Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01945
• Subject: XM_006527853.3
• Aligned Length: 1258
• Identities: 1049
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGAATAGGCACCTCTGGAAGAGCCAACTGTGTGAGATGGTGCAGCCCAGTGGTGGCCCGGCAGCAGATCAGGA  74
            |||||.|.|||||.||||||||.|||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||..||.|||||
Sbjct    1  ATGAACAAGCACCCCTGGAAGAACCAGCTGAGTGAGATGGTGCAGCCCAGTGGTGGCCCAGCAGAGGACCAGGA  74

Query   75  CGTACTGGGCGAAGAGTCTCCTCTGGGGAAGCCAGCCATGCTGCACCTGCCTTCAGAACAGGGCGCTCCTGAGA  148
            |.|.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||..|||||||||
Sbjct   75  CATGCTGGGTGAAGAATCTTCTCTGGGGAAGCCTGCAATGCTACATCTGCCTTCAGAGCAGGGTACTCCTGAGA  148

Query  149  CCCTCCAGCGCTGCCTGGAGGAGAATCAAGAGCTCCGAGATGCCATCCGGCAGAGCAACCAGATTCTGCGGGAG  222
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.
Sbjct  149  CCCTCCAGCGCTGCCTGGAAGAGAATCAAGAGCTCCGAGACGCTATCCGGCAGAGCAATCAGATGCTGAGGGAA  222

Query  223  CGCTGCGAGGAGCTTCTGCATTTCCAAGCCAGCCAGAGGGAGGAGAAGGAGTTCCTCATGTGCAAGTTCCAGGA  296
            |||||.||||||||.|||||||||||.|.|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  223  CGCTGTGAGGAGCTGCTGCATTTCCAGGTCAGCCAGCGGGAGGAGAAGGAGTTCCTTATGTGCAAATTCCAGGA  296

Query  297  GGCCAGGAAACTGGTGGAGAGACTCGGCCTGGAGAAGCTCGATCTGAAGAGGCAGAAGGAGCAGGCTCTGCGGG  370
            .|||.||||.||||||||||||||..||.||||||||||.|||||...|||.||||.|||.|||||..|...||
Sbjct  297  AGCCCGGAAGCTGGTGGAGAGACTGAGCTTGGAGAAGCTTGATCTTCGGAGTCAGAGGGAACAGGCCTTAAAGG  370

Query  371  AGGTGGAGCACCTGAAGAGATGCCAGCAGCAGATGGCTGAGGACAAGGCCTCTGTGAAAGCCCAGGTGACGTCC  444
            ||.|||||||.|||||||.||||   ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  371  AGTTGGAGCAACTGAAGAAATGC---CAACAGATGGCTGAGGACAAGGCCTCTGTGAAAGCTCAGGTGACATCA  441

Query  445  TTGCTCGGGGAGCTGCAGGAGAGCCAGAGTCGCTTGGAGGCTGCCACTAAGGAATGCCAGGCTCTGGAGGGTCG  518
            ||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||..|.||.|||.|.|||||..|
Sbjct  442  TTGCTCGGAGAACTCCAGGAGAGCCAGAGCCGTTTGGAGGCTGCCACCAAGGATCGGCAAGCTTTAGAGGGAAG  515

Query  519  GGCCCGGGCGGCCAGCGAGCAGGCGCGGCAGCTGGAGAGTGAGCGCGAGGCGCTGCAGCAGCAGCACAGCGTGC  592
            |...||.||.|..||.|||||||...|.|||||||||||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  516  GATTCGAGCAGTTAGTGAGCAGGTCAGACAGCTGGAGAGTGAGCGGGAGGTGCTACAGCAGCAGCACAGCGTCC  589

Query  593  AGGTGGACCAGCTGCGCATGCAGGGCCAGAGCGTGGAGGCCGCGCTCCGCATGGAGCGCCAGGCCGCCTCGGAG  666
            ||||||||||||||||.||||||..|||||||||||||||.||..|.||.||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct  590  AGGTGGACCAGCTGCGTATGCAGAACCAGAGCGTGGAGGCTGCCTTGCGAATGGAGCGGCAGGCTGCTTCAGAG  663

Query  667  GAGAAGAGGAAGCTGGCCCAGTTGCAGGTGGCCTATCACCAGCTCTTCCAAGAATACGACAACCACATCAAGAG  740
            ||||||.||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||
Sbjct  664  GAGAAGCGGAAGCTGGCTCAGTTGCAGGCAGCCTATCACCAGCTCTTCCAAGACTACGACAGCCACATTAAGAG  737

Query  741  CAGCGTGGTGGGCAGTGAGCGGAAGCGAGGAATGCAGCTGGAAGATCTCAAACAGCAGCTCCAGCAGGCCGAGG  814
            ||||                  |||   ||.|||||||||||||||||.|..||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  738  CAGC------------------AAG---GGCATGCAGCTGGAAGATCTGAGGCAACAGCTCCAGCAAGCTGAGG  790

Query  815  AGGCCCTGGTGGCCAAACAGGAGGTGATCGATAAGCTGAAGGAGGAGGCCGAGCAGCACAAGATTGTGATGGAG  888
            ||||||||||.|||||||||||..||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  AGGCCCTGGTAGCCAAACAGGAATTGATTGATAAGCTGAAAGAGGAGGCTGAGCAGCACAAGATTGTGATGGAG  864

Query  889  ACCGTTCCGGTGCTGAAGGCCCAGGCGGATATCTACAAGGCGGACTTCCAGGCTGAGAGGCAGGCCCGGGAGAA  962
            ||.||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  865  ACTGTGCCAGTCTTGAAGGCCCAGGCGGATATCTACAAGGCTGACTTCCAAGCTGAGAGGCATGCCCGGGAGAA  938

Query  963  GCTGGCCGAGAAGAAGGAGCTCCTGCAGGAGCAGCTGGAGCAGCTGCAGAGGGAGTACAGCAAACTGAAGGCCA  1036
            |||||..||||||||||||....||||||||||||||||||||||||||.|.||||.||.|||.|||||.|...
Sbjct  939  GCTGGTGGAGAAGAAGGAGTATTTGCAGGAGCAGCTGGAGCAGCTGCAGCGCGAGTTCAACAAGCTGAAAGTTG  1012

Query 1037  GCTGTCAGGAGTCGGCCAGGATCGAGGACATGAGGAAGCGGCATGTCGAGGTCT-CCCAGGCCCCCTTGCCCCC  1109
            ||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|| |.|| |||||.|.||.||.|.|||
Sbjct 1013  GCTGCCATGAGTCAGCCAGGATTGAGGATATGAGGAAGCGGCATGTAGA-GACTCCCCAGCCTCCTTTACTCCC  1085

Query 1110  CGCCCCTGCCTACCTCTCCTCTCCCCTGGCCCTGCCCAGCCAGAGGAGGAGCCCCCCCGAGGAGCCACCTGACT  1183
            .||.||.||..|||.|||||.||...|||||.||.|||.||||.||||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct 1086  TGCTCCAGCTCACCACTCCTTTCATTTGGCCTTGTCCAACCAGCGGAGGAGCCCTCCTGAAGAACCTCCTGACT  1159

Query 1184  TCTGCTGTCCCAAGTGCCAGTATCAGGCCCCTGATATGGACACCCTGCAGATACATGTCATGGAGTGCATTGAG  1257
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1160  TCTGTTGTCCGAAGTGCCAGTATCAGGCTCCTGATATGGACACTCTACAGATACATGTCATGGAGTGCATAGAG  1233