Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02026
- Subject:
- NM_001024628.2
- Aligned Length:
- 1932
- Identities:
- 1827
- Gaps:
- 105
Alignment
Query 1 ATGGAGAGGGGGCTGCCGCTCCTCTGCGCCGTGCTCGCCCTCGTCCTCGCCCCGGCCGGCGCTTTTCGCAACGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAGGGGGCTGCCGCTCCTCTGCGCCGTGCTCGCCCTCGTCCTCGCCCCGGCCGGCGCTTTTCGCAACGA 74
Query 75 TAAATGTGGCGATACTATAAAAATTGAAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTTATCCTCATTCTTATCACC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TAAATGTGGCGATACTATAAAAATTGAAAGCCCCGGGTACCTTACATCTCCTGGTTATCCTCATTCTTATCACC 148
Query 149 CAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCATACCAGAGAATTATGATCAACTTCAACCCTCAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAAGTGAAAAATGCGAATGGCTGATTCAGGCTCCGGACCCATACCAGAGAATTATGATCAACTTCAACCCTCAC 222
Query 223 TTCGATTTGGAGGACAGAGACTGCAAGTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAATGAAAATGGACATTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCGATTTGGAGGACAGAGACTGCAAGTATGACTACGTGGAAGTCTTCGATGGAGAAAATGAAAATGGACATTT 296
Query 297 TAGGGGAAAGTTCTGTGGAAAGATAGCCCCTCCTCCTGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAGGGGAAAGTTCTGTGGAAAGATAGCCCCTCCTCCTGTTGTGTCTTCAGGGCCATTTCTTTTTATCAAATTTG 370
Query 371 TCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTCTGACTACGAAACACATGGTGCAGGATTTTCCATACGTTATGAAATTTTCAAGAGAGGTCCTGAATGTTCC 444
Query 445 CAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAGAACTACACAACACCTAGTGGAGTGATAAAGTCCCCCGGATTCCCTGAAAAATATCCCAACAGCCTTGAATG 518
Query 519 CACTTATATTGTCTTTGCGCCAAAGATGTCAGAGATTATCCTGGAATTTGAAAGCTTTGACCTGGAGCCTGACT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACTTATATTGTCTTTGCGCCAAAGATGTCAGAGATTATCCTGGAATTTGAAAGCTTTGACCTGGAGCCTGACT 592
Query 593 CAAATCCTCCAGGGGGGATGTTCTGTCGCTACGACCGGCTAGAAATCTGGGATGGATTCCCTGATGTTGGCCCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAAATCCTCCAGGGGGGATGTTCTGTCGCTACGACCGGCTAGAAATCTGGGATGGATTCCCTGATGTTGGCCCT 666
Query 667 CACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCCTCATCGGGCATTCTCTCCATGGTTTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CACATTGGGCGTTACTGTGGACAGAAAACACCAGGTCGAATCCGATCCTCATCGGGCATTCTCTCCATGGTTTT 740
Query 741 TTACACCGACAGCGCGATAGCAAAAGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCAGAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTACACCGACAGCGCGATAGCAAAAGAAGGTTTCTCAGCAAACTACAGTGTCTTGCAGAGCAGTGTCTCAGAAG 814
Query 815 ATTTCAAATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAAATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATTTCAAATGTATGGAAGCTCTGGGCATGGAATCAGGAGAAATTCATTCTGACCAGATCACAGCTTCTTCCCAG 888
Query 889 TATAGCACCAACTGGTCTGCAGAGCGCTCCCGCCTGAACTACCCTGAGAATGGGTGGACTCCCGGAGAGGATTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATAGCACCAACTGGTCTGCAGAGCGCTCCCGCCTGAACTACCCTGAGAATGGGTGGACTCCCGGAGAGGATTC 962
Query 963 CTACCGAGAGTGGATACAGGTAGACTTGGGCCTTCTGCGCTTTGTCACGGCTGTCGGGACACAGGGCGCCATTT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTACCGAGAGTGGATACAGGTAGACTTGGGCCTTCTGCGCTTTGTCACGGCTGTCGGGACACAGGGCGCCATTT 1036
Query 1037 CAAAAGAAACCAAGAAGAAATATTATGTCAAGACTTACAAGATCGACGTTAGCTCCAACGGGGAAGACTGGATC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAAAAGAAACCAAGAAGAAATATTATGTCAAGACTTACAAGATCGACGTTAGCTCCAACGGGGAAGACTGGATC 1110
Query 1111 ACCATAAAAGAAGGAAACAAACCTGTTCTCTTTCAGGGAAACACCAACCCCACAGATGTTGTGGTTGCAGTATT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACCATAAAAGAAGGAAACAAACCTGTTCTCTTTCAGGGAAACACCAACCCCACAGATGTTGTGGTTGCAGTATT 1184
Query 1185 CCCCAAACCACTGATAACTCGATTTGTCCGAATCAAGCCTGCAACTTGGGAAACTGGCATATCTATGAGATTTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCCCAAACCACTGATAACTCGATTTGTCCGAATCAAGCCTGCAACTTGGGAAACTGGCATATCTATGAGATTTG 1258
Query 1259 AAGTATACGGTTGCAAGATAACAGATTATCCTTGCTCTGGAATGTTGGGTATGGTGTCTGGACTTATTTCTGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGTATACGGTTGCAAGATAACAGATTATCCTTGCTCTGGAATGTTGGGTATGGTGTCTGGACTTATTTCTGAC 1332
Query 1333 TCCCAGATCACATCATCCAACCAAGGGGACAGAAACTGGATGCCTGAAAACATCCGCCTGGTAACCAGTCGCTC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCCCAGATCACATCATCCAACCAAGGGGACAGAAACTGGATGCCTGAAAACATCCGCCTGGTAACCAGTCGCTC 1406
Query 1407 TGGCTGGGCACTTCCACCCGCACCTCATTCCTACATCAATGAGTGGCTCCAAATAGACCTGGGGGAGGAGAAGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGGCTGGGCACTTCCACCCGCACCTCATTCCTACATCAATGAGTGGCTCCAAATAGACCTGGGGGAGGAGAAGA 1480
Query 1481 TCGTGAGGGGCATCATCATTCAGGGTGGGAAGCACCGAGAGAACAAGGTGTTCATGAGGAAGTTCAAGATCGGG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCGTGAGGGGCATCATCATTCAGGGTGGGAAGCACCGAGAGAACAAGGTGTTCATGAGGAAGTTCAAGATCGGG 1554
Query 1555 TACAGCAACAACGGCTCGGACTGGAAGATGATCATGGATGACAGCAAACGCAAGGCGAAGTCTTTTGAGGGCAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TACAGCAACAACGGCTCGGACTGGAAGATGATCATGGATGACAGCAAACGCAAGGCGAAGTCTTTTGAGGGCAA 1628
Query 1629 CAACAACTATGATACACCTGAGCTGCGGACTTTTCCAGCTCTCTCCACGCGATTCATCAGGATCTACCCCGAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAACAACTATGATACACCTGAGCTGCGGACTTTTCCAGCTCTCTCCACGCGATTCATCAGGATCTACCCCGAGA 1702
Query 1703 GAGCCACTCATGGCGGACTGGGGCTCAGAATGGAGCTGCTGGGCTGTGAAGTGGA------------------- 1757
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GAGCCACTCATGGCGGACTGGGGCTCAGAATGGAGCTGCTGGGCTGTGAAGTGGAAGCCCCTACAGCTGGACCG 1776
Query 1758 -------------------------------------------------------------------------- 1757
Sbjct 1777 ACCACTCCCAACGGGAACTTGGTGGATGAATGTGATGACGACCAGGCCAACTGCCACAGTGGAACAGGTGATGA 1850
Query 1758 ------------AGGTGGCACCACTGTGCTGGCCACAGAAAAGCCCACGGTCATAGACAGCACCATACAATCAG 1819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTTCCAGCTCACAGGTGGCACCACTGTGCTGGCCACAGAAAAGCCCACGGTCATAGACAGCACCATACAATCAG 1924
Query 1820 GTATCAAA 1827
||||||||
Sbjct 1925 GTATCAAA 1932