Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_01965
• Subject: NM_001286673.2
• Aligned Length: 849
• Identities: 682
• Gaps: 156

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGCCCCAGCTTTCCCAAGATAACCAAGAGTGCCTCCAGAAACATTTCTCCAGGCCGTCTATATGGACACAGTT  74

Query   1  ----------------------------------------------ATGCGCACGGCGGACGGAGGCGAGCCGG  28
                                                         ||   |||.|...|.|.|||.||.|   
Sbjct  75  TCTGCCCCTGTTCAGGGCTCAGAGATATAATACAGACATTCACCAAAT---CACAGAAAATGAAGGAGACC---  142

Query  29  CCGGGGC--TTCCTCCCCGGCCGG----CAGGGTGGACGGTGGGCTCCAGATGGGATCAGAGCGGATGGAGATG  96
           .|.||||  |||||         |    ||.|               |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143  TCAGGGCTGTTCCT---------GATATCAAG---------------CAGATGGGATCAGAGCGGATGGAGATG  192

Query  97  CGGAAGCGGCAGATGCCCGCCGCCCAGGACACACCAGGCGCCGCCCCAGGCCAGCCCGGAGCGGGGAGTCGCGG  170
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193  CGGAAGCGGCAGATGCCCGCCGCCCAGGACACACCAGGCGCCGCCCCAGGCCAGCCCGGAGCGGGGAGTCGCGG  266

Query 171  GTCCAACGCATGCTGCTTCTGCTGGTGCTGCTGTTGTAGCTGCTCGTGTCTCACTGTTAGAAACCAGGAAGATC  244
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 267  GTCCAACGCATGCTGCTTCTGCTGGTGCTGCTGTTGTAGCTGCTCGTGTCTCACTGTTAGAAACCAGGAAGATC  340

Query 245  AGAGGCCCACAATAGCTTCCCACGAACTCAGAGCAGATCTTCCAACCTGGGAAGAAAGCCCTGCTCCTACTCTG  318
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 341  AGAGGCCCACAATAGCTTCCCACGAACTCAGAGCAGATCTTCCAACCTGGGAAGAAAGCCCTGCTCCTACTCTG  414

Query 319  GAAGAAGTCAACGCCTGGGCTCAGTCATTTGACAAATTAATGGTCACTCCAGCAGGAAGGAATGCATTCCGTGA  392
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415  GAAGAAGTCAACGCCTGGGCTCAGTCATTTGACAAATTAATGGTCACTCCAGCAGGAAGGAATGCATTCCGTGA  488

Query 393  ATTCCTCCGAACAGAATTCAGTGAGGAAAATATGCTCTTCTGGATGGCCTGTGAGGAACTGAAAAAGGAAGCTA  466
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489  ATTCCTCCGAACAGAATTCAGTGAGGAAAATATGCTCTTCTGGATGGCCTGTGAGGAACTGAAAAAGGAAGCTA  562

Query 467  ATAAAAACATTATTGAAGAGAAAGCAAGGATAATCTATGAAGACTACATTTCTATACTTTCTCCTAAGGAGGTG  540
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 563  ATAAAAACATTATTGAAGAGAAAGCAAGGATAATCTATGAAGACTACATTTCTATACTTTCTCCTAAGGAGGTG  636

Query 541  AGCTTAGACTCCCGGGTGAGAGAAGTGATCAACAGAAACATGGTGGAGCCATCCCAACACATATTCGATGATGC  614
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637  AGCTTAGACTCCCGGGTGAGAGAAGTGATCAACAGAAACATGGTGGAGCCATCCCAACACATATTCGATGATGC  710

Query 615  TCAACTTCAGATTTACACCCTGATGCACAGAGACTCATATCCTCGATTCATGAACTCTGCTGTCTATAAGGACT  688
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711  TCAACTTCAGATTTACACCCTGATGCACAGAGACTCATATCCTCGATTCATGAACTCTGCTGTCTATAAGGACT  784

Query 689  TGCTTCAGTCCTTATCGGAGAAATCTATTGAAGCA  723
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 785  TGCTTCAGTCCTTATCGGAGAAATCTATTGAAGCA  819