Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_02030
• Subject: NM_001308042.3
• Aligned Length: 1449
• Identities: 1358
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGTCTGCTGAAGTCATCCATCAGGTTGAAGAAGCACTTGATACAGATGAGAAGGAGATGCTGCTCTTTTTGTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGCTGAAGTCATCCATCAGGTTGAAGAAGCACTTGATACAGATGAGAAGGAGATGCTGCTCTTTTTGTG  74

Query   75  CCGGGATGTTGCTATAGATGTGGTTCCACCTAATGTCAGGGACCTTCTGGATATTTTACGGGAAAGAGGTAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGGATGTTGCTATAGATGTGGTTCCACCTAATGTCAGGGACCTTCTGGATATTTTACGGGAAAGAGGTAAGC  148

Query  149  TGTCTGTCGGGGACTTGGCTGAACTGCTCTACAGAGTGAGGCGATTTGACCTGCTCAAACGTATCTTGAAGATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTCTGTCGGGGACTTGGCTGAACTGCTCTACAGAGTGAGGCGATTTGACCTGCTCAAACGTATCTTGAAGATG  222

Query  223  GACAGAAAAGCTGTGGAGACCCACCTGCTCAGGAACCCTCACCTTGTTTCGGACTATAGAGTGCTGATGGCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAGAAAAGCTGTGGAGACCCACCTGCTCAGGAACCCTCACCTTGTTTCGGACTATAGAGTGCTGATGGCAGA  296

Query  297  GATTGGTGAGGATTTGGATAAATCTGATGTGTCCTCATTAATTTTCCTCATGAAGGATTACATGGGCCGAGGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATTGGTGAGGATTTGGATAAATCTGATGTGTCCTCATTAATTTTCCTCATGAAGGATTACATGGGCCGAGGCA  370

Query  371  AGATAAGCAAGGAGAAGAGTTTCTTGGACCTTGTGGTTGAGTTGGAGAAACTAAATCTGGTTGCCCCAGATCAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGATAAGCAAGGAGAAGAGTTTCTTGGACCTTGTGGTTGAGTTGGAGAAACTAAATCTGGTTGCCCCAGATCAA  444

Query  445  CTGGATTTATTAGAAAAATGCCTAAAGAACATCCACAGAATAGACCTGAAGACAAAAATCCAGAAGTACAAGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGATTTATTAGAAAAATGCCTAAAGAACATCCACAGAATAGACCTGAAGACAAAAATCCAGAAGTACAAGCA  518

Query  519  GTCTGTTCAAGGAGCAGGGACAAGTTACAGGAATGTTCTCCAAGCAGCAATCCAAAAGAGTCTCAAGGATCCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCTGTTCAAGGAGCAGGGACAAGTTACAGGAATGTTCTCCAAGCAGCAATCCAAAAGAGTCTCAAGGATCCTT  592

Query  593  CAAATAACTTCAGGCTCCATAATGGGAGAAGTAAAGAACAAAGACTTAAGGAACAGCTTGGCGCTCAACAAGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAAATAACTTCAGGCTCCATAATGGGAGAAGTAAAGAACAAAGACTTAAGGAACAGCTTGGCGCTCAACAAGAA  666

Query  667  CCAGTGAAGAAATCCATTCAGGAATCAGAAGCTTTTTTGCCTCAGAGCATACCTGAAGAGAGATACAAGATGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCAGTGAAGAAATCCATTCAGGAATCAGAAGCTTTTTTGCCTCAGAGCATACCTGAAGAGAGATACAAGATGAA  740

Query  741  GAGCAAGCCCCTAGGAATCTGCCTGATAATCGATTGCATTGGCAATGAGACAGAGCTTCTTCGAGACACCTTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGCAAGCCCCTAGGAATCTGCCTGATAATCGATTGCATTGGCAATGAGACAGAGCTTCTTCGAGACACCTTCA  814

Query  815  CTTCCCTGGGCTATGAAGTCCAGAAATTCTTGCATCTCAGTATGCATGGTATATCCCAGATTCTTGGCCAATTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTCCCTGGGCTATGAAGTCCAGAAATTCTTGCATCTCAGTATGCATGGTATATCCCAGATTCTTGGCCAATTT  888

Query  889  GCCTGTATGCCCGAGCACCGAGACTACGACAGCTTTGTGTGTGTCCTGGTGAGCCGAGGAGGCTCCCAGAGTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCTGTATGCCCGAGCACCGAGACTACGACAGCTTTGTGTGTGTCCTGGTGAGCCGAGGAGGCTCCCAGAGTGT  962

Query  963  GTATGGTGTGGATCAGACTCACTCAGGGCTCCCCCTGCATCACATCAGGAGGATGTTCATGGGAGATTCATGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTATGGTGTGGATCAGACTCACTCAGGGCTCCCCCTGCATCACATCAGGAGGATGTTCATGGGAGATTCATGCC  1036

Query 1037  CTTATCTAGCAGGGAAGCCAAAGATGTTTTTTATTCAGAACTATGTGGTGTCAGAGGGCCAGCTGGAGGACAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTATCTAGCAGGGAAGCCAAAGATGTTTTTTATTCAGAACTATGTGGTGTCAGAGGGCCAGCTGGAGGACAGC  1110

Query 1111  AGCCTCTTGGAGGTGGATGGGCCAGCGATGAAGAATGTGGAATTCAAGGCTCAGAAGCGAGGGCTGTGCACAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCCTCTTGGAGGTGGATGGGCCAGCGATGAAGAATGTGGAATTCAAGGCTCAGAAGCGAGGGCTGTGCACAGT  1184

Query 1185  TCACCGAGAAGCTGACTTCTTCTGGAGCCTGTGTACTGCGGACATGTCCCTGCTGGAGCAGTCTCACAGCTCAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCACCGAGAAGCTGACTTCTTCTGGAGCCTGTGTACTGCGGACATGTCCCTGCTGGAGCAGTCTCACAGCTCAC  1258

Query 1259  CATCCCTGTACCTGCAGTGCCTCTCCCAGAAACTGAGACAAGAAA----GAAAACGCCCACTCCTGGATCTTCA  1328
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||      |.|.|||.|||      
Sbjct 1259  CATCCCTGTACCTGCAGTGCCTCTCCCAGAAACTGAGACAAGAAAGGGGGA------CAATTCCCGGA------  1320

Query 1329  CATTGAACTCAATGGCTACATGTATGATTGGAACAGCAGAGTTTCTGCCAAGGAGAAATATT----ATGTCT-G  1397
                                      |.|||||...||||||     |.|||||.|...|||    |.|.|| |
Sbjct 1321  --------------------------AGTGGAATTACAGAGT-----CAAAGGACATGCATTTTTCAAGCCTCG  1363

Query 1398  GCTGCAGCACACTCTGAGAAAGAAACTTATCCTCTCCTACACA  1440
            |.||||.|..|||   |||             |.|||||    
Sbjct 1364  GATGCATCTTACT---AGA-------------TGTCCTA----  1386