Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01884
- Subject:
- XM_005274327.3
- Aligned Length:
- 2058
- Identities:
- 1743
- Gaps:
- 312
Alignment
Query 1 ATGTCCGGCCAGAGCCTGACGGACCGAATCACTGCCGCCCAGCACAGTGTCACCGGCTCTGCCGTATCCAAGAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCCGGCCAGAGCCTGACGGACCGAATCACTGCCGCCCAGCACAGTGTCACCGGCTCTGCCGTATCCAAGAC 74
Query 75 AGTATGCAAGGCCACGACCCACGAGATCATGGGGCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTACTTAATTCAGTGCACAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTATGCAAGGCCACGACCCACGAGATCATGGGGCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTACTTAATTCAGTGCACAA 148
Query 149 ATGAGATGAATGTGAACATCCCACAGTTGGCAGACAGTTTATTTGAAAGAACTACTAATAGTAGTTGGGTGGTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGAGATGAATGTGAACATCCCACAGTTGGCAGACAGTTTATTTGAAAGAACTACTAATAGTAGTTGGGTGGTG 222
Query 223 GTCTTCAAATCTCTCATTACAACTCATCATTTGATGGTGTATGGAAATGAGCGTTTTATTCAGTATTTGGCTTC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTCTTCAAATCTCTCATTACAACTCATCATTTGATGGTGTATGGAAATGAGCGTTTTATTCAGTATTTGGCTTC 296
Query 297 AAGAAACACGTTGTTTAACTTAAGCAATTTTTTGGATAAAAGTGGATTGCAAGGATATGACATGTCTACATTTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGAAACACGTTGTTTAACTTAAGCAATTTTTTGGATAAAAGTGGATTGCAAGGATATGACATGTCTACATTTA 370
Query 371 TTAGGCGGTATAGTAGATATTTAAATGAGAAAGCAGTTTCATACAGACAAGTTGCATTTGATTTCACAAAAGTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTAGGCGGTATAGTAGATATTTAAATGAGAAAGCAGTTTCATACAGACAAGTTGCATTTGATTTCACAAAAGTG 444
Query 445 AAGAGAGGGGCTGATGGAGTTATGAGAACAATGAACACAGAAAAACTCCTAAAAACTGTACCAATTATTCAGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGAGAGGGGCTGATGGAGTTATGAGAACAATGAACACAGAAAAACTCCTAAAAACTGTACCAATTATTCAGAA 518
Query 519 TCAGATGGATGCACTTCTTGATTTTAATGTTAATAGCAATGAACTTACAAATGGGGTAATAAATGCTGCCTTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCAGATGGATGCACTTCTTGATTTTAATGTTAATAGCAATGAACTTACAAATGGGGTAATAAATGCTGCCTTCA 592
Query 593 TGCTCCTGTTCAAAGATGCCATTAGACTGTTTGCAGCATACAATGAAGGAATTATTAATTTGTTGGAAAAATAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCTCCTGTTCAAAGATGCCATTAGACTGTTTGCAGCATACAATGAAGGAATTATTAATTTGTTGGAAAAATAT 666
Query 667 TTTGATATGAAAAAGAACCAATGCAAAGAAGGTCTTGACATCTATAAGAAGTTCCTAACTAGGATGACAAGAAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTTGATATGAAAAAGAACCAATGCAAAGAAGGTCTTGACATCTATAAGAAGTTCCTAACTAGGATGACAAGAAT 740
Query 741 CTCAGAGTTCCTCAAAGTTGCAGAGCAAGTTGGAATTGACAGAGGTGATATACCAGACCTTTCACAGGCCCCTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTCAGAGTTCCTCAAAGTTGCAGAGCAAGTTGGAATTGACAGAGGTGATATACCAGACCTTTCACAGGCCCCTA 814
Query 815 GCAGTCTTCTTGATGCTTTGGAACAACATTTAGCTTCCTTGGAAGGAAAGAAAATCAAAGATTCTACAGCTGCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCAGTCTTCTTGATGCTTTGGAACAACATTTAGCTTCCTTGGAAGGAAAGAAAATCAAAGATTCTACAGCTGCA 888
Query 889 AGCAGGGCAACTACACTTTCCAATGCAGTGTCTTCCCTGGCAAGCACTGGTCTATCTCTGACCAAAGTGGATGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGCAGGGCAACTACACTTTCCAATGCAGTGTCTTCCCTGGCAAGCACTGGTCTATCTCTGACCAAAGTGGATGA 962
Query 963 AAGGGAAAAGCAGGCAGCATTAGAGGAAGAACAGGCACGTTTGAAAGCTTTAAAGGAACAGCGCCTAAAAGAAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAGGGAAAAGCAGGCAGCATTAGAGGAAGAACAGGCACGTTTGAAAGCTTTAAAGGAACAGCGCCTAAAAGAAC 1036
Query 1037 TTGCAAAGAAACCTCATACCTCTTTAACAACTGCAGCCTCTCCTGTATCCACCTCAGCAGGAGGGATAATGACT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGCAAAGAAACCTCATACCTCTTTAACAACTGCAGCCTCTCCTGTATCCACCTCAGCAGGAGGGATAATGACT 1110
Query 1111 GCACCAGCCATTGACATATTTTCTACCCCTAGTTCTTCTAACAGCACATCAAAGCTGCCCAATGATCTGCTTGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCACCAGCCATTGACATATTTTCTACCCCTAGTTCTTCTAACAGCACATCAAAGCTGCCCAATGATCTGCTTGA 1184
Query 1185 TTTGCAGCAGCCAACTTTTCACCCATCTGTACATCCTATGTCAACTGCTTCTCAGGTAGCAAGTACATGGGGA- 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTTGCAGCAGCCAACTTTTCACCCATCTGTACATCCTATGTCAACTGCTTCTCAGGTAGCAAGTACATGGGGAG 1258
Query 1258 -------------------------------------------------------------------------- 1257
Sbjct 1259 ATCCTTTCTCTGCTACTGTAGATGCTGTTGATGATGCCATTCCAAGCTTAAATCCTTTCCTCACAAAAAGTAGT 1332
Query 1258 -------------------------------------------------------------------------- 1257
Sbjct 1333 GGTGATGTTCACCTTTCCATTTCTTCAGATGTATCTACTTTTACTACTAGGACACCTACTCATGAAATGTTTGT 1406
Query 1258 -GGATTCACTCCTTCTCCAGTTGCACAGCCACACCCTTCAGCTGGCCTTAATGTTGACTTTGAATCTGTGTTTG 1330
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGGATTCACTCCTTCTCCAGTTGCACAGCCACACCCTTCAGCTGGCCTTAATGTTGACTTTGAATCTGTGTTTG 1480
Query 1331 GAAATAAATCTACAAATGTTATTGTAGATTCTGGGGGCTTTGATGAACTAGGTGGACTTCTCAAACCAACAGTG 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GAAATAAATCTACAAATGTTATTGTAGATTCTGGGGGCTTTGATGAACTAGGTGGACTTCTCAAACCAACAGTG 1554
Query 1405 GCCTCTCAGAACCAGAACCTTCCTGTTGCCAAACTCCCACCTAGCAAGTTAGTATCTGATGACTTGGATTCATC 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCCTCTCAGAACCAGAACCTTCCTGTTGCCAAACTCCCACCTAGCAAGTTAGTATCTGATGACTTGGATTCATC 1628
Query 1479 TTTAGCCAACCTTGTGGGCAATCTTGGCATCGGAAATGGAACCACTAAGAATGATGTAAATTGGAGTCAACCAG 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTTAGCCAACCTTGTGGGCAATCTTGGCATCGGAAATGGAACCACTAAGAATGATGTAAATTGGAGTCAACCAG 1702
Query 1553 GTGAAAAGAAGTTAACTGGGGGATCTAACTGGCAACCAAAGGTTGCACCAACAACCGCTTGGAATGCTGCAACA 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTGAAAAGAAGTTAACTGGGGGATCTAACTGGCAACCAAAGGTTGCACCAACAACCGCTTGGAATGCTGCAACA 1776
Query 1627 ATGAATGGCATGCATTTTCCACAATACGCACCCCCTGTAATGGCCTATCCTGCTACTACACCAACAGGCATGAT 1700
|||
Sbjct 1777 ATG----------------------------------------------------------------------- 1779
Query 1701 AGGATATGGAATTCCTCCACAAATGGGAAGTGTTCCTGTAATGACGCAACCAACCTTAATATACAGCCAGCCTG 1774
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1780 -------------CCTCCACAAATGGGAAGTGTTCCTGTAATGACGCAACCAACCTTAATATACAGCCAGCCTG 1840
Query 1775 TCATGAGACCTCCAAACCCCTTTGGCCCTGTATCAGGAGCACAGAT--------------------------AC 1822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| ||
Sbjct 1841 TCATGAGACCTCCAAACCCCTTTGGCCCTGTATCAGGAGCACAGCTGTCGGCAGCATCCAGCCCCTCCAGTCAC 1914
Query 1823 AGT-----------TTATG----------------------------------------- 1830
||| ||..|
Sbjct 1915 AGTCCTCACAGAGCTTCAGGAAAGGACCCCTTTGCAGAGCTCTCTTTGGAGGATTTCTTA 1974