Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01884
• Subject: XM_017018381.2
• Aligned Length: 1959
• Identities: 1815
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGTCCGGCCAGAGCCTGACGGACCGAATCACTGCCGCCCAGCACAGTGTCACCGGCTCTGCCGTATCCAAGAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCGGCCAGAGCCTGACGGACCGAATCACTGCCGCCCAGCACAGTGTCACCGGCTCTGCCGTATCCAAGAC  74

Query   75  AGTATGCAAGGCCACGACCCACGAGATCATGGGGCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTACTTAATTCAGTGCACAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTATGCAAGGCCACGACCCACGAGATCATGGGGCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTACTTAATTCAGTGCACAA  148

Query  149  ATGAGATGAATGTGAACATCCCACAGTTGGCAGACAGTTTATTTGAAAGAACTACTAATAGTAGTTGGGTGGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAGATGAATGTGAACATCCCACAGTTGGCAGACAGTTTATTTGAAAGAACTACTAATAGTAGTTGGGTGGTG  222

Query  223  GTCTTCAAATCTCTCATTACAACTCATCATTTGATGGTGTATGGAAATGAGCGTTTTATTCAGTATTTGGCTTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCTTCAAATCTCTCATTACAACTCATCATTTGATGGTGTATGGAAATGAGCGTTTTATTCAGTATTTGGCTTC  296

Query  297  AAGAAACACGTTGTTTAACTTAAGCAATTTTTTGGATAAAAGTGGATTGCAAGGATATGACATGTCTACATTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAAACACGTTGTTTAACTTAAGCAATTTTTTGGATAAAAGTGGATTGCAAGGATATGACATGTCTACATTTA  370

Query  371  TTAGGCGGTATAGTAGATATTTAAATGAGAAAGCAGTTTCATACAGACAAGTTGCATTTGATTTCACAAAAGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTAGGCGGTATAGTAGATATTTAAATGAGAAAGCAGTTTCATACAGACAAGTTGCATTTGATTTCACAAAAGTG  444

Query  445  AAGAGAGGGGCTGATGGAGTTATGAGAACAATGAACACAGAAAAACTCCTAAAAACTGTACCAATTATTCAGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAGAGGGGCTGATGGAGTTATGAGAACAATGAACACAGAAAAACTCCTAAAAACTGTACCAATTATTCAGAA  518

Query  519  TCAGATGGATGCACTTCTTGATTTTAATGTTAATAGCAATGAACTTACAAATGGGGTAATAAATGCTGCCTTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGATGGATGCACTTCTTGATTTTAATGTTAATAGCAATGAACTTACAAATGGGGTAATAAATGCTGCCTTCA  592

Query  593  TGCTCCTGTTCAAAGATGCCATTAGACTGTTTGCAGCATACAATGAAGGAATTATTAATTTGTTGGAAAAATAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTCCTGTTCAAAGATGCCATTAGACTGTTTGCAGCATACAATGAAGGAATTATTAATTTGTTGGAAAAATAT  666

Query  667  TTTGATATGAAAAAGAACCAATGCAAAGAAGGTCTTGACATCTATAAGAAGTTCCTAACTAGGATGACAAGAAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGATATGAAAAAGAACCAATGCAAAGAAGGTCTTGACATCTATAAGAAGTTCCTAACTAGGATGACAAGAAT  740

Query  741  CTCAGAGTTCCTCAAAGTTGCAGAGCAAGTTGGAATTGACAGAGGTGATATACCAGACCTTTCACAGGCCCCTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCAGAGTTCCTCAAAGTTGCAGAGCAAGTTGGAATTGACAGAGGTGATATACCAGACCTTTCACAGGCCCCTA  814

Query  815  GCAGTCTTCTTGATGCTTTGGAACAACATTTAGCTTCCTTGGAAGGAAAGAAAATCAAAGATTCTACAGCTGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGTCTTCTTGATGCTTTGGAACAACATTTAGCTTCCTTGGAAGGAAAGAAAATCAAAGATTCTACAGCTGCA  888

Query  889  AGCAGGGCAACTACACTTTCCAATGCAGTGTCTTCCCTGGCAAGCACTGGTCTATCTCTGACCAAAGTGGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCAGGGCAACTACACTTTCCAATGCAGTGTCTTCCCTGGCAAGCACTGGTCTATCTCTGACCAAAGTGGATGA  962

Query  963  AAGGGAAAAGCAGGCAGCATTAGAGGAAGAACAGGCACGTTTGAAAGCTTTAAAGGAACAGCGCCTAAAAGAAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGGGAAAAGCAGGCAGCATTAGAGGAAGAACAGGCACGTTTGAAAGCTTTAAAGGAACAGCGCCTAAAAGAAC  1036

Query 1037  TTGCAAAGAAACCTCATACCTCTTTAACAACTGCAGCCTCTCCTGTATCCACCTCAGCAGGAGGGATAATGACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGCAAAGAAACCTCATACCTCTTTAACAACTGCAGCCTCTCCTGTATCCACCTCAGCAGGAGGGATAATGACT  1110

Query 1111  GCACCAGCCATTGACATATTTTCTACCCCTAGTTCTTCTAACAGCACATCAAAGCTGCCCAATGATCTGCTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCACCAGCCATTGACATATTTTCTACCCCTAGTTCTTCTAACAGCACATCAAAGCTGCCCAATGATCTGCTTGA  1184

Query 1185  TTTGCAGCAGCCAACTTTTCACCCATCTGTACATCCTATGTCAACTGCTTCTCAGGTAGCAAGTACATGGGGA-  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1185  TTTGCAGCAGCCAACTTTTCACCCATCTGTACATCCTATGTCAACTGCTTCTCAGGTAGCAAGTACATGGGGAG  1258

Query 1258  --------------------------------------------------------------------------  1257
                                                                                      
Sbjct 1259  ATGCTGTTGATGATGCCATTCCAAGCTTAAATCCTTTCCTCACAAAAAGTAGTGGTGATGTTCACCTTTCCATT  1332

Query 1258  ------------------------------------------------------GGATTCACTCCTTCTCCAGT  1277
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCTTCAGATGTATCTACTTTTACTACTAGGACACCTACTCATGAAATGTTTGTTGGATTCACTCCTTCTCCAGT  1406

Query 1278  TGCACAGCCACACCCTTCAGCTGGCCTTAATGTTGACTTTGAATCTGTGTTTGGAAATAAATCTACAAATGTTA  1351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCACAGCCACACCCTTCAGCTGGCCTTAATGTTGACTTTGAATCTGTGTTTGGAAATAAATCTACAAATGTTA  1480

Query 1352  TTGTAGATTCTGGGGGCTTTGATGAACTAGGTGGACTTCTCAAACCAACAGTGGCCTCTCAGAACCAGAACCTT  1425
            ||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTGTAGATTCTGGG---------------GGTGGACTTCTCAAACCAACAGTGGCCTCTCAGAACCAGAACCTT  1539

Query 1426  CCTGTTGCCAAACTCCCACCTAGCAAGTTAGTATCTGATGACTTGGATTCATCTTTAGCCAACCTTGTGGGCAA  1499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540  CCTGTTGCCAAACTCCCACCTAGCAAGTTAGTATCTGATGACTTGGATTCATCTTTAGCCAACCTTGTGGGCAA  1613

Query 1500  TCTTGGCATCGGAAATGGAACCACTAAGAATGATGTAAATTGGAGTCAACCAGGTGAAAAGAAGTTAACTGGGG  1573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614  TCTTGGCATCGGAAATGGAACCACTAAGAATGATGTAAATTGGAGTCAACCAGGTGAAAAGAAGTTAACTGGGG  1687

Query 1574  GATCTAACTGGCAACCAAAGGTTGCACCAACAACCGCTTGGAATGCTGCAACAATGAATGGCATGCATTTTCCA  1647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688  GATCTAACTGGCAACCAAAGGTTGCACCAACAACCGCTTGGAATGCTGCAACAATGAATGGCATGCATTTTCCA  1761

Query 1648  CAATACGCACCCCCTGTAATGGCCTATCCTGCTACTACACCAACAGGCATGATAGGATATGGAATTCCTCCACA  1721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762  CAATACGCACCCCCTGTAATGGCCTATCCTGCTACTACACCAACAGGCATGATAGGATATGGAATTCCTCCACA  1835

Query 1722  AATGGGAAGTGTTCCTGTAATGACGCAACCAACCTTAATATACAGCCAGCCTGTCATGAGACCTCCAAACCCCT  1795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836  AATGGGAAGTGTTCCTGTAATGACGCAACCAACCTTAATATACAGCCAGCCTGTCATGAGACCTCCAAACCCCT  1909

Query 1796  TTGGCCCTGTATCAGGAGCACAGATACAGTTTATG  1830
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1910  TTGGCCCTGTATCAGGAGCACAGATACAGTTTATG  1944