Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01930
- Subject:
- NM_001324376.2
- Aligned Length:
- 2235
- Identities:
- 1842
- Gaps:
- 393
Alignment
Query 1 ATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGATGAAACATGGAACAAACTTTTGACGACAATAAAAGCCGTGGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAACATGGAATGACCGTTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAACTAAGATTTTTTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AGAGTTTTGGAGTCAGAAGAACAAGTACTTGTTATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAGGGTGCAGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAACACCCAGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGTATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGG 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------ATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGG 51
Query 445 AAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTTATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 52 AAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTTATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGG 125
Query 519 AGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 126 AGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAAT 199
Query 593 TCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCTCCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200 TCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCTCCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAA 273
Query 667 GCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCACAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274 GCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCACAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGA 347
Query 741 AATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCATATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 AATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCATATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAG 421
Query 815 CAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTCATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 CAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTCATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAAT 495
Query 889 ATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTTACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496 ATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTTACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGA 569
Query 963 TGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCAGGAAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 TGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCAGGAAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAG 643
Query 1037 TGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTGTTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 TGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTGTTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAG 717
Query 1111 GCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAAGTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 718 GCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAAGTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTG 791
Query 1185 TGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGATGACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 792 TGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGATGACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCA 865
Query 1259 CAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 866 CAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATT 939
Query 1333 CATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGCCATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 940 CATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGCCATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTT 1013
Query 1407 TACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATATGAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014 TACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATATGAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTA 1087
Query 1481 TCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATTAGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088 TCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATTAGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCT 1161
Query 1555 CTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATTCCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162 CTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATTCCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATT 1235
Query 1629 TTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACATGGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236 TTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACATGGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACT 1309
Query 1703 ATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACATACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310 ATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACATACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAA 1383
Query 1777 ACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACTCAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1384 ACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACTCAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATT 1457
Query 1851 ACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1458 ACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATA 1531
Query 1925 TGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAATTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1532 TGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAATTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAG 1605
Query 1999 CAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAATGTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1606 CAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAATGTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACG 1679
Query 2073 AAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGAGGTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 AAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGAGGTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCA 1753
Query 2147 GCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAGACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1754 GCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAGACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAA 1827
Query 2221 TACAGCTACGTCGCG 2235
|||||||||||||||
Sbjct 1828 TACAGCTACGTCGCG 1842