATGGCTTC  960