Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_02030
- Subject:
- NM_001202519.3
- Aligned Length:
- 1449
- Identities:
- 1070
- Gaps:
- 360
Alignment
Query 1 ATGTCTGCTGAAGTCATCCATCAGGTTGAAGAAGCACTTGATACAGATGAGAAGGAGATGCTGCTCTTTTTGTG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCGGGATGTTGCTATAGATGTGGTTCCACCTAATGTCAGGGACCTTCTGGATATTTTACGGGAAAGAGGTAAGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGTCTGTCGGGGACTTGGCTGAACTGCTCTACAGAGTGAGGCGATTTGACCTGCTCAAACGTATCTTGAAGATG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GACAGAAAAGCTGTGGAGACCCACCTGCTCAGGAACCCTCACCTTGTTTCGGACTATAGAGTGCTGATGGCAGA 296
||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------ATGGCAGA 8
Query 297 GATTGGTGAGGATTTGGATAAATCTGATGTGTCCTCATTAATTTTCCTCATGAAGGATTACATGGGCCGAGGCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 GATTGGTGAGGATTTGGATAAATCTGATGTGTCCTCATTAATTTTCCTCATGAAGGATTACATGGGCCGAGGCA 82
Query 371 AGATAAGCAAGGAGAAGAGTTTCTTGGACCTTGTGGTTGAGTTGGAGAAACTAAATCTGGTTGCCCCAGATCAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 83 AGATAAGCAAGGAGAAGAGTTTCTTGGACCTTGTGGTTGAGTTGGAGAAACTAAATCTGGTTGCCCCAGATCAA 156
Query 445 CTGGATTTATTAGAAAAATGCCTAAAGAACATCCACAGAATAGACCTGAAGACAAAAATCCAGAAGTACAAGCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 CTGGATTTATTAGAAAAATGCCTAAAGAACATCCACAGAATAGACCTGAAGACAAAAATCCAGAAGTACAAGCA 230
Query 519 GTCTGTTCAAGGAGCAGGGACAAGTTACAGGAATGTTCTCCAAGCAGCAATCCAAAAGAGTCTCAAGGATCCTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 231 GTCTGTTCAAGGAGCAGGGACAAGTTACAGGAATGTTCTCCAAGCAGCAATCCAAAAGAGTCTCAAGGATCCTT 304
Query 593 CAAATAACTTCAGGCTCCATAATGGGAGAAGTAAAGAACAAAGACTTAAGGAACAGCTTGGCGCTCAACAAGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 CAAATAACTTCAGGCTCCATAATGGGAGAAGTAAAGAACAAAGACTTAAGGAACAGCTTGGCGCTCAACAAGAA 378
Query 667 CCAGTGAAGAAATCCATTCAGGAATCAGAAGCTTTTTTGCCTCAGAGCATACCTGAAGAGAGATACAAGATGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 379 CCAGTGAAGAAATCCATTCAGGAATCAGAAGCTTTTTTGCCTCAGAGCATACCTGAAGAGAGATACAAGATGAA 452
Query 741 GAGCAAGCCCCTAGGAATCTGCCTGATAATCGATTGCATTGGCAATGAGACAGAGCTTCTTCGAGACACCTTCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 GAGCAAGCCCCTAGGAATCTGCCTGATAATCGATTGCATTGGCAATGAGACAGAGCTTCTTCGAGACACCTTCA 526
Query 815 CTTCCCTGGGCTATGAAGTCCAGAAATTCTTGCATCTCAGTATGCATGGTATATCCCAGATTCTTGGCCAATTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 CTTCCCTGGGCTATGAAGTCCAGAAATTCTTGCATCTCAGTATGCATGGTATATCCCAGATTCTTGGCCAATTT 600
Query 889 GCCTGTATGCCCGAGCACCGAGACTACGACAGCTTTGTGTGTGTCCTGGTGAGCCGAGGAGGCTCCCAGAGTGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GCCTGTATGCCCGAGCACCGAGACTACGACAGCTTTGTGTGTGTCCTGGTGAGCCGAGGAGGCTCCCAGAGTGT 674
Query 963 GTATGGTGTGGATCAGACTCACTCAGGGCTCCCCCTGCATCACATCAGGAGGATGTTCATGGGAGATTCATGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 675 GTATGGTGTGGATCAGACTCACTCAGGGCTCCCCCTGCATCACATCAGGAGGATGTTCATGGGAGATTCATGCC 748
Query 1037 CTTATCTAGCAGGGAAGCCAAAGATGTTTTTTATTCAGAACTATGTGGTGTCAGAGGGCCAGCTGGAGGACAGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 CTTATCTAGCAGGGAAGCCAAAGATGTTTTTTATTCAGAACTATGTGGTGTCAGAGGGCCAGCTGGAGGACAGC 822
Query 1111 AGCCTCTTGGAGGTGGATGGGCCAGCGATGAAGAATGTGGAATTCAAGGCTCAGAAGCGAGGGCTGTGCACAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 823 AGCCTCTTGGAGGTGGATGGGCCAGCGATGAAGAATGTGGAATTCAAGGCTCAGAAGCGAGGGCTGTGCACAGT 896
Query 1185 TCACCGAGAAGCTGACTTCTTCTGGAGCCTGTGTACTGCGGACATGTCCCTGCTGGAGCAGTCTCACAGCTCAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 TCACCGAGAAGCTGACTTCTTCTGGAGCCTGTGTACTGCGGACATGTCCCTGCTGGAGCAGTCTCACAGCTCAC 970
Query 1259 CATCCCTGTACCTGCAGTGCCTCTCCCAGAAACTGAGACAAGAAA----GAAAACGCCCACTCCTGGATCTTCA 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |.|.|||.|||
Sbjct 971 CATCCCTGTACCTGCAGTGCCTCTCCCAGAAACTGAGACAAGAAAGGGGGA------CAATTCCCGGA------ 1032
Query 1329 CATTGAACTCAATGGCTACATGTATGATTGGAACAGCAGAGTTTCTGCCAAGGAGAAATATT----ATGTCT-G 1397
|.|||||...|||||| |.|||||.|...||| |.|.|| |
Sbjct 1033 --------------------------AGTGGAATTACAGAGT-----CAAAGGACATGCATTTTTCAAGCCTCG 1075
Query 1398 GCTGCAGCACACTCTGAGAAAGAAACTTATCCTCTCCTACACA 1440
|.||||.|..||| ||| |.|||||
Sbjct 1076 GATGCATCTTACT---AGA-------------TGTCCTA---- 1098