Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_01930
- Subject:
- XM_006526275.3
- Aligned Length:
- 2235
- Identities:
- 2042
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGATGAAACATGGAACAAACTTTTGACGACAATAAAAGCCGTGGT 74
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|.||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 1 ATGTCTTTAAAACCAAGAGTAGTGGATTTTGATGAGACATGGAACAAACTCCTAACTACAATCAAAGCTGTTGT 74
Query 75 CATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAACATGGAATGACCGTTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATC 148
.|||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TATGTTGGAATATGTCGAGCGAGCAACATGGAATGACCGCTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATC 148
Query 149 CTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAACTAAGATTTTTTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAG 222
|||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||.|||||
Sbjct 149 CTGAACCACTTGGAGAAAGACTTTATGCGGAAACAAAGATTTTTTTGGAAAGTCACGTTCGGCATTTGTATAAG 222
Query 223 AGAGTTTTGGAGTCAGAAGAACAAGTACTTGTTATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAGGGTGCAGA 296
||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 223 AGAGTTCTGGAGTCTGAAGAACAAGTGCTTGTTATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAAGGCGCCGA 296
Query 297 CTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAACACCCAGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||||||||.||..|.|
Sbjct 297 CTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAATACCCAGTATATTAAAAAGAATAAATTGACAGAAGCTGATATAC 370
Query 371 AGTATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGG 444
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGTATGGCTATGGTGGAGTAGATATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGG 444
Query 445 AAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTTATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGG 518
||.||.|||||||||||.||||||..||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGTTAATGGTTGAACCCCTTCAGAACATCCTCATCCGGATGCTGCTTCGAGAAATTAAAAATGATCGTGGTGG 518
Query 519 AGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAAT 592
.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAGATCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAAT 592
Query 593 TCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCTCCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAA 666
|.|||||||||||||||||||.|||.||.|.|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 593 TTCCCTTAAAGTTTTATCAGGGAATATTCGTGTCTCCCTTTCTGACTGAAACGGGAGAATATTACAAGCAAGAA 666
Query 667 GCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCACAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGA 740
||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAATTGTTCACAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGA 740
Query 741 AATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCATATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAG 814
||||.|||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 741 AATTAGATGTCGAAAATATTTGCATCCAAGTTCATATACTAAAGTGATTCATGAGTGTCAGCAGCGGATGGTAG 814
Query 815 CAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTCATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAAT 888
||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.|..||.||||..|||||||..||.||.||||||||||||
Sbjct 815 CAGACCACTTACAGTTCTTACATTCAGAGTGCCACAGCATCATTCAGCAAGAGAGGAAGAACGACATGGCAAAT 888
Query 889 ATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTTACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGA 962
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 889 ATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCAGTGGTTTACCTCATATGATTGAGGAGCTGCAGAAACATATCCATGA 962
Query 963 TGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCAGGAAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAG 1036
.||||||||..||||.|||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 963 CGAGGGCCTCAGAGCGACCAGTAACCTTACTCAGGAACATATGCCAACACTATTTGTGGAATCAGTTTTGGAAG 1036
Query 1037 TGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTGTTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAG 1110
|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1037 TACATGGTAAATTCGTTCAACTTATCAACACTGTTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCTTTAGATAAG 1110
Query 1111 GCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAAGTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTG 1184
||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCCTTACATCTGTTGTAAATTACAGAGAACCCAAGTCTGTTTGCAAAGCGCCTGAACTGCTTGCTAAGTACTG 1184
Query 1185 TGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGATGACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCA 1258
|||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||.||||||.||||||||||
Sbjct 1185 TGACAACTTGCTAAAGAAGTCAGCGAAGGGGATGACTGAAAATGAAGTGGAGGACAAGCTCACTAGCTTCATCA 1258
Query 1259 CAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATT 1332
||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 1259 CAGTTTTCAAGTACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAGAAGTTCTATGCAAGAATGCTAGCAAAACGTCTAATT 1332
Query 1333 CATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGCCATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTT 1406
||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CACGGGTTGTCTATGTCTATGGATTCTGAAGAAGCCATGATCAATAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTT 1406
Query 1407 TACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATATGAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTA 1480
||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1407 TACCAGCAAGCTGCATCGAATGTATACAGACATGAGTGTCAGCGCTGATTTGAACAATAAGTTCAACAATTTCA 1480
Query 1481 TCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATTAGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCT 1554
|||.||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCAGAAACCAAGACACCGTGATTGACTTGGGGATTAGTTTCCAAATATATGTTCTTCAGGCTGGTGCGTGGCCT 1554
Query 1555 CTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATTCCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATT 1628
||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1555 CTCACTCAGGCTCCTTCATCTACATTTGCAATTCCCCAAGAGCTAGAGAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTGTT 1628
Query 1629 TTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACATGGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACT 1702
|||||||||.||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTATAGCCAGCATTTCAGTGGACGGAAGCTGACATGGTTGCATTATCTCTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACT 1702
Query 1703 ATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACATACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAA 1776
|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATTTGGGAAAACCATATGTAGCTATGGTTACAACCTACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAA 1776
Query 1777 ACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACTCAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATT 1850
||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACTGTCAGCTACAAAGAACTTCAAGACAGTACCCAGATGAATGAAAAGGAGCTGACCAAAACAATCAAATCATT 1850
Query 1851 ACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATA 1924
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1851 ACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAGGAAGATATCGATGCAGAATCTTCATTTTCATTAAATA 1924
Query 1925 TGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAATTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAG 1998
|||.|||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||.||||.
Sbjct 1925 TGAGCTTCAGCAGTAAGAGAACAAAATTTAAGATTACTACGTCAATGCAGAAGGATACGCCACAAGAACTGGAA 1998
Query 1999 CAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAATGTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACG 2072
||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1999 CAGACTAGAAGTGCTGTAGATGAGGACCGGAAAATGTATCTTCAAGCTGCTATTGTCCGCATCATGAAAGCACG 2072
Query 2073 AAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGAGGTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCA 2146
||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 2073 AAAAGTGCTTCGGCACAACGCCCTCATTCAAGAGGTAATCAGCCAGTCAAGAGCCAGGTTCAATCCCAGTATCA 2146
Query 2147 GCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAGACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAA 2220
||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 2147 GCATGATTAAGAAGTGCATAGAAGTTCTGATAGACAAACAGTACATCGAGCGCAGCCAAGCATCTGCAGATGAA 2220
Query 2221 TACAGCTACGTCGCG 2235
|||||.||||||||.
Sbjct 2221 TACAGTTACGTCGCA 2235