Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01884
• Subject: XM_005274332.3
• Aligned Length: 1908
• Identities: 1812
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGTCCGGCCAGAGCCTGACGGACCGAATCACTGCCGCCCAGCACAGTGTCACCGGCTCTGCCGTATCCAAGAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCGGCCAGAGCCTGACGGACCGAATCACTGCCGCCCAGCACAGTGTCACCGGCTCTGCCGTATCCAAGAC  74

Query   75  AGTATGCAAGGCCACGACCCACGAGATCATGGGGCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTACTTAATTCAGTGCACAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTATGCAAGGCCACGACCCACGAGATCATGGGGCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTACTTAATTCAGTGCACAA  148

Query  149  ATGAGATGAATGTGAACATCCCACAGTTGGCAGACAGTTTATTTGAAAGAACTACTAATAGTAGTTGGGTGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAGATGAATGTGAACATCCCACAGTTGGCAGACAGTTTATTTGAAAGAACTACTAATAGTAGTTGGGTGGTG  222

Query  223  GTCTTCAAATCTCTCATTACAACTCATCATTTGATGGTGTATGGAAATGAGCGTTTTATTCAGTATTTGGCTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCTTCAAATCTCTCATTACAACTCATCATTTGATGGTGTATGGAAATGAGCGTTTTATTCAGTATTTGGCTTC  296

Query  297  AAGAAACACGTTGTTTAACTTAAGCAATTTTTTGGATAAAAGTGGATTGCAAGGATATGACATGTCTACATTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAAACACGTTGTTTAACTTAAGCAATTTTTTGGATAAAAGTGGATTGCAAGGATATGACATGTCTACATTTA  370

Query  371  TTAGGCGGTATAGTAGATATTTAAATGAGAAAGCAGTTTCATACAGACAAGTTGCATTTGATTTCACAAAAGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTAGGCGGTATAGTAGATATTTAAATGAGAAAGCAGTTTCATACAGACAAGTTGCATTTGATTTCACAAAAGTG  444

Query  445  AAGAGAGGGGCTGATGGAGTTATGAGAACAATGAACACAGAAAAACTCCTAAAAACTGTACCAATTATTCAGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAGAGGGGCTGATGGAGTTATGAGAACAATGAACACAGAAAAACTCCTAAAAACTGTACCAATTATTCAGAA  518

Query  519  TCAGATGGATGCACTTCTTGATTTTAATGTTAATAGCAATGAACTTACAAATGGGGTAATAAATGCTGCCTTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGATGGATGCACTTCTTGATTTTAATGTTAATAGCAATGAACTTACAAATGGGGTAATAAATGCTGCCTTCA  592

Query  593  TGCTCCTGTTCAAAGATGCCATTAGACTGTTTGCAGCATACAATGAAGGAATTATTAATTTGTTGGAAAAATAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTCCTGTTCAAAGATGCCATTAGACTGTTTGCAGCATACAATGAAGGAATTATTAATTTGTTGGAAAAATAT  666

Query  667  TTTGATATGAAAAAGAACCAATGCAAAGAAGGTCTTGACATCTATAAGAAGTTCCTAACTAGGATGACAAGAAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGATATGAAAAAGAACCAATGCAAAGAAGGTCTTGACATCTATAAGAAGTTCCTAACTAGGATGACAAGAAT  740

Query  741  CTCAGAGTTCCTCAAAGTTGCAGAGCAAGTTGGAATTGACAGAGGTGATATACCAGACCTTTCACAGGCCCCTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCAGAGTTCCTCAAAGTTGCAGAGCAAGTTGGAATTGACAGAGGTGATATACCAGACCTTTCACAGGCCCCTA  814

Query  815  GCAGTCTTCTTGATGCTTTGGAACAACATTTAGCTTCCTTGGAAGGAAAGAAAATCAAAGATTCTACAGCTGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGTCTTCTTGATGCTTTGGAACAACATTTAGCTTCCTTGGAAGGAAAGAAAATCAAAGATTCTACAGCTGCA  888

Query  889  AGCAGGGCAACTACACTTTCCAATGCAGTGTCTTCCCTGGCAAGCACTGGTCTATCTCTGACCAAAGTGGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCAGGGCAACTACACTTTCCAATGCAGTGTCTTCCCTGGCAAGCACTGGTCTATCTCTGACCAAAGTGGATGA  962

Query  963  AAGGGAAAAGCAGGCAGCATTAGAGGAAGAACAGGCACGTTTGAAAGCTTTAAAGGAACAGCGCCTAAAAGAAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGGGAAAAGCAGGCAGCATTAGAGGAAGAACAGGCACGTTTGAAAGCTTTAAAGGAACAGCGCCTAAAAGAAC  1036

Query 1037  TTGCAAAGAAACCTCATACCTCTTTAACAACTGCAGCCTCTCCTGTATCCACCTCAGCAGGAGGGATAATGACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGCAAAGAAACCTCATACCTCTTTAACAACTGCAGCCTCTCCTGTATCCACCTCAGCAGGAGGGATAATGACT  1110

Query 1111  GCACCAGCCATTGACATATTTTCTACCCCTAGTTCTTCTAACAGCACATCAAAGCTGCCCAATGATCTGCTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCACCAGCCATTGACATATTTTCTACCCCTAGTTCTTCTAACAGCACATCAAAGCTGCCCAATGATCTGCTTGA  1184

Query 1185  TTTGCAGCAGCCAACTTTTCACCCATCTGTACATCCTATGTCAACTGCTTCTCAGGTAGCAAGTACATGGGGAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTGCAGCAGCCAACTTTTCACCCATCTGTACATCCTATGTCAACTGCTTCTCAGGTAGCAAGTACATGGGGAG  1258

Query 1259  GATTCACTCCTTCTCCAGTTGCACAGCCACACCCTTCAGCTGGCCTTAATGTTGACTTTGAATCTGTGTTTGGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GATTCACTCCTTCTCCAGTTGCACAGCCACACCCTTCAGCTGGCCTTAATGTTGACTTTGAATCTGTGTTTGGA  1332

Query 1333  AATAAATCTACAAATGTTATTGTAGATTCTGGGGGCTTTGATGAACTAGGTGGACTTCTCAAACCAACAGTGGC  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATAAATCTACAAATGTTATTGTAGATTCTGGG---------------GGTGGACTTCTCAAACCAACAGTGGC  1391

Query 1407  CTCTCAGAACCAGAACCTTCCTGTTGCCAAACTCCCACCTAGCAAGTTAGTATCTGATGACTTGGATTCATCTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392  CTCTCAGAACCAGAACCTTCCTGTTGCCAAACTCCCACCTAGCAAGTTAGTATCTGATGACTTGGATTCATCTT  1465

Query 1481  TAGCCAACCTTGTGGGCAATCTTGGCATCGGAAATGGAACCACTAAGAATGATGTAAATTGGAGTCAACCAGGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466  TAGCCAACCTTGTGGGCAATCTTGGCATCGGAAATGGAACCACTAAGAATGATGTAAATTGGAGTCAACCAGGT  1539

Query 1555  GAAAAGAAGTTAACTGGGGGATCTAACTGGCAACCAAAGGTTGCACCAACAACCGCTTGGAATGCTGCAACAAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540  GAAAAGAAGTTAACTGGGGGATCTAACTGGCAACCAAAGGTTGCACCAACAACCGCTTGGAATGCTGCAACAAT  1613

Query 1629  GAATGGCATGCATTTTCCACAATACGCACCCCCTGTAATGGCCTATCCTGCTACTACACCAACAGGCATGATAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614  GAATGGCATGCATTTTCCACAATACGCACCCCCTGTAATGGCCTATCCTGCTACTACACCAACAGGCATGATAG  1687

Query 1703  GATATGGAATTCCTCCACAAATGGGAAGTGTTCCTGTAATGACGCAACCAACCTTAATATACAGCCAGCCTGTC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688  GATATGGAATTCCTCCACAAATGGGAAGTGTTCCTGTAATGACGCAACCAACCTTAATATACAGCCAGCCTGTC  1761

Query 1777  ATGAGACCTCCAAACCCCTTTGGCCCTGTATCAGGAGCACAGAT--------------------------ACAG  1824
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|                          ||||
Sbjct 1762  ATGAGACCTCCAAACCCCTTTGGCCCTGTATCAGGAGCACAGCTGTCGGCAGCATCCAGCCCCTCCAGTCACAG  1835

Query 1825  T-----------TTATG-----------------------------------------  1830
            |           ||..|                                         
Sbjct 1836  TCCTCACAGAGCTTCAGGAAAGGACCCCTTTGCAGAGCTCTCTTTGGAGGATTTCTTA  1893