Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01930
• Subject: XM_011519747.1
• Aligned Length: 2235
• Identities: 2235
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGATGAAACATGGAACAAACTTTTGACGACAATAAAAGCCGTGGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTTTGAAACCAAGAGTAGTAGATTTTGATGAAACATGGAACAAACTTTTGACGACAATAAAAGCCGTGGT  74

Query   75  CATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAACATGGAATGACCGTTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATGTTGGAATACGTCGAAAGAGCAACATGGAATGACCGTTTCTCAGATATCTATGCTTTATGTGTGGCCTATC  148

Query  149  CTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAACTAAGATTTTTTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGAACCCCTTGGAGAAAGACTTTATACAGAAACTAAGATTTTTTTGGAAAATCATGTTCGGCATTTGCATAAG  222

Query  223  AGAGTTTTGGAGTCAGAAGAACAAGTACTTGTTATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAGGGTGCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAGTTTTGGAGTCAGAAGAACAAGTACTTGTTATGTATCATAGGTACTGGGAAGAATACAGCAAGGGTGCAGA  296

Query  297  CTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAACACCCAGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATATGGACTGCTTATATAGGTATCTCAACACCCAGTTTATTAAAAAGAATAAATTAACAGAAGCGGACCTTC  370

Query  371  AGTATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTATGGCTATGGTGGTGTAGATATGAATGAACCACTTATGGAAATAGGAGAGCTAGCATTGGATATGTGGAGG  444

Query  445  AAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTTATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAATTGATGGTTGAACCACTTCAGGCCATCCTTATCCGAATGCTGCTCCGAGAAATCAAAAATGATCGTGGTGG  518

Query  519  AGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGACCCAAACCAGAAAGTAATCCATGGGGTTATTAACTCCTTTGTTCATGTTGAACAGTATAAGAAAAAAT  592

Query  593  TCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCTCCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCCCTTAAAGTTTTATCAGGAAATTTTTGAGTCTCCCTTTCTGACTGAAACAGGAGAGTATTACAAACAAGAA  666

Query  667  GCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCACAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTTCAAATTTATTACAAGAATCAAACTGCTCACAGTATATGGAAAAGGTTCTAGGTAGATTAAAAGATGAAGA  740

Query  741  AATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCATATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AATTCGATGTCGAAAATACCTACATCCAAGTTCATATACTAAGGTGATTCATGAATGTCAACAACGAATGGTAG  814

Query  815  CAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTCATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGACCACTTACAGTTTTTACATGCAGAATGTCATAATATAATTCGACAAGAGAAAAAAAATGACATGGCAAAT  888

Query  889  ATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTTACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGTACGTCTTACTCCGTGCTGTGTCCACTGGTTTACCTCATATGATTCAGGAGCTGCAAAACCACATCCATGA  962

Query  963  TGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCAGGAAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAGGGCCTTCGAGCAACCAGCAACCTTACTCAGGAAAACATGCCAACACTATTTGTGGAGTCAGTTTTGGAAG  1036

Query 1037  TGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTGTTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCATGGTAAATTTGTTCAGCTTATCAACACTGTTTTGAATGGTGATCAGCATTTTATGAGTGCGTTGGATAAG  1110

Query 1111  GCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAAGTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCCTTACGTCAGTTGTAAATTACAGAGAACCTAAGTCTGTTTGCAAAGCACCTGAACTGCTTGCTAAGTACTG  1184

Query 1185  TGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGATGACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGACAACTTACTGAAGAAGTCAGCGAAAGGGATGACAGAGAATGAAGTGGAAGACAGGCTCACGAGCTTCATCA  1258

Query 1259  CAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGTGTTCAAATACATTGATGACAAGGACGTCTTTCAAAAGTTCTACGCAAGAATGCTGGCAAAACGTTTAATT  1332

Query 1333  CATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGCCATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CATGGGTTATCCATGTCTATGGACTCTGAAGAAGCCATGATCAACAAATTAAAGCAAGCCTGTGGTTATGAGTT  1406

Query 1407  TACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATATGAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TACCAGCAAGCTACATCGGATGTATACAGATATGAGTGTCAGCGCTGATCTCAACAATAAGTTCAACAATTTTA  1480

Query 1481  TCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATTAGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCAAAAACCAAGACACAGTAATAGATTTGGGAATTAGTTTTCAAATATATGTTCTACAGGCTGGTGCGTGGCCT  1554

Query 1555  CTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATTCCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTTACTCAGGCTCCTTCATCTACGTTTGCAATTCCCCAGGAATTAGAAAAAAGTGTACAGATGTTTGAATTATT  1628

Query 1629  TTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACATGGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTATAGCCAACATTTCAGTGGAAGGAAACTTACATGGTTACATTATCTGTGTACAGGTGAAGTTAAAATGAACT  1702

Query 1703  ATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACATACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATTTGGGCAAACCATATGTAGCCATGGTTACAACATACCAAATGGCAGTTCTTCTTGCCTTTAACAACAGTGAA  1776

Query 1777  ACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACTCAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACTGTCAGTTATAAAGAGCTTCAGGACAGCACTCAGATGAATGAAAAGGAACTGACAAAAACAATCAAATCATT  1850

Query 1851  ACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACTTGATGTGAAAATGATTAACCATGATTCAGAAAAGGAAGATATTGATGCAGAATCTTCGTTTTCATTAAATA  1924

Query 1925  TGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAATTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGAACTTTAGCAGTAAAAGAACAAAATTTAAAATTACTACATCAATGCAGAAAGACACACCACAAGAAATGGAG  1998

Query 1999  CAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAATGTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGACTAGAAGTGCAGTTGATGAGGACCGGAAAATGTATCTCCAAGCTGCTATAGTTCGTATCATGAAAGCACG  2072

Query 2073  AAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGAGGTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AAAAGTGCTTCGGCACAATGCCCTTATTCAAGAGGTGATTAGCCAGTCAAGAGCTAGGTTTAATCCCAGTATCA  2146

Query 2147  GCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAGACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCATGATTAAGAAGTGTATTGAAGTTCTGATAGACAAACAATACATAGAACGCAGCCAGGCGTCGGCAGATGAA  2220

Query 2221  TACAGCTACGTCGCG  2235
            |||||||||||||||
Sbjct 2221  TACAGCTACGTCGCG  2235