Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01884
• Subject: XM_005274340.3
• Aligned Length: 1830
• Identities: 1639
• Gaps: 189

Alignment

Query    1  ATGTCCGGCCAGAGCCTGACGGACCGAATCACTGCCGCCCAGCACAGTGTCACCGGCTCTGCCGTATCCAAGAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCGGCCAGAGCCTGACGGACCGAATCACTGCCGCCCAGCACAGTGTCACCGGCTCTGCCGTATCCAAGAC  74

Query   75  AGTATGCAAGGCCACGACCCACGAGATCATGGGGCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTACTTAATTCAGTGCACAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTATGCAAGGCCACGACCCACGAGATCATGGGGCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTACTTAATTCAGTGCACAA  148

Query  149  ATGAGATGAATGTGAACATCCCACAGTTGGCAGACAGTTTATTTGAAAGAACTACTAATAGTAGTTGGGTGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAGATGAATGTGAACATCCCACAGTTGGCAGACAGTTTATTTGAAAGAACTACTAATAGTAGTTGGGTGGTG  222

Query  223  GTCTTCAAATCTCTCATTACAACTCATCATTTGATGGTGTATGGAAATGAGCGTTTTATTCAGTATTTGGCTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCTTCAAATCTCTCATTACAACTCATCATTTGATGGTGTATGGAAATGAGCGTTTTATTCAGTATTTGGCTTC  296

Query  297  AAGAAACACGTTGTTTAACTTAAGCAATTTTTTGGATAAAAGTGGATTGCAAGGATATGACATGTCTACATTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAAACACGTTGTTTAACTTAAGCAATTTTTTGGATAAAAGTGGATTGCAAGGATATGACATGTCTACATTTA  370

Query  371  TTAGGCGGTATAGTAGATATTTAAATGAGAAAGCAGTTTCATACAGACAAGTTGCATTTGATTTCACAAAAGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTAGGCGGTATAGTAGATATTTAAATGAGAAAGCAGTTTCATACAGACAAGTTGCATTTGATTTCACAAAAGTG  444

Query  445  AAGAGAGGGGCTGATGGAGTTATGAGAACAATGAACACAGAAAAACTCCTAAAAACTGTACCAATTATTCAGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAGAGGGGCTGATGGAGTTATGAGAACAATGAACACAGAAAAACTCCTAAAAACTGTACCAATTATTCAGAA  518

Query  519  TCAGATGGATGCACTTCTTGATTTTAATGTTAATAGCAATGAACTTACAAATGGGGTAATAAATGCTGCCTTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGATGGATGCACTTCTTGATTTTAATGTTAATAGCAATGAACTTACAAATGGGGTAATAAATGCTGCCTTCA  592

Query  593  TGCTCCTGTTCAAAGATGCCATTAGACTGTTTGCAGCATACAATGAAGGAATTATTAATTTGTTGGAAAAATAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTCCTGTTCAAAGATGCCATTAGACTGTTTGCAGCATACAATGAAGGAATTATTAATTTGTTGGAAAAATAT  666

Query  667  TTTGATATGAAAAAGAACCAATGCAAAGAAGGTCTTGACATCTATAAGAAGTTCCTAACTAGGATGACAAGAAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGATATGAAAAAGAACCAATGCAAAGAAGGTCTTGACATCTATAAGAAGTTCCTAACTAGGATGACAAGAAT  740

Query  741  CTCAGAGTTCCTCAAAGTTGCAGAGCAAGTTGGAATTGACAGAGGTGATATACCAGACCTTTCACAGGCCCCTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCAGAGTTCCTCAAAGTTGCAGAGCAAGTTGGAATTGACAGAGGTGATATACCAGACCTTTCACAGGCCCCTA  814

Query  815  GCAGTCTTCTTGATGCTTTGGAACAACATTTAGCTTCCTTGGAAGGAAAGAAAATCAAAGATTCTACAGCTGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGTCTTCTTGATGCTTTGGAACAACATTTAGCTTCCTTGGAAGGAAAGAAAATCAAAGATTCTACAGCTGCA  888

Query  889  AGCAGGGCAACTACACTTTCCAATGCAGTGTCTTCCCTGGCAAGCACTGGTCTATCTCTGACCAAAGTGGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCAGGGCAACTACACTTTCCAATGCAGTGTCTTCCCTGGCAAGCACTGGTCTATCTCTGACCAAAGTGGATGA  962

Query  963  AAGGGAAAAGCAGGCAGCATTAGAGGAAGAACAGGCACGTTTGAAAGCTTTAAAGGAACAGCGCCTAAAAGAAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGGGAAAAGCAGGCAGCATTAGAGGAAGAACAGGCACGTTTGAAAGCTTTAAAGGAACAGCGCCTAAAAGAAC  1036

Query 1037  TTGCAAAGAAACCTCATACCTCTTTAACAACTGCAGCCTCTCCTGTATCCACCTCAGCAGGAGGGATAATGACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGCAAAGAAACCTCATACCTCTTTAACAACTGCAGCCTCTCCTGTATCCACCTCAGCAGGAGGGATAATGACT  1110

Query 1111  GCACCAGCCATTGACATATTTTCTACCCCTAGTTCTTCTAACAGCACATCAAAGCTGCCCAATGATCTGCTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCACCAGCCATTGACATATTTTCTACCCCTAGTTCTTCTAACAGCACATCAAAGCTGCCCAATGATCTGCTTGA  1184

Query 1185  TTTGCAGCAGCCAACTTTTCACCCATCTGTACATCCTATGTCAACTGCTTCTCAGGTAGCAAGTACATGGGGAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTGCAGCAGCCAACTTTTCACCCATCTGTACATCCTATGTCAACTGCTTCTCAGGTAGCAAGTACATGGGGAG  1258

Query 1259  GATTCACTCCTTCTCCAGTTGCACAGCCACACCCTTCAGCTGGCCTTAATGTTGACTTTGAATCTGTGTTTGGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GATTCACTCCTTCTCCAGTTGCACAGCCACACCCTTCAGCTGGCCTTAATGTTGACTTTGAATCTGTGTTTGGA  1332

Query 1333  AATAAATCTACAAATGTTATTGTAGATTCTGGGGGCTTTGATGAACTAGGTGGACTTCTCAAACCAACAGTGGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATAAATCTACAAATGTTATTGTAGATTCTGGGGGCTTTGATGAACTAGGTGGACTTCTCAAACCAACAGTGGC  1406

Query 1407  CTCTCAGAACCAGAACCTTCCTGTTGCCAAACTCCCACCTAGCAAGTTAGTATCTGATGACTTGGATTCATCTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTCTCAGAACCAGAACCTTCCTGTTGCCAAACTCCCACCTAGCAAGTTAGTATCTGATGACTTGGATTCATCTT  1480

Query 1481  TAGCCAACCTTGTGGGCAATCTTGGCATCGGAAATGGAACCACTAAGAATGATGTAAATTGGAGTCAACCAGGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TAGCCAACCTTGTGGGCAATCTTGGCATCGGAAATGGAACCACTAAGAATGATGTAAATTGGAGTCAACCAGGT  1554

Query 1555  GAAAAGAAGTTAACTGGGGGATCTAACTGGCAACCAAAGGTTGCACCAACAACCGCTTGGAATGCTGCAACAAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAAAGAAGTTAACTGGGGGATCTAACTGGCAACCAAAGGTTGCACCAACAACCGCTTGGAATGCTGCAACAAT  1628

Query 1629  GAATGGCATGCATTTTCCACAATACGCACCCCCTGTAATGGCCTATCCTGCTACTACACCAACAGGCATGATAG  1702
            |      ||.||.|||                     |||                                  
Sbjct 1629  G------ATACAGTTT---------------------ATG----------------------------------  1641

Query 1703  GATATGGAATTCCTCCACAAATGGGAAGTGTTCCTGTAATGACGCAACCAACCTTAATATACAGCCAGCCTGTC  1776
                                                                                      
Sbjct 1642  --------------------------------------------------------------------------  1641

Query 1777  ATGAGACCTCCAAACCCCTTTGGCCCTGTATCAGGAGCACAGATACAGTTTATG  1830
                                                                  
Sbjct 1642  ------------------------------------------------------  1641